RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549602.1

ARHGAP9-211, Transcript of Rho GTPase activating protein 9, humanhuman

TSL 4

Gene ARHGAP9, Length 563 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP9-211ENST00000549602 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.47■■■■■ 5.51
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ARHGAP9-211ENST00000549602 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.58■■■■■ 4.25
ARHGAP9-211ENST00000549602 NACADO15069 1562 aa41.48■■■■■ 4.23
ARHGAP9-211ENST00000549602 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.21■■■■■ 4.19
ARHGAP9-211ENST00000549602 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.19■■■■■ 4.18
ARHGAP9-211ENST00000549602 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.18■■■■■ 4.18
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ARHGAP9-211ENST00000549602 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.78■■■■■ 4.12
ARHGAP9-211ENST00000549602 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.46■■■■■ 4.07
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ARHGAP9-211ENST00000549602 SMARCA2P51531 1590 aa38.19■■■■□ 3.7
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ARHGAP9-211ENST00000549602 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.13■■■■□ 3.69
ARHGAP9-211ENST00000549602 HMGXB3Q12766 1538 aa38.11■■■■□ 3.69
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ARHGAP9-211ENST00000549602 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.05■■■■□ 3.52
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ARHGAP9-211ENST00000549602 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.83■■■■□ 3.49
ARHGAP9-211ENST00000549602 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.7■■■■□ 3.47
ARHGAP9-211ENST00000549602 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.69■■■■□ 3.46
ARHGAP9-211ENST00000549602 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.67■■■■□ 3.46
ARHGAP9-211ENST00000549602 PRDM2Q13029 1718 aa36.66■■■■□ 3.46
ARHGAP9-211ENST00000549602 WDR62O43379 1518 aa36.64■■■■□ 3.46
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ARHGAP9-211ENST00000549602 TOPBP1Q92547 1522 aa36.13■■■■□ 3.37
ARHGAP9-211ENST00000549602 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.06■■■■□ 3.36
ARHGAP9-211ENST00000549602 ABCC8Q09428 1581 aa36.03■■■■□ 3.36
ARHGAP9-211ENST00000549602 IFT140Q96RY7 1462 aa35.92■■■■□ 3.34
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ARHGAP9-211ENST00000549602 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.64■■■■□ 3.3
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ARHGAP9-211ENST00000549602 TOP2BQ02880 1626 aa35.42■■■■□ 3.26
ARHGAP9-211ENST00000549602 SYNJ1O43426 1573 aa35.42■■■■□ 3.26
ARHGAP9-211ENST00000549602 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.39■■■■□ 3.26
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ARHGAP9-211ENST00000549602 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.32■■■■□ 3.25
ARHGAP9-211ENST00000549602 CHD1O14646 1710 aa35.3■■■■□ 3.24
ARHGAP9-211ENST00000549602 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.26■■■■□ 3.24
ARHGAP9-211ENST00000549602 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.22■■■■□ 3.23
ARHGAP9-211ENST00000549602 GRIN2BQ13224 1484 aa35.22■■■■□ 3.23
ARHGAP9-211ENST00000549602 PBRM1Q86U86 1689 aa35.21■■■■□ 3.23
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ARHGAP9-211ENST00000549602 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.99■■■■□ 3.19
ARHGAP9-211ENST00000549602 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.99■■■■□ 3.19
ARHGAP9-211ENST00000549602 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.94■■■■□ 3.18
ARHGAP9-211ENST00000549602 ARHGEF11O15085 1522 aa34.93■■■■□ 3.18
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ARHGAP9-211ENST00000549602 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.91■■■■□ 3.18
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ARHGAP9-211ENST00000549602 GRIN2AQ12879 1464 aa34.8■■■■□ 3.16
ARHGAP9-211ENST00000549602 TRIM41Q8WV44 630 aa34.78■■■■□ 3.16
ARHGAP9-211ENST00000549602 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.77■■■■□ 3.16
ARHGAP9-211ENST00000549602 CEP170Q5SW79 1584 aa34.69■■■■□ 3.14
ARHGAP9-211ENST00000549602 NUP160Q12769 1436 aa34.68■■■■□ 3.14
ARHGAP9-211ENST00000549602 ARAP1Q96P48 1450 aa34.65■■■■□ 3.14
ARHGAP9-211ENST00000549602 KIF27Q86VH2 1401 aa34.64■■■■□ 3.14
ARHGAP9-211ENST00000549602 IGF1RP08069 1367 aa34.59■■■■□ 3.13
ARHGAP9-211ENST00000549602 CUL7Q14999 1698 aa34.53■■■■□ 3.12
ARHGAP9-211ENST00000549602 SHROOM2Q13796 1616 aa34.5■■■■□ 3.11
ARHGAP9-211ENST00000549602 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.49■■■■□ 3.11
ARHGAP9-211ENST00000549602 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.45■■■■□ 3.1
ARHGAP9-211ENST00000549602 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.42■■■■□ 3.1
ARHGAP9-211ENST00000549602 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.32■■■■□ 3.08
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