RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548531.1

NELL2-210, Transcript of neural EGFL like 2, humanhuman

TSL 4

Gene NELL2, Length 586 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELL2-210ENST00000548531 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.18■■■■■ 4.82
NELL2-210ENST00000548531 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.55■■■■■ 4.08
NELL2-210ENST00000548531 ABCC9O60706 1549 aa39.7■■■■□ 3.95
NELL2-210ENST00000548531 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.17■■■■□ 3.7
NELL2-210ENST00000548531 NACADO15069 1562 aa38.04■■■■□ 3.68
NELL2-210ENST00000548531 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.77■■■■□ 3.64
NELL2-210ENST00000548531 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.64■■■■□ 3.62
NELL2-210ENST00000548531 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.56■■■■□ 3.6
NELL2-210ENST00000548531 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.47■■■■□ 3.59
NELL2-210ENST00000548531 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.38■■■■□ 3.57
NELL2-210ENST00000548531 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.13■■■■□ 3.53
NELL2-210ENST00000548531 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.84■■■■□ 3.49
NELL2-210ENST00000548531 SCRIBQ14160 1630 aa36.78■■■■□ 3.48
NELL2-210ENST00000548531 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.71■■■■□ 3.47
NELL2-210ENST00000548531 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.7■■■■□ 3.47
NELL2-210ENST00000548531 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
NELL2-210ENST00000548531 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.05■■■■□ 3.36
NELL2-210ENST00000548531 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.73■■■■□ 3.31
NELL2-210ENST00000548531 SMARCA4P51532 1647 aa35.22■■■■□ 3.23
NELL2-210ENST00000548531 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
NELL2-210ENST00000548531 NCAPD3P42695 1498 aa35.04■■■■□ 3.2
NELL2-210ENST00000548531 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.01■■■■□ 3.19
NELL2-210ENST00000548531 SMARCA2P51531 1590 aa34.99■■■■□ 3.19
NELL2-210ENST00000548531 HMGXB3Q12766 1538 aa34.97■■■■□ 3.19
NELL2-210ENST00000548531 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.96■■■■□ 3.19
NELL2-210ENST00000548531 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.81■■■■□ 3.16
NELL2-210ENST00000548531 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
NELL2-210ENST00000548531 WIZO95785 1651 aa34.47■■■■□ 3.11
NELL2-210ENST00000548531 NESP48681 1621 aa34.31■■■■□ 3.08
NELL2-210ENST00000548531 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.27■■■■□ 3.08
NELL2-210ENST00000548531 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
NELL2-210ENST00000548531 ERCC6Q03468 1493 aa34.2■■■■□ 3.06
NELL2-210ENST00000548531 CUX2O14529 1486 aa34.12■■■■□ 3.05
NELL2-210ENST00000548531 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
NELL2-210ENST00000548531 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
NELL2-210ENST00000548531 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.08■■■■□ 3.05
NELL2-210ENST00000548531 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.91■■■■□ 3.02
NELL2-210ENST00000548531 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.86■■■■□ 3.01
NELL2-210ENST00000548531 PRDM2Q13029 1718 aa33.76■■■■□ 3
NELL2-210ENST00000548531 CFTRP13569 1480 aa33.74■■■□□ 2.99
NELL2-210ENST00000548531 WDR62O43379 1518 aa33.65■■■□□ 2.98
NELL2-210ENST00000548531 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.64■■■□□ 2.98
NELL2-210ENST00000548531 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.59■■■□□ 2.97
NELL2-210ENST00000548531 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.58■■■□□ 2.97
NELL2-210ENST00000548531 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.56■■■□□ 2.96
NELL2-210ENST00000548531 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.34■■■□□ 2.93
NELL2-210ENST00000548531 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.3■■■□□ 2.92
NELL2-210ENST00000548531 TOPBP1Q92547 1522 aa33.06■■■□□ 2.88
