RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547929.6

NDUFA6-AS1-206, humanhuman

TSL 5

Gene NDUFA6-AS1, Length 708 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.37■■■■□ 3.89
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NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.12■■■■□ 3.05
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NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.71■■■□□ 2.99
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NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.64■■■□□ 2.82
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NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 SCRIBQ14160 1630 aa32.45■■■□□ 2.79
NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.41■■■□□ 2.78
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NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 NESP48681 1621 aa30.96■■■□□ 2.55
NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 SMARCA2P51531 1590 aa30.86■■■□□ 2.53
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NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 SMARCA4P51532 1647 aa30.84■■■□□ 2.53
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NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.51■■■□□ 2.47
NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.46■■■□□ 2.47
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NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.19■■■□□ 2.42
NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 WDR62O43379 1518 aa30.11■■■□□ 2.41
NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 WIZO95785 1651 aa30■■■□□ 2.39
NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.97■■■□□ 2.39
NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 OSCARQ8IYS5 282 aa29.91■■■□□ 2.38
NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.9■■■□□ 2.38
NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 CFTRP13569 1480 aa29.73■■■□□ 2.35
NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.34
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NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.56■■■□□ 2.32
NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.56■■■□□ 2.32
NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.32
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NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 PRDM2Q13029 1718 aa29.36■■■□□ 2.29
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NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 TOPBP1Q92547 1522 aa29.26■■■□□ 2.27
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NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.13■■■□□ 2.25
NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 FBLN2P98095 1184 aa29.13■■■□□ 2.25
NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 CHD1O14646 1710 aa29.13■■■□□ 2.25
NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 ABCC8Q09428 1581 aa29.09■■■□□ 2.25
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NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.9■■■□□ 2.22
NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 SOGA1O94964 1423 aa28.82■■■□□ 2.2
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NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.68■■■□□ 2.18
NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 SYNJ1O43426 1573 aa28.67■■■□□ 2.18
NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 GRIN2BQ13224 1484 aa28.59■■■□□ 2.17
NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 WDR97A6NE52 1622 aa28.58■■■□□ 2.17
NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 CUX1P39880 1505 aa28.56■■■□□ 2.16
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NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.51■■■□□ 2.15
NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 PBRM1Q86U86 1689 aa28.45■■■□□ 2.14
NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.33■■■□□ 2.13
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NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 CEP170Q5SW79 1584 aa28.19■■■□□ 2.1
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NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 ADAMTS12P58397 1594 aa28.11■■■□□ 2.09
NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.07■■■□□ 2.08
NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 SHROOM2Q13796 1616 aa28.05■■■□□ 2.08
NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.04■■■□□ 2.08
NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.02■■■□□ 2.08
NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.92■■■□□ 2.06
NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 JPH4Q96JJ6 628 aa27.92■■■□□ 2.06
NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 TOP2BQ02880 1626 aa27.9■■■□□ 2.06
NDUFA6-AS1-206ENST00000547929 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.9■■■□□ 2.06
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