RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548643.5

GIT2-211, Transcript of GIT ArfGAP 2, humanhuman

TSL 2

Gene GIT2, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT2-211ENST00000548643 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.46■■■■■ 5.03
GIT2-211ENST00000548643 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.7■■■■■ 4.27
GIT2-211ENST00000548643 ABCC9O60706 1549 aa41.35■■■■■ 4.21
GIT2-211ENST00000548643 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.52■■■■□ 3.92
GIT2-211ENST00000548643 NACADO15069 1562 aa39.29■■■■□ 3.88
GIT2-211ENST00000548643 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.01■■■■□ 3.84
GIT2-211ENST00000548643 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.83■■■■□ 3.81
GIT2-211ENST00000548643 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.81■■■■□ 3.8
GIT2-211ENST00000548643 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.57■■■■□ 3.76
GIT2-211ENST00000548643 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.55■■■■□ 3.76
GIT2-211ENST00000548643 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.48■■■■□ 3.75
GIT2-211ENST00000548643 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.42■■■■□ 3.74
GIT2-211ENST00000548643 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.39■■■■□ 3.74
GIT2-211ENST00000548643 SCRIBQ14160 1630 aa37.94■■■■□ 3.66
GIT2-211ENST00000548643 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.84■■■■□ 3.65
GIT2-211ENST00000548643 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.44■■■■□ 3.58
GIT2-211ENST00000548643 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.4■■■■□ 3.58
GIT2-211ENST00000548643 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.22■■■■□ 3.55
GIT2-211ENST00000548643 SMARCA4P51532 1647 aa36.24■■■■□ 3.39
GIT2-211ENST00000548643 NCAPD3P42695 1498 aa36.24■■■■□ 3.39
GIT2-211ENST00000548643 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.16■■■■□ 3.38
GIT2-211ENST00000548643 SMARCA2P51531 1590 aa36.1■■■■□ 3.37
GIT2-211ENST00000548643 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.06■■■■□ 3.36
GIT2-211ENST00000548643 HMGXB3Q12766 1538 aa36.03■■■■□ 3.36
GIT2-211ENST00000548643 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.89■■■■□ 3.34
GIT2-211ENST00000548643 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.81■■■■□ 3.32
GIT2-211ENST00000548643 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.8■■■■□ 3.32
GIT2-211ENST00000548643 ERCC6Q03468 1493 aa35.67■■■■□ 3.3
GIT2-211ENST00000548643 NESP48681 1621 aa35.61■■■■□ 3.29
GIT2-211ENST00000548643 CUX2O14529 1486 aa35.57■■■■□ 3.28
GIT2-211ENST00000548643 WIZO95785 1651 aa35.45■■■■□ 3.27
GIT2-211ENST00000548643 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.44■■■■□ 3.26
GIT2-211ENST00000548643 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.28■■■■□ 3.24
GIT2-211ENST00000548643 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
GIT2-211ENST00000548643 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.26■■■■□ 3.24
GIT2-211ENST00000548643 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.15■■■■□ 3.22
GIT2-211ENST00000548643 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.12■■■■□ 3.21
GIT2-211ENST00000548643 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.1■■■■□ 3.21
GIT2-211ENST00000548643 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
GIT2-211ENST00000548643 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.85■■■■□ 3.17
GIT2-211ENST00000548643 WDR62O43379 1518 aa34.8■■■■□ 3.16
GIT2-211ENST00000548643 CFTRP13569 1480 aa34.79■■■■□ 3.16
GIT2-211ENST00000548643 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.76■■■■□ 3.15
GIT2-211ENST00000548643 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.74■■■■□ 3.15
GIT2-211ENST00000548643 PRDM2Q13029 1718 aa34.68■■■■□ 3.14
GIT2-211ENST00000548643 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.54■■■■□ 3.12
GIT2-211ENST00000548643 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.45■■■■□ 3.11
GIT2-211ENST00000548643 TOPBP1Q92547 1522 aa34.13■■■■□ 3.05
