RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547715.1

PTPRB-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 639 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-205ENST00000547715 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.01■■■■□ 3.52
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PTPRB-205ENST00000547715 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.08■■■□□ 2.57
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PTPRB-205ENST00000547715 SMARCA2P51531 1590 aa29.03■■■□□ 2.24
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PTPRB-205ENST00000547715 SMARCA4P51532 1647 aa29.01■■■□□ 2.23
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PTPRB-205ENST00000547715 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.66■■■□□ 2.18
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PTPRB-205ENST00000547715 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.36■■■□□ 2.13
PTPRB-205ENST00000547715 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.34■■■□□ 2.13
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PTPRB-205ENST00000547715 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.15■■■□□ 2.1
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PTPRB-205ENST00000547715 OSCARQ8IYS5 282 aa27.99■■■□□ 2.07
PTPRB-205ENST00000547715 CFTRP13569 1480 aa27.94■■■□□ 2.06
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PTPRB-205ENST00000547715 PRDM2Q13029 1718 aa27.7■■■□□ 2.03
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PTPRB-205ENST00000547715 ARAP1Q96P48 1450 aa27.24■■□□□ 1.95
PTPRB-205ENST00000547715 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
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PTPRB-205ENST00000547715 SOGA1O94964 1423 aa27.03■■□□□ 1.92
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PTPRB-205ENST00000547715 WDR97A6NE52 1622 aa26.94■■□□□ 1.9
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PTPRB-205ENST00000547715 CEP170Q5SW79 1584 aa26.46■■□□□ 1.83
PTPRB-205ENST00000547715 ADAMTS12P58397 1594 aa26.44■■□□□ 1.82
PTPRB-205ENST00000547715 NUP160Q12769 1436 aa26.41■■□□□ 1.82
PTPRB-205ENST00000547715 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.39■■□□□ 1.82
PTPRB-205ENST00000547715 SHROOM2Q13796 1616 aa26.39■■□□□ 1.81
PTPRB-205ENST00000547715 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.35■■□□□ 1.81
PTPRB-205ENST00000547715 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.32■■□□□ 1.8
PTPRB-205ENST00000547715 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.29■■□□□ 1.8
PTPRB-205ENST00000547715 TOP2BQ02880 1626 aa26.28■■□□□ 1.8
PTPRB-205ENST00000547715 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.24■■□□□ 1.79
PTPRB-205ENST00000547715 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
PTPRB-205ENST00000547715 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
PTPRB-205ENST00000547715 JPH4Q96JJ6 628 aa26.16■■□□□ 1.78
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