RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550292.1

LINC00941-202, long intergenic non-protein coding RNA 941, humanhuman

TSL 2

Gene LINC00941, Length 632 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00941-202ENST00000550292 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.85■■■■■ 5.89
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LINC00941-202ENST00000550292 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.89■■■■□ 3.82
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LINC00941-202ENST00000550292 IFT140Q96RY7 1462 aa38.18■■■■□ 3.7
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LINC00941-202ENST00000550292 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.66■■■■□ 3.62
LINC00941-202ENST00000550292 SOGA1O94964 1423 aa37.61■■■■□ 3.61
LINC00941-202ENST00000550292 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.58■■■■□ 3.61
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LINC00941-202ENST00000550292 ARHGEF11O15085 1522 aa37.56■■■■□ 3.6
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LINC00941-202ENST00000550292 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.53■■■■□ 3.6
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LINC00941-202ENST00000550292 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.15■■■■□ 3.54
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LINC00941-202ENST00000550292 ADAMTS12P58397 1594 aa36.78■■■■□ 3.48
LINC00941-202ENST00000550292 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.71■■■■□ 3.47
LINC00941-202ENST00000550292 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.71■■■■□ 3.47
LINC00941-202ENST00000550292 NUP160Q12769 1436 aa36.68■■■■□ 3.46
LINC00941-202ENST00000550292 CEP170Q5SW79 1584 aa36.64■■■■□ 3.46
LINC00941-202ENST00000550292 SHROOM2Q13796 1616 aa36.52■■■■□ 3.44
LINC00941-202ENST00000550292 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.5■■■■□ 3.43
LINC00941-202ENST00000550292 JPH4Q96JJ6 628 aa36.3■■■■□ 3.4
LINC00941-202ENST00000550292 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.3■■■■□ 3.4
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LINC00941-202ENST00000550292 KIF27Q86VH2 1401 aa36.25■■■■□ 3.39
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