RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548968.1

LRIG3-205, Transcript of leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 3, humanhuman

TSL 3

Gene LRIG3, Length 791 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3-205ENST00000548968 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.87■■■■■ 5.73
LRIG3-205ENST00000548968 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.17■■■■■ 4.82
LRIG3-205ENST00000548968 ABCC9O60706 1549 aa44.53■■■■■ 4.72
LRIG3-205ENST00000548968 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.69■■■■■ 4.43
LRIG3-205ENST00000548968 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.68■■■■■ 4.42
LRIG3-205ENST00000548968 NACADO15069 1562 aa42.62■■■■■ 4.41
LRIG3-205ENST00000548968 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.34■■■■■ 4.37
LRIG3-205ENST00000548968 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.3■■■■■ 4.36
LRIG3-205ENST00000548968 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.07■■■■■ 4.33
LRIG3-205ENST00000548968 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.67■■■■■ 4.26
LRIG3-205ENST00000548968 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.56■■■■■ 4.24
LRIG3-205ENST00000548968 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.42■■■■■ 4.22
LRIG3-205ENST00000548968 SCRIBQ14160 1630 aa41.24■■■■■ 4.19
LRIG3-205ENST00000548968 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.18■■■■■ 4.18
LRIG3-205ENST00000548968 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.99■■■■■ 4.15
LRIG3-205ENST00000548968 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.35■■■■■ 4.05
LRIG3-205ENST00000548968 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.21■■■■■ 4.03
LRIG3-205ENST00000548968 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.05■■■■■ 4
LRIG3-205ENST00000548968 SMARCA4P51532 1647 aa39.43■■■■□ 3.9
LRIG3-205ENST00000548968 NCAPD3P42695 1498 aa39.41■■■■□ 3.9
LRIG3-205ENST00000548968 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.41■■■■□ 3.9
LRIG3-205ENST00000548968 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.37■■■■□ 3.89
LRIG3-205ENST00000548968 SMARCA2P51531 1590 aa39.25■■■■□ 3.87
LRIG3-205ENST00000548968 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.19■■■■□ 3.86
LRIG3-205ENST00000548968 HMGXB3Q12766 1538 aa39.1■■■■□ 3.85
LRIG3-205ENST00000548968 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.09■■■■□ 3.85
LRIG3-205ENST00000548968 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.99■■■■□ 3.83
LRIG3-205ENST00000548968 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.72■■■■□ 3.79
LRIG3-205ENST00000548968 WIZO95785 1651 aa38.68■■■■□ 3.78
LRIG3-205ENST00000548968 NESP48681 1621 aa38.48■■■■□ 3.75
LRIG3-205ENST00000548968 ERCC6Q03468 1493 aa38.39■■■■□ 3.74
LRIG3-205ENST00000548968 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.31■■■■□ 3.72
LRIG3-205ENST00000548968 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.3■■■■□ 3.72
LRIG3-205ENST00000548968 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.26■■■■□ 3.72
LRIG3-205ENST00000548968 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.14■■■■□ 3.7
LRIG3-205ENST00000548968 CUX2O14529 1486 aa38.07■■■■□ 3.68
LRIG3-205ENST00000548968 CFTRP13569 1480 aa37.96■■■■□ 3.67
LRIG3-205ENST00000548968 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.92■■■■□ 3.66
LRIG3-205ENST00000548968 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.87■■■■□ 3.65
LRIG3-205ENST00000548968 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.85■■■■□ 3.65
LRIG3-205ENST00000548968 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.77■■■■□ 3.64
LRIG3-205ENST00000548968 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.71■■■■□ 3.63
LRIG3-205ENST00000548968 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.71■■■■□ 3.63
LRIG3-205ENST00000548968 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.61■■■■□ 3.61
LRIG3-205ENST00000548968 WDR62O43379 1518 aa37.56■■■■□ 3.6
LRIG3-205ENST00000548968 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.4■■■■□ 3.58
LRIG3-205ENST00000548968 PRDM2Q13029 1718 aa37.39■■■■□ 3.58
