RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547427.5

RBFOX1-209, Transcript of RNA binding fox-1 homolog 1, humanhuman

TSL 4

Gene RBFOX1, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX1-209ENST00000547427 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.41■■■■■ 6.94
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RBFOX1-209ENST00000547427 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.02■■■■■ 5.44
RBFOX1-209ENST00000547427 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.01■■■■■ 5.44
RBFOX1-209ENST00000547427 NACADO15069 1562 aa48.9■■■■■ 5.42
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RBFOX1-209ENST00000547427 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.51■■■■■ 5.36
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RBFOX1-209ENST00000547427 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.64■■■■■ 5.22
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RBFOX1-209ENST00000547427 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.81■■■■■ 4.92
RBFOX1-209ENST00000547427 SMARCA4P51532 1647 aa45.37■■■■■ 4.85
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RBFOX1-209ENST00000547427 SMARCA2P51531 1590 aa45.1■■■■■ 4.81
RBFOX1-209ENST00000547427 NCAPD3P42695 1498 aa45.08■■■■■ 4.81
RBFOX1-209ENST00000547427 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.02■■■■■ 4.8
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RBFOX1-209ENST00000547427 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.86■■■■■ 4.77
RBFOX1-209ENST00000547427 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.79■■■■■ 4.76
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RBFOX1-209ENST00000547427 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.46■■■■■ 4.71
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RBFOX1-209ENST00000547427 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.97■■■■■ 4.63
RBFOX1-209ENST00000547427 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.8■■■■■ 4.6
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RBFOX1-209ENST00000547427 CUX2O14529 1486 aa43.49■■■■■ 4.55
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RBFOX1-209ENST00000547427 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.41■■■■■ 4.54
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RBFOX1-209ENST00000547427 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.29■■■■■ 4.52
RBFOX1-209ENST00000547427 PRDM2Q13029 1718 aa43.27■■■■■ 4.52
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RBFOX1-209ENST00000547427 TOPBP1Q92547 1522 aa42.61■■■■■ 4.41
RBFOX1-209ENST00000547427 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.56■■■■■ 4.4
RBFOX1-209ENST00000547427 IFT140Q96RY7 1462 aa42.36■■■■■ 4.37
RBFOX1-209ENST00000547427 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.25■■■■■ 4.35
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RBFOX1-209ENST00000547427 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.94■■■■■ 4.3
RBFOX1-209ENST00000547427 TOP2BQ02880 1626 aa41.88■■■■■ 4.3
RBFOX1-209ENST00000547427 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.87■■■■■ 4.29
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RBFOX1-209ENST00000547427 WDR97A6NE52 1622 aa41.8■■■■■ 4.28
RBFOX1-209ENST00000547427 OSCARQ8IYS5 282 aa41.73■■■■■ 4.27
RBFOX1-209ENST00000547427 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.69■■■■■ 4.27
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RBFOX1-209ENST00000547427 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.6■■■■■ 4.25
RBFOX1-209ENST00000547427 CHD1O14646 1710 aa41.56■■■■■ 4.24
RBFOX1-209ENST00000547427 PBRM1Q86U86 1689 aa41.56■■■■■ 4.24
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RBFOX1-209ENST00000547427 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.55■■■■■ 4.24
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RBFOX1-209ENST00000547427 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.7■■■■■ 4.11
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RBFOX1-209ENST00000547427 ARAP1Q96P48 1450 aa40.65■■■■■ 4.1
RBFOX1-209ENST00000547427 SHROOM2Q13796 1616 aa40.56■■■■■ 4.08
RBFOX1-209ENST00000547427 JPH4Q96JJ6 628 aa40.48■■■■■ 4.07
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