RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548449.1

FAM216A-205, Transcript of family with sequence similarity 216 member A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAM216A, Length 929 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM216A-205ENST00000548449 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.33■■■■■ 6.61
FAM216A-205ENST00000548449 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.36■■■■■ 5.65
FAM216A-205ENST00000548449 ABCC9O60706 1549 aa49.9■■■■■ 5.58
FAM216A-205ENST00000548449 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.73■■■■■ 5.23
FAM216A-205ENST00000548449 NACADO15069 1562 aa47.5■■■■■ 5.19
FAM216A-205ENST00000548449 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.48■■■■■ 5.19
FAM216A-205ENST00000548449 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.98■■■■■ 5.11
FAM216A-205ENST00000548449 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.76■■■■■ 5.08
FAM216A-205ENST00000548449 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.65■■■■■ 5.06
FAM216A-205ENST00000548449 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.56■■■■■ 5.04
FAM216A-205ENST00000548449 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.54■■■■■ 5.04
FAM216A-205ENST00000548449 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.37■■■■■ 5.01
FAM216A-205ENST00000548449 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.26■■■■■ 5
FAM216A-205ENST00000548449 SCRIBQ14160 1630 aa45.92■■■■■ 4.94
FAM216A-205ENST00000548449 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.7■■■■■ 4.91
FAM216A-205ENST00000548449 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.11■■■■■ 4.81
FAM216A-205ENST00000548449 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.11■■■■■ 4.81
FAM216A-205ENST00000548449 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.91■■■■■ 4.78
FAM216A-205ENST00000548449 SMARCA4P51532 1647 aa43.84■■■■■ 4.61
FAM216A-205ENST00000548449 NCAPD3P42695 1498 aa43.83■■■■■ 4.61
FAM216A-205ENST00000548449 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.76■■■■■ 4.6
FAM216A-205ENST00000548449 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.71■■■■■ 4.59
FAM216A-205ENST00000548449 SMARCA2P51531 1590 aa43.69■■■■■ 4.58
FAM216A-205ENST00000548449 HMGXB3Q12766 1538 aa43.54■■■■■ 4.56
FAM216A-205ENST00000548449 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.4■■■■■ 4.54
FAM216A-205ENST00000548449 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.39■■■■■ 4.54
FAM216A-205ENST00000548449 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.39■■■■■ 4.54
FAM216A-205ENST00000548449 ERCC6Q03468 1493 aa43.09■■■■■ 4.49
FAM216A-205ENST00000548449 NESP48681 1621 aa42.99■■■■■ 4.47
FAM216A-205ENST00000548449 WIZO95785 1651 aa42.93■■■■■ 4.46
FAM216A-205ENST00000548449 CUX2O14529 1486 aa42.81■■■■■ 4.44
FAM216A-205ENST00000548449 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.79■■■■■ 4.44
FAM216A-205ENST00000548449 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.68■■■■■ 4.42
FAM216A-205ENST00000548449 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.55■■■■■ 4.4
FAM216A-205ENST00000548449 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.54■■■■■ 4.4
FAM216A-205ENST00000548449 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.47■■■■■ 4.39
FAM216A-205ENST00000548449 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.44■■■■■ 4.38
FAM216A-205ENST00000548449 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.41■■■■■ 4.38
FAM216A-205ENST00000548449 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.28■■■■■ 4.36
FAM216A-205ENST00000548449 CFTRP13569 1480 aa42.13■■■■■ 4.34
FAM216A-205ENST00000548449 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.11■■■■■ 4.33
FAM216A-205ENST00000548449 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.06■■■■■ 4.32
FAM216A-205ENST00000548449 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.05■■■■■ 4.32
FAM216A-205ENST00000548449 WDR62O43379 1518 aa41.97■■■■■ 4.31
FAM216A-205ENST00000548449 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.93■■■■■ 4.3
FAM216A-205ENST00000548449 PRDM2Q13029 1718 aa41.81■■■■■ 4.28
FAM216A-205ENST00000548449 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.65■■■■■ 4.26
