RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548749.5

RBFOX1-211, Transcript of RNA binding fox-1 homolog 1, humanhuman

TSL 4

Gene RBFOX1, Length 538 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX1-211ENST00000548749 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.62■■■■■ 5.37
RBFOX1-211ENST00000548749 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.31■■■■■ 4.52
RBFOX1-211ENST00000548749 ABCC9O60706 1549 aa42.62■■■■■ 4.41
RBFOX1-211ENST00000548749 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.87■■■■■ 4.13
RBFOX1-211ENST00000548749 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.81■■■■■ 4.12
RBFOX1-211ENST00000548749 NACADO15069 1562 aa40.75■■■■■ 4.11
RBFOX1-211ENST00000548749 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
RBFOX1-211ENST00000548749 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.39■■■■■ 4.06
RBFOX1-211ENST00000548749 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.16■■■■■ 4.02
RBFOX1-211ENST00000548749 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.97■■■■□ 3.99
RBFOX1-211ENST00000548749 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.8■■■■□ 3.96
RBFOX1-211ENST00000548749 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.63■■■■□ 3.93
RBFOX1-211ENST00000548749 SCRIBQ14160 1630 aa39.58■■■■□ 3.93
RBFOX1-211ENST00000548749 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.25■■■■□ 3.87
RBFOX1-211ENST00000548749 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.14■■■■□ 3.86
RBFOX1-211ENST00000548749 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.61■■■■□ 3.77
RBFOX1-211ENST00000548749 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.52■■■■□ 3.76
RBFOX1-211ENST00000548749 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.29■■■■□ 3.72
RBFOX1-211ENST00000548749 SMARCA4P51532 1647 aa37.79■■■■□ 3.64
RBFOX1-211ENST00000548749 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.7■■■■□ 3.63
RBFOX1-211ENST00000548749 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.61■■■■□ 3.61
RBFOX1-211ENST00000548749 NCAPD3P42695 1498 aa37.58■■■■□ 3.61
RBFOX1-211ENST00000548749 SMARCA2P51531 1590 aa37.56■■■■□ 3.6
RBFOX1-211ENST00000548749 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.49■■■■□ 3.59
RBFOX1-211ENST00000548749 HMGXB3Q12766 1538 aa37.41■■■■□ 3.58
RBFOX1-211ENST00000548749 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.37■■■■□ 3.57
RBFOX1-211ENST00000548749 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.33■■■■□ 3.57
RBFOX1-211ENST00000548749 WIZO95785 1651 aa37.1■■■■□ 3.53
RBFOX1-211ENST00000548749 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.97■■■■□ 3.51
RBFOX1-211ENST00000548749 NESP48681 1621 aa36.81■■■■□ 3.48
RBFOX1-211ENST00000548749 ERCC6Q03468 1493 aa36.76■■■■□ 3.48
RBFOX1-211ENST00000548749 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.67■■■■□ 3.46
RBFOX1-211ENST00000548749 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.66■■■■□ 3.46
RBFOX1-211ENST00000548749 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.51■■■■□ 3.43
RBFOX1-211ENST00000548749 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.42■■■■□ 3.42
RBFOX1-211ENST00000548749 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.39■■■■□ 3.42
RBFOX1-211ENST00000548749 CUX2O14529 1486 aa36.37■■■■□ 3.41
RBFOX1-211ENST00000548749 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
RBFOX1-211ENST00000548749 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.24■■■■□ 3.39
RBFOX1-211ENST00000548749 CFTRP13569 1480 aa36.24■■■■□ 3.39
RBFOX1-211ENST00000548749 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.11■■■■□ 3.37
RBFOX1-211ENST00000548749 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.1■■■■□ 3.37
RBFOX1-211ENST00000548749 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.08■■■■□ 3.37
RBFOX1-211ENST00000548749 PRDM2Q13029 1718 aa36■■■■□ 3.35
RBFOX1-211ENST00000548749 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
RBFOX1-211ENST00000548749 WDR62O43379 1518 aa35.94■■■■□ 3.34
RBFOX1-211ENST00000548749 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
