RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548759.1

DTX1-204, Transcript of deltex E3 ubiquitin ligase 1, humanhuman

TSL 2

Gene DTX1, Length 940 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX1-204ENST00000548759 NISCHQ9Y2I1 1504 aa68.39■■■■■ 8.54
DTX1-204ENST00000548759 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa61.04■■■■■ 7.36
DTX1-204ENST00000548759 ABCC9O60706 1549 aa60.8■■■■■ 7.32
DTX1-204ENST00000548759 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa57.97■■■■■ 6.87
DTX1-204ENST00000548759 DCAF8L2P0C7V8 631 aa57.82■■■■■ 6.85
DTX1-204ENST00000548759 NACADO15069 1562 aa57.69■■■■■ 6.83
DTX1-204ENST00000548759 MYO15BQ96JP2 1530 aa56.99■■■■■ 6.71
DTX1-204ENST00000548759 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP56.8■■■■■ 6.68
DTX1-204ENST00000548759 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP56.72■■■■■ 6.67
DTX1-204ENST00000548759 DNAJC5BQ9UF47 199 aa56.71■■■■■ 6.67
DTX1-204ENST00000548759 UNC13AQ9UPW8 1703 aa56.57■■■■■ 6.65
DTX1-204ENST00000548759 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa56.44■■■■■ 6.63
DTX1-204ENST00000548759 BICRAQ9NZM4 1560 aa56.25■■■■■ 6.59
DTX1-204ENST00000548759 SCRIBQ14160 1630 aa55.76■■■■■ 6.52
DTX1-204ENST00000548759 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa55.48■■■■■ 6.47
DTX1-204ENST00000548759 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa54.86■■■■■ 6.37
DTX1-204ENST00000548759 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP54.85■■■■■ 6.37
DTX1-204ENST00000548759 CECR2Q9BXF3 1484 aa54.7■■■■■ 6.35
DTX1-204ENST00000548759 NCAPD3P42695 1498 aa53.3■■■■■ 6.12
DTX1-204ENST00000548759 SMARCA4P51532 1647 aa53.2■■■■■ 6.11
DTX1-204ENST00000548759 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa53.2■■■■■ 6.11
DTX1-204ENST00000548759 SMARCA2P51531 1590 aa53.04■■■■■ 6.08
DTX1-204ENST00000548759 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP53.03■■■■■ 6.08
DTX1-204ENST00000548759 HMGXB3Q12766 1538 aa52.86■■■■■ 6.05
DTX1-204ENST00000548759 MROH2BQ7Z745 1585 aa52.72■■■■■ 6.03
DTX1-204ENST00000548759 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP52.72■■■■■ 6.03
DTX1-204ENST00000548759 PEG3Q9GZU2 1588 aa52.64■■■■■ 6.02
DTX1-204ENST00000548759 ERCC6Q03468 1493 aa52.46■■■■■ 5.99
DTX1-204ENST00000548759 NESP48681 1621 aa52.34■■■■■ 5.97
DTX1-204ENST00000548759 CUX2O14529 1486 aa52.12■■■■■ 5.93
DTX1-204ENST00000548759 WIZO95785 1651 aa52.08■■■■■ 5.93
DTX1-204ENST00000548759 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa51.96■■■■■ 5.91
DTX1-204ENST00000548759 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP51.84■■■■■ 5.89
DTX1-204ENST00000548759 PDS5BQ9NTI5 1447 aa51.75■■■■■ 5.88
DTX1-204ENST00000548759 CADPSQ9ULU8 1353 aa51.75■■■■■ 5.88
DTX1-204ENST00000548759 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa51.73■■■■■ 5.87
DTX1-204ENST00000548759 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP51.58■■■■■ 5.85
DTX1-204ENST00000548759 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa51.57■■■■■ 5.85
DTX1-204ENST00000548759 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP51.43■■■■■ 5.82
DTX1-204ENST00000548759 MRC2Q9UBG0 1479 aa51.22■■■■■ 5.79
DTX1-204ENST00000548759 CFTRP13569 1480 aa51.21■■■■■ 5.79
DTX1-204ENST00000548759 FANCD2Q9BXW9 1451 aa51.13■■■■■ 5.78
DTX1-204ENST00000548759 CEP164Q9UPV0 1460 aa51.12■■■■■ 5.77
DTX1-204ENST00000548759 WDR62O43379 1518 aa51.03■■■■■ 5.76
DTX1-204ENST00000548759 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.94■■■■■ 5.75
DTX1-204ENST00000548759 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP50.66■■■■■ 5.7
DTX1-204ENST00000548759 PRDM2Q13029 1718 aa50.56■■■■■ 5.68
DTX1-204ENST00000548759 TOPBP1Q92547 1522 aa50.2■■■■■ 5.63
DTX1-204ENST00000548759 ABCC8Q09428 1581 aa50.13■■■■■ 5.61