NELL2-210ENST00000548531 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.04■■■□□ 2.88
NELL2-210ENST00000548531 ABCC8Q09428 1581 aa32.96■■■□□ 2.87
NELL2-210ENST00000548531 IFT140Q96RY7 1462 aa32.89■■■□□ 2.86
NELL2-210ENST00000548531 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.84■■■□□ 2.85
NELL2-210ENST00000548531 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.79■■■□□ 2.84
NELL2-210ENST00000548531 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.79■■■□□ 2.84
NELL2-210ENST00000548531 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.75■■■□□ 2.83
NELL2-210ENST00000548531 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.72■■■□□ 2.83
NELL2-210ENST00000548531 CUX1P39880 1505 aa32.7■■■□□ 2.83
NELL2-210ENST00000548531 WDR97A6NE52 1622 aa32.62■■■□□ 2.81
NELL2-210ENST00000548531 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.6■■■□□ 2.81
NELL2-210ENST00000548531 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.53■■■□□ 2.8
NELL2-210ENST00000548531 CHD1O14646 1710 aa32.49■■■□□ 2.79
NELL2-210ENST00000548531 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.47■■■□□ 2.79
NELL2-210ENST00000548531 SOGA1O94964 1423 aa32.45■■■□□ 2.79
NELL2-210ENST00000548531 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.44■■■□□ 2.78
NELL2-210ENST00000548531 TOP2BQ02880 1626 aa32.37■■■□□ 2.77
NELL2-210ENST00000548531 PBRM1Q86U86 1689 aa32.35■■■□□ 2.77
NELL2-210ENST00000548531 OSCARQ8IYS5 282 aa32.35■■■□□ 2.77
NELL2-210ENST00000548531 SYNJ1O43426 1573 aa32.34■■■□□ 2.77
NELL2-210ENST00000548531 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.33■■■□□ 2.77
NELL2-210ENST00000548531 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.3■■■□□ 2.76
NELL2-210ENST00000548531 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
NELL2-210ENST00000548531 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.24■■■□□ 2.75
NELL2-210ENST00000548531 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.23■■■□□ 2.75
NELL2-210ENST00000548531 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
NELL2-210ENST00000548531 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.22■■■□□ 2.75
NELL2-210ENST00000548531 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.22■■■□□ 2.75
NELL2-210ENST00000548531 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.22■■■□□ 2.75
NELL2-210ENST00000548531 GRIN2BQ13224 1484 aa32.21■■■□□ 2.75
NELL2-210ENST00000548531 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.15■■■□□ 2.74
NELL2-210ENST00000548531 ARHGEF11O15085 1522 aa32.12■■■□□ 2.73
NELL2-210ENST00000548531 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.1■■■□□ 2.73
NELL2-210ENST00000548531 SYNJ2O15056 1496 aa32.08■■■□□ 2.73
NELL2-210ENST00000548531 ADAMTS12P58397 1594 aa32.02■■■□□ 2.72
NELL2-210ENST00000548531 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.92■■■□□ 2.7
NELL2-210ENST00000548531 FBLN2P98095 1184 aa31.9■■■□□ 2.7
NELL2-210ENST00000548531 TRIM41Q8WV44 630 aa31.89■■■□□ 2.7
NELL2-210ENST00000548531 GRIN2AQ12879 1464 aa31.84■■■□□ 2.69
NELL2-210ENST00000548531 ARAP1Q96P48 1450 aa31.84■■■□□ 2.69
NELL2-210ENST00000548531 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.82■■■□□ 2.68
NELL2-210ENST00000548531 CEP170Q5SW79 1584 aa31.79■■■□□ 2.68
NELL2-210ENST00000548531 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.75■■■□□ 2.67
NELL2-210ENST00000548531 NUP160Q12769 1436 aa31.75■■■□□ 2.67
NELL2-210ENST00000548531 SHROOM2Q13796 1616 aa31.7■■■□□ 2.66
NELL2-210ENST00000548531 CUL7Q14999 1698 aa31.63■■■□□ 2.65
NELL2-210ENST00000548531 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.59■■■□□ 2.65
NELL2-210ENST00000548531 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.56■■■□□ 2.64
NELL2-210ENST00000548531 KIF27Q86VH2 1401 aa31.54■■■□□ 2.64
NELL2-210ENST00000548531 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.51■■■□□ 2.63
NELL2-210ENST00000548531 IGF1RP08069 1367 aa31.44■■■□□ 2.62
NELL2-210ENST00000548531 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.28■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.9 ms