RBFOX1-211ENST00000548749 TOPBP1Q92547 1522 aa35.52■■■■□ 3.28
RBFOX1-211ENST00000548749 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.48■■■■□ 3.27
RBFOX1-211ENST00000548749 ABCC8Q09428 1581 aa35.47■■■■□ 3.27
RBFOX1-211ENST00000548749 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.46■■■■□ 3.27
RBFOX1-211ENST00000548749 IFT140Q96RY7 1462 aa35.33■■■■□ 3.25
RBFOX1-211ENST00000548749 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
RBFOX1-211ENST00000548749 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.2■■■■□ 3.23
RBFOX1-211ENST00000548749 CUX1P39880 1505 aa35.18■■■■□ 3.22
RBFOX1-211ENST00000548749 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.14■■■■□ 3.22
RBFOX1-211ENST00000548749 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.1■■■■□ 3.21
RBFOX1-211ENST00000548749 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.08■■■■□ 3.21
RBFOX1-211ENST00000548749 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.2
RBFOX1-211ENST00000548749 SOGA1O94964 1423 aa35.06■■■■□ 3.2
RBFOX1-211ENST00000548749 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.99■■■■□ 3.19
RBFOX1-211ENST00000548749 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.9■■■■□ 3.18
RBFOX1-211ENST00000548749 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.89■■■■□ 3.18
RBFOX1-211ENST00000548749 OSCARQ8IYS5 282 aa34.85■■■■□ 3.17
RBFOX1-211ENST00000548749 SYNJ1O43426 1573 aa34.83■■■■□ 3.17
RBFOX1-211ENST00000548749 TOP2BQ02880 1626 aa34.82■■■■□ 3.16
RBFOX1-211ENST00000548749 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.82■■■■□ 3.16
RBFOX1-211ENST00000548749 WDR97A6NE52 1622 aa34.81■■■■□ 3.16
RBFOX1-211ENST00000548749 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.72■■■■□ 3.15
RBFOX1-211ENST00000548749 CHD1O14646 1710 aa34.69■■■■□ 3.14
RBFOX1-211ENST00000548749 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.67■■■■□ 3.14
RBFOX1-211ENST00000548749 GRIN2BQ13224 1484 aa34.66■■■■□ 3.14
RBFOX1-211ENST00000548749 FBLN2P98095 1184 aa34.66■■■■□ 3.14
RBFOX1-211ENST00000548749 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.65■■■■□ 3.14
RBFOX1-211ENST00000548749 PBRM1Q86U86 1689 aa34.62■■■■□ 3.13
RBFOX1-211ENST00000548749 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.62■■■■□ 3.13
RBFOX1-211ENST00000548749 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
RBFOX1-211ENST00000548749 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
RBFOX1-211ENST00000548749 SYNJ2O15056 1496 aa34.46■■■■□ 3.11
RBFOX1-211ENST00000548749 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.34■■■■□ 3.09
RBFOX1-211ENST00000548749 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.34■■■■□ 3.09
RBFOX1-211ENST00000548749 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.34■■■■□ 3.09
RBFOX1-211ENST00000548749 TRIM41Q8WV44 630 aa34.34■■■■□ 3.09
RBFOX1-211ENST00000548749 ADAMTS12P58397 1594 aa34.31■■■■□ 3.08
RBFOX1-211ENST00000548749 ARHGEF11O15085 1522 aa34.3■■■■□ 3.08
RBFOX1-211ENST00000548749 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.3■■■■□ 3.08
RBFOX1-211ENST00000548749 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.25■■■■□ 3.07
RBFOX1-211ENST00000548749 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.23■■■■□ 3.07
RBFOX1-211ENST00000548749 GRIN2AQ12879 1464 aa34.22■■■■□ 3.07
RBFOX1-211ENST00000548749 KIF27Q86VH2 1401 aa34.17■■■■□ 3.06
RBFOX1-211ENST00000548749 CEP170Q5SW79 1584 aa34.07■■■■□ 3.05
RBFOX1-211ENST00000548749 NUP160Q12769 1436 aa34.05■■■■□ 3.04
RBFOX1-211ENST00000548749 IGF1RP08069 1367 aa34.04■■■■□ 3.04
RBFOX1-211ENST00000548749 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.02■■■■□ 3.04
RBFOX1-211ENST00000548749 ARAP1Q96P48 1450 aa34.01■■■■□ 3.04
RBFOX1-211ENST00000548749 CUL7Q14999 1698 aa33.98■■■■□ 3.03
RBFOX1-211ENST00000548749 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.85■■■■□ 3.01
RBFOX1-211ENST00000548749 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.83■■■■□ 3.01
RBFOX1-211ENST00000548749 SHROOM2Q13796 1616 aa33.82■■■■□ 3.01
RBFOX1-211ENST00000548749 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.81■■■■□ 3
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