GIT2-211ENST00000548643 ABCC8Q09428 1581 aa34.06■■■■□ 3.04
GIT2-211ENST00000548643 IFT140Q96RY7 1462 aa34.05■■■■□ 3.04
GIT2-211ENST00000548643 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.05■■■■□ 3.04
GIT2-211ENST00000548643 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.98■■■■□ 3.03
GIT2-211ENST00000548643 OSCARQ8IYS5 282 aa33.93■■■■□ 3.02
GIT2-211ENST00000548643 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.87■■■■□ 3.01
GIT2-211ENST00000548643 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.86■■■■□ 3.01
GIT2-211ENST00000548643 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.78■■■■□ 3
GIT2-211ENST00000548643 TRIM41Q8WV44 630 aa33.77■■■■□ 3
GIT2-211ENST00000548643 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.69■■■□□ 2.98
GIT2-211ENST00000548643 CHD1O14646 1710 aa33.65■■■□□ 2.98
GIT2-211ENST00000548643 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.65■■■□□ 2.98
GIT2-211ENST00000548643 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.64■■■□□ 2.98
GIT2-211ENST00000548643 CUX1P39880 1505 aa33.62■■■□□ 2.97
GIT2-211ENST00000548643 SOGA1O94964 1423 aa33.61■■■□□ 2.97
GIT2-211ENST00000548643 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.6■■■□□ 2.97
GIT2-211ENST00000548643 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.57■■■□□ 2.97
GIT2-211ENST00000548643 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.57■■■□□ 2.97
GIT2-211ENST00000548643 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.57■■■□□ 2.97
GIT2-211ENST00000548643 WDR97A6NE52 1622 aa33.54■■■□□ 2.96
GIT2-211ENST00000548643 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.49■■■□□ 2.95
GIT2-211ENST00000548643 ARHGEF11O15085 1522 aa33.44■■■□□ 2.94
GIT2-211ENST00000548643 FBLN2P98095 1184 aa33.37■■■□□ 2.93
GIT2-211ENST00000548643 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.36■■■□□ 2.93
GIT2-211ENST00000548643 PBRM1Q86U86 1689 aa33.33■■■□□ 2.93
GIT2-211ENST00000548643 GRIN2BQ13224 1484 aa33.3■■■□□ 2.92
GIT2-211ENST00000548643 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.3■■■□□ 2.92
GIT2-211ENST00000548643 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.24■■■□□ 2.91
GIT2-211ENST00000548643 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.23■■■□□ 2.91
GIT2-211ENST00000548643 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.23■■■□□ 2.91
GIT2-211ENST00000548643 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.22■■■□□ 2.91
GIT2-211ENST00000548643 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.18■■■□□ 2.9
GIT2-211ENST00000548643 TOP2BQ02880 1626 aa33.18■■■□□ 2.9
GIT2-211ENST00000548643 SYNJ2O15056 1496 aa33.18■■■□□ 2.9
GIT2-211ENST00000548643 SYNJ1O43426 1573 aa33.17■■■□□ 2.9
GIT2-211ENST00000548643 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.17■■■□□ 2.9
GIT2-211ENST00000548643 ARAP1Q96P48 1450 aa33.12■■■□□ 2.89
GIT2-211ENST00000548643 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.11■■■□□ 2.89
GIT2-211ENST00000548643 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.11■■■□□ 2.89
GIT2-211ENST00000548643 ADAMTS12P58397 1594 aa32.94■■■□□ 2.86
GIT2-211ENST00000548643 GRIN2AQ12879 1464 aa32.89■■■□□ 2.86
GIT2-211ENST00000548643 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.85■■■□□ 2.85
GIT2-211ENST00000548643 CEP170Q5SW79 1584 aa32.8■■■□□ 2.84
GIT2-211ENST00000548643 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.79■■■□□ 2.84
GIT2-211ENST00000548643 NUP160Q12769 1436 aa32.77■■■□□ 2.84
GIT2-211ENST00000548643 SHROOM2Q13796 1616 aa32.68■■■□□ 2.82
GIT2-211ENST00000548643 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.67■■■□□ 2.82
GIT2-211ENST00000548643 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.66■■■□□ 2.82
GIT2-211ENST00000548643 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.47■■■□□ 2.79
GIT2-211ENST00000548643 CUL7Q14999 1698 aa32.46■■■□□ 2.79
GIT2-211ENST00000548643 KIF27Q86VH2 1401 aa32.45■■■□□ 2.79
GIT2-211ENST00000548643 IGF1RP08069 1367 aa32.42■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.4 ms