DTX1-204ENST00000548759 IFT140Q96RY7 1462 aa50.09■■■■■ 5.61
DTX1-204ENST00000548759 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP50.07■■■■■ 5.61
DTX1-204ENST00000548759 OSCARQ8IYS5 282 aa50.01■■■■■ 5.6
DTX1-204ENST00000548759 DNMBPQ6XZF7 1577 aa50■■■■■ 5.6
DTX1-204ENST00000548759 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP49.99■■■■■ 5.59
DTX1-204ENST00000548759 TRIM41Q8WV44 630 aa49.73■■■■■ 5.55
DTX1-204ENST00000548759 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP49.71■■■■■ 5.55
DTX1-204ENST00000548759 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP49.66■■■■■ 5.54
DTX1-204ENST00000548759 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP49.65■■■■■ 5.54
DTX1-204ENST00000548759 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP49.63■■■■■ 5.54
DTX1-204ENST00000548759 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa49.58■■■■■ 5.53
DTX1-204ENST00000548759 SOGA1O94964 1423 aa49.58■■■■■ 5.53
DTX1-204ENST00000548759 CUX1P39880 1505 aa49.49■■■■■ 5.51
DTX1-204ENST00000548759 FGD5Q6ZNL6 1462 aa49.48■■■■■ 5.51
DTX1-204ENST00000548759 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP49.45■■■■■ 5.51
DTX1-204ENST00000548759 FBLN2P98095 1184 aa49.35■■■■■ 5.49
DTX1-204ENST00000548759 CHD1O14646 1710 aa49.17■■■■■ 5.46
DTX1-204ENST00000548759 WDR97A6NE52 1622 aa49.12■■■■■ 5.45
DTX1-204ENST00000548759 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa49.12■■■■■ 5.45
DTX1-204ENST00000548759 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa49.12■■■■■ 5.45
DTX1-204ENST00000548759 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa49.12■■■■■ 5.45
DTX1-204ENST00000548759 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa49.09■■■■■ 5.45
DTX1-204ENST00000548759 GRIN2BQ13224 1484 aa49.04■■■■■ 5.44
DTX1-204ENST00000548759 ARHGEF11O15085 1522 aa49.04■■■■■ 5.44
DTX1-204ENST00000548759 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP49.03■■■■■ 5.44
DTX1-204ENST00000548759 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP48.95■■■■■ 5.43
DTX1-204ENST00000548759 GAPVD1Q14C86 1478 aa48.94■■■■■ 5.43
DTX1-204ENST00000548759 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa48.92■■■■■ 5.42
DTX1-204ENST00000548759 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.89■■■■■ 5.42
DTX1-204ENST00000548759 CYB5RLQ6IPT4 315 aa48.84■■■■■ 5.41
DTX1-204ENST00000548759 SYNJ2O15056 1496 aa48.8■■■■■ 5.4
DTX1-204ENST00000548759 TOP2BQ02880 1626 aa48.78■■■■■ 5.4
DTX1-204ENST00000548759 SYNJ1O43426 1573 aa48.75■■■■■ 5.39
DTX1-204ENST00000548759 PBRM1Q86U86 1689 aa48.75■■■■■ 5.39
DTX1-204ENST00000548759 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.74■■■■■ 5.39
DTX1-204ENST00000548759 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa48.73■■■■■ 5.39
DTX1-204ENST00000548759 CLASP1Q7Z460 1538 aa48.63■■■■■ 5.38
DTX1-204ENST00000548759 ARAP1Q96P48 1450 aa48.6■■■■■ 5.37
DTX1-204ENST00000548759 GRIN2AQ12879 1464 aa48.38■■■■■ 5.34
DTX1-204ENST00000548759 ADAMTS12P58397 1594 aa48.34■■■■■ 5.33
DTX1-204ENST00000548759 FHAD1B1AJZ9 1412 aa48.33■■■■■ 5.33
DTX1-204ENST00000548759 ERICH3Q5RHP9 1530 aa48.29■■■■■ 5.32
DTX1-204ENST00000548759 NUP160Q12769 1436 aa48.2■■■■■ 5.31
DTX1-204ENST00000548759 TRHP20396 242 aaPredicted RBP48.18■■■■■ 5.3
DTX1-204ENST00000548759 CEP170Q5SW79 1584 aa48.15■■■■■ 5.3
DTX1-204ENST00000548759 ERCC6L2Q5T890 1561 aa47.97■■■■■ 5.27
DTX1-204ENST00000548759 KIF27Q86VH2 1401 aa47.95■■■■■ 5.27
DTX1-204ENST00000548759 IGF1RP08069 1367 aa47.91■■■■■ 5.26
DTX1-204ENST00000548759 JPH4Q96JJ6 628 aa47.86■■■■■ 5.25
DTX1-204ENST00000548759 SHROOM2Q13796 1616 aa47.85■■■■■ 5.25
DTX1-204ENST00000548759 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP47.78■■■■■ 5.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.3 ms