LRIG3-205ENST00000548968 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.26■■■■□ 3.56
LRIG3-205ENST00000548968 ABCC8Q09428 1581 aa37.13■■■■□ 3.53
LRIG3-205ENST00000548968 TOPBP1Q92547 1522 aa37.12■■■■□ 3.53
LRIG3-205ENST00000548968 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.02■■■■□ 3.52
LRIG3-205ENST00000548968 IFT140Q96RY7 1462 aa36.97■■■■□ 3.51
LRIG3-205ENST00000548968 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.81■■■■□ 3.48
LRIG3-205ENST00000548968 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.81■■■■□ 3.48
LRIG3-205ENST00000548968 CUX1P39880 1505 aa36.76■■■■□ 3.48
LRIG3-205ENST00000548968 SOGA1O94964 1423 aa36.7■■■■□ 3.47
LRIG3-205ENST00000548968 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.7■■■■□ 3.47
LRIG3-205ENST00000548968 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.68■■■■□ 3.46
LRIG3-205ENST00000548968 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.67■■■■□ 3.46
LRIG3-205ENST00000548968 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.62■■■■□ 3.45
LRIG3-205ENST00000548968 OSCARQ8IYS5 282 aa36.56■■■■□ 3.44
LRIG3-205ENST00000548968 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.56■■■■□ 3.44
LRIG3-205ENST00000548968 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
LRIG3-205ENST00000548968 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.49■■■■□ 3.43
LRIG3-205ENST00000548968 WDR97A6NE52 1622 aa36.37■■■■□ 3.41
LRIG3-205ENST00000548968 TOP2BQ02880 1626 aa36.36■■■■□ 3.41
LRIG3-205ENST00000548968 SYNJ1O43426 1573 aa36.33■■■■□ 3.41
LRIG3-205ENST00000548968 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.33■■■■□ 3.41
LRIG3-205ENST00000548968 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.31■■■■□ 3.4
LRIG3-205ENST00000548968 GRIN2BQ13224 1484 aa36.27■■■■□ 3.4
LRIG3-205ENST00000548968 FBLN2P98095 1184 aa36.24■■■■□ 3.39
LRIG3-205ENST00000548968 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.24■■■■□ 3.39
LRIG3-205ENST00000548968 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.21■■■■□ 3.39
LRIG3-205ENST00000548968 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
LRIG3-205ENST00000548968 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
LRIG3-205ENST00000548968 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.12■■■■□ 3.37
LRIG3-205ENST00000548968 CHD1O14646 1710 aa36.07■■■■□ 3.36
LRIG3-205ENST00000548968 SYNJ2O15056 1496 aa36.05■■■■□ 3.36
LRIG3-205ENST00000548968 PBRM1Q86U86 1689 aa36■■■■□ 3.35
LRIG3-205ENST00000548968 TRIM41Q8WV44 630 aa35.89■■■■□ 3.34
LRIG3-205ENST00000548968 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.87■■■■□ 3.33
LRIG3-205ENST00000548968 ARHGEF11O15085 1522 aa35.85■■■■□ 3.33
LRIG3-205ENST00000548968 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.83■■■■□ 3.33
LRIG3-205ENST00000548968 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.83■■■■□ 3.33
LRIG3-205ENST00000548968 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.83■■■■□ 3.33
LRIG3-205ENST00000548968 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.83■■■■□ 3.33
LRIG3-205ENST00000548968 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.79■■■■□ 3.32
LRIG3-205ENST00000548968 ADAMTS12P58397 1594 aa35.79■■■■□ 3.32
LRIG3-205ENST00000548968 GRIN2AQ12879 1464 aa35.78■■■■□ 3.32
LRIG3-205ENST00000548968 KIF27Q86VH2 1401 aa35.75■■■■□ 3.31
LRIG3-205ENST00000548968 IGF1RP08069 1367 aa35.7■■■■□ 3.31
LRIG3-205ENST00000548968 NUP160Q12769 1436 aa35.66■■■■□ 3.3
LRIG3-205ENST00000548968 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.64■■■■□ 3.3
LRIG3-205ENST00000548968 CEP170Q5SW79 1584 aa35.57■■■■□ 3.28
LRIG3-205ENST00000548968 ARAP1Q96P48 1450 aa35.55■■■■□ 3.28
LRIG3-205ENST00000548968 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.45■■■■□ 3.27
LRIG3-205ENST00000548968 CUL7Q14999 1698 aa35.43■■■■□ 3.26
LRIG3-205ENST00000548968 JPH4Q96JJ6 628 aa35.37■■■■□ 3.25
LRIG3-205ENST00000548968 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.36■■■■□ 3.25
LRIG3-205ENST00000548968 SHROOM2Q13796 1616 aa35.32■■■■□ 3.24
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