FAM216A-205ENST00000548449 TOPBP1Q92547 1522 aa41.31■■■■■ 4.2
FAM216A-205ENST00000548449 ABCC8Q09428 1581 aa41.3■■■■■ 4.2
FAM216A-205ENST00000548449 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.24■■■■■ 4.19
FAM216A-205ENST00000548449 IFT140Q96RY7 1462 aa41.21■■■■■ 4.19
FAM216A-205ENST00000548449 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.2■■■■■ 4.19
FAM216A-205ENST00000548449 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.06■■■■■ 4.16
FAM216A-205ENST00000548449 OSCARQ8IYS5 282 aa41.01■■■■■ 4.16
FAM216A-205ENST00000548449 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.9■■■■■ 4.14
FAM216A-205ENST00000548449 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
FAM216A-205ENST00000548449 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
FAM216A-205ENST00000548449 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.78■■■■■ 4.127e-7■□□□□ 9
FAM216A-205ENST00000548449 SOGA1O94964 1423 aa40.77■■■■■ 4.12
FAM216A-205ENST00000548449 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.76■■■■■ 4.12
FAM216A-205ENST00000548449 CUX1P39880 1505 aa40.74■■■■■ 4.11
FAM216A-205ENST00000548449 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.72■■■■■ 4.11
FAM216A-205ENST00000548449 TRIM41Q8WV44 630 aa40.66■■■■■ 4.1
FAM216A-205ENST00000548449 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.62■■■■■ 4.09
FAM216A-205ENST00000548449 WDR97A6NE52 1622 aa40.53■■■■■ 4.08
FAM216A-205ENST00000548449 CHD1O14646 1710 aa40.51■■■■■ 4.08
FAM216A-205ENST00000548449 FBLN2P98095 1184 aa40.5■■■■■ 4.07
FAM216A-205ENST00000548449 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.36■■■■■ 4.05
FAM216A-205ENST00000548449 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.36■■■■■ 4.05
FAM216A-205ENST00000548449 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.36■■■■■ 4.05
FAM216A-205ENST00000548449 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.36■■■■■ 4.05
FAM216A-205ENST00000548449 GRIN2BQ13224 1484 aa40.34■■■■■ 4.05
FAM216A-205ENST00000548449 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.29■■■■■ 4.04
FAM216A-205ENST00000548449 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.29■■■■■ 4.04
FAM216A-205ENST00000548449 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.28■■■■■ 4.04
FAM216A-205ENST00000548449 ARHGEF11O15085 1522 aa40.27■■■■■ 4.04
FAM216A-205ENST00000548449 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.27■■■■■ 4.04
FAM216A-205ENST00000548449 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
FAM216A-205ENST00000548449 TOP2BQ02880 1626 aa40.24■■■■■ 4.03
FAM216A-205ENST00000548449 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.24■■■■■ 4.03
FAM216A-205ENST00000548449 PBRM1Q86U86 1689 aa40.23■■■■■ 4.03
FAM216A-205ENST00000548449 SYNJ1O43426 1573 aa40.18■■■■■ 4.02
FAM216A-205ENST00000548449 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.17■■■■■ 4.02
FAM216A-205ENST00000548449 SYNJ2O15056 1496 aa40.15■■■■■ 4.02
FAM216A-205ENST00000548449 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.02■■■■■ 4
FAM216A-205ENST00000548449 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.01■■■■□ 3.99
FAM216A-205ENST00000548449 ARAP1Q96P48 1450 aa39.88■■■■□ 3.98
FAM216A-205ENST00000548449 ADAMTS12P58397 1594 aa39.83■■■■□ 3.97
FAM216A-205ENST00000548449 GRIN2AQ12879 1464 aa39.81■■■■□ 3.96
FAM216A-205ENST00000548449 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.81■■■■□ 3.96
FAM216A-205ENST00000548449 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.78■■■■□ 3.96
FAM216A-205ENST00000548449 NUP160Q12769 1436 aa39.64■■■■□ 3.94
FAM216A-205ENST00000548449 CEP170Q5SW79 1584 aa39.63■■■■□ 3.94
FAM216A-205ENST00000548449 KIF27Q86VH2 1401 aa39.5■■■■□ 3.91
FAM216A-205ENST00000548449 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.46■■■■□ 3.91
FAM216A-205ENST00000548449 SHROOM2Q13796 1616 aa39.42■■■■□ 3.9
FAM216A-205ENST00000548449 IGF1RP08069 1367 aa39.42■■■■□ 3.9
FAM216A-205ENST00000548449 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.42■■■■□ 3.9
FAM216A-205ENST00000548449 CUL7Q14999 1698 aa39.34■■■■□ 3.89
FAM216A-205ENST00000548449 JPH4Q96JJ6 628 aa39.32■■■■□ 3.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.9 ms