RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550632.5

USP15-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 3

Gene USP15, Length 728 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-216ENST00000550632 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.31■■■■□ 3.72
USP15-216ENST00000550632 ABCC9O60706 1549 aa35.78■■■■□ 3.32
USP15-216ENST00000550632 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.68■■■■□ 3.14
USP15-216ENST00000550632 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.43■■■■□ 3.1
USP15-216ENST00000550632 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.51■■■□□ 2.95
USP15-216ENST00000550632 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.22■■■□□ 2.91
USP15-216ENST00000550632 NACADO15069 1562 aa33.03■■■□□ 2.88
USP15-216ENST00000550632 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.92■■■□□ 2.86
USP15-216ENST00000550632 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.79■■■□□ 2.84
USP15-216ENST00000550632 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.63■■■□□ 2.81
USP15-216ENST00000550632 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.27■■■□□ 2.76
USP15-216ENST00000550632 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.2■■■□□ 2.75
USP15-216ENST00000550632 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.2■■■□□ 2.74
USP15-216ENST00000550632 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.18■■■□□ 2.74
USP15-216ENST00000550632 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.91■■■□□ 2.7
USP15-216ENST00000550632 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
USP15-216ENST00000550632 SCRIBQ14160 1630 aa31.71■■■□□ 2.67
USP15-216ENST00000550632 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
USP15-216ENST00000550632 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.48■■■□□ 2.63
USP15-216ENST00000550632 CUX2O14529 1486 aa31.07■■■□□ 2.56
USP15-216ENST00000550632 ERCC6Q03468 1493 aa30.9■■■□□ 2.54
USP15-216ENST00000550632 NCAPD3P42695 1498 aa30.54■■■□□ 2.48
USP15-216ENST00000550632 TRIM41Q8WV44 630 aa30.52■■■□□ 2.48
USP15-216ENST00000550632 NESP48681 1621 aa30.48■■■□□ 2.47
USP15-216ENST00000550632 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.36■■■□□ 2.45
USP15-216ENST00000550632 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
USP15-216ENST00000550632 HMGXB3Q12766 1538 aa30.2■■■□□ 2.42
USP15-216ENST00000550632 SMARCA2P51531 1590 aa30.15■■■□□ 2.42
USP15-216ENST00000550632 SMARCA4P51532 1647 aa30.08■■■□□ 2.41
USP15-216ENST00000550632 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.4
USP15-216ENST00000550632 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.99■■■□□ 2.39
USP15-216ENST00000550632 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.97■■■□□ 2.39
USP15-216ENST00000550632 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.86■■■□□ 2.37
USP15-216ENST00000550632 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
USP15-216ENST00000550632 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.72■■■□□ 2.35
USP15-216ENST00000550632 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.68■■■□□ 2.34
USP15-216ENST00000550632 WDR62O43379 1518 aa29.61■■■□□ 2.33
USP15-216ENST00000550632 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.6■■■□□ 2.33
USP15-216ENST00000550632 OSCARQ8IYS5 282 aa29.57■■■□□ 2.32
USP15-216ENST00000550632 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.56■■■□□ 2.32
USP15-216ENST00000550632 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.38■■■□□ 2.29
USP15-216ENST00000550632 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.3■■■□□ 2.28
USP15-216ENST00000550632 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.3■■■□□ 2.28
USP15-216ENST00000550632 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.3■■■□□ 2.28
USP15-216ENST00000550632 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.29■■■□□ 2.28
USP15-216ENST00000550632 WIZO95785 1651 aa29.18■■■□□ 2.26
USP15-216ENST00000550632 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
USP15-216ENST00000550632 ARHGEF11O15085 1522 aa29.1■■■□□ 2.25
USP15-216ENST00000550632 CFTRP13569 1480 aa29.04■■■□□ 2.24
USP15-216ENST00000550632 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.02■■■□□ 2.24
USP15-216ENST00000550632 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
USP15-216ENST00000550632 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.23
USP15-216ENST00000550632 IFT140Q96RY7 1462 aa28.8■■■□□ 2.2
USP15-216ENST00000550632 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
USP15-216ENST00000550632 ARAP1Q96P48 1450 aa28.78■■■□□ 2.2
USP15-216ENST00000550632 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
USP15-216ENST00000550632 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
USP15-216ENST00000550632 CHD1O14646 1710 aa28.66■■■□□ 2.18
USP15-216ENST00000550632 TOPBP1Q92547 1522 aa28.63■■■□□ 2.17
USP15-216ENST00000550632 FBLN2P98095 1184 aa28.62■■■□□ 2.17
USP15-216ENST00000550632 PRDM2Q13029 1718 aa28.62■■■□□ 2.17
USP15-216ENST00000550632 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
USP15-216ENST00000550632 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.58■■■□□ 2.171e-8■■■■□ 20.4
USP15-216ENST00000550632 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
USP15-216ENST00000550632 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.41■■■□□ 2.14
USP15-216ENST00000550632 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.41■■■□□ 2.14
USP15-216ENST00000550632 ABCC8Q09428 1581 aa28.4■■■□□ 2.14
USP15-216ENST00000550632 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.28■■■□□ 2.12
USP15-216ENST00000550632 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
USP15-216ENST00000550632 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.27■■■□□ 2.12
USP15-216ENST00000550632 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.12
USP15-216ENST00000550632 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.22■■■□□ 2.11
USP15-216ENST00000550632 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
USP15-216ENST00000550632 SYNJ1O43426 1573 aa28.15■■■□□ 2.1
USP15-216ENST00000550632 SOGA1O94964 1423 aa28.14■■■□□ 2.1
USP15-216ENST00000550632 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.08■■■□□ 2.09
USP15-216ENST00000550632 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
USP15-216ENST00000550632 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.99■■■□□ 2.07
USP15-216ENST00000550632 SYNJ2O15056 1496 aa27.97■■■□□ 2.07
USP15-216ENST00000550632 GRIN2BQ13224 1484 aa27.96■■■□□ 2.07
USP15-216ENST00000550632 WDR97A6NE52 1622 aa27.93■■■□□ 2.06
USP15-216ENST00000550632 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.87■■■□□ 2.05
USP15-216ENST00000550632 CUX1P39880 1505 aa27.82■■■□□ 2.04
USP15-216ENST00000550632 PBRM1Q86U86 1689 aa27.8■■■□□ 2.04
USP15-216ENST00000550632 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
USP15-216ENST00000550632 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.69■■■□□ 2.02
USP15-216ENST00000550632 CEP170Q5SW79 1584 aa27.67■■■□□ 2.02
USP15-216ENST00000550632 GRIN2AQ12879 1464 aa27.62■■■□□ 2.01
USP15-216ENST00000550632 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.6■■■□□ 2.01
USP15-216ENST00000550632 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.56■■■□□ 2
USP15-216ENST00000550632 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.56■■■□□ 2
USP15-216ENST00000550632 NUP160Q12769 1436 aa27.55■■■□□ 2
USP15-216ENST00000550632 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.51■■□□□ 1.99
USP15-216ENST00000550632 SHROOM2Q13796 1616 aa27.51■■□□□ 1.99
USP15-216ENST00000550632 ADAMTS12P58397 1594 aa27.48■■□□□ 1.99
USP15-216ENST00000550632 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.42■■□□□ 1.98
USP15-216ENST00000550632 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
USP15-216ENST00000550632 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.35■■□□□ 1.97
USP15-216ENST00000550632 KDM6BO15054 1643 aa27.34■■□□□ 1.97
USP15-216ENST00000550632 DIP2BQ9P265 1576 aa27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.1 ms