RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547188.1

PRDM4-202, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 3

Gene PRDM4, Length 640 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-202ENST00000547188 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.91■■■■■ 7.34
PRDM4-202ENST00000547188 ABCC9O60706 1549 aa56.77■■■■■ 6.68
PRDM4-202ENST00000547188 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.24■■■■■ 6.43
PRDM4-202ENST00000547188 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.57■■■■■ 6.33
PRDM4-202ENST00000547188 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.29■■■■■ 6.12
PRDM4-202ENST00000547188 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.67■■■■■ 6.02
PRDM4-202ENST00000547188 NACADO15069 1562 aa52.54■■■■■ 6
PRDM4-202ENST00000547188 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.26■■■■■ 5.96
PRDM4-202ENST00000547188 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.2■■■■■ 5.95
PRDM4-202ENST00000547188 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.87■■■■■ 5.89
PRDM4-202ENST00000547188 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.25■■■■■ 5.79
PRDM4-202ENST00000547188 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.22■■■■■ 5.79
PRDM4-202ENST00000547188 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.18■■■■■ 5.78
PRDM4-202ENST00000547188 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa51.03■■■■■ 5.76
PRDM4-202ENST00000547188 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.78■■■■■ 5.72
PRDM4-202ENST00000547188 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.68■■■■■ 5.7
PRDM4-202ENST00000547188 SCRIBQ14160 1630 aa50.39■■■■■ 5.66
PRDM4-202ENST00000547188 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.15■■■■■ 5.62
PRDM4-202ENST00000547188 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.11■■■■■ 5.61
PRDM4-202ENST00000547188 CUX2O14529 1486 aa49.37■■■■■ 5.49
PRDM4-202ENST00000547188 ERCC6Q03468 1493 aa49.06■■■■■ 5.44
PRDM4-202ENST00000547188 NCAPD3P42695 1498 aa48.53■■■■■ 5.36
PRDM4-202ENST00000547188 NESP48681 1621 aa48.4■■■■■ 5.34
PRDM4-202ENST00000547188 TRIM41Q8WV44 630 aa48.33■■■■■ 5.33
PRDM4-202ENST00000547188 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.23■■■■■ 5.31
PRDM4-202ENST00000547188 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.11■■■■■ 5.29
PRDM4-202ENST00000547188 HMGXB3Q12766 1538 aa48.03■■■■■ 5.28
PRDM4-202ENST00000547188 SMARCA2P51531 1590 aa47.96■■■■■ 5.27
PRDM4-202ENST00000547188 SMARCA4P51532 1647 aa47.85■■■■■ 5.25
PRDM4-202ENST00000547188 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.73■■■■■ 5.23
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PRDM4-202ENST00000547188 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.67■■■■■ 5.22
PRDM4-202ENST00000547188 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.43■■■■■ 5.18
PRDM4-202ENST00000547188 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.34■■■■■ 5.17
PRDM4-202ENST00000547188 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.3■■■■■ 5.16
PRDM4-202ENST00000547188 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.15■■■■■ 5.14
PRDM4-202ENST00000547188 WDR62O43379 1518 aa47.08■■■■■ 5.13
PRDM4-202ENST00000547188 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.01■■■■■ 5.12
PRDM4-202ENST00000547188 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.98■■■■■ 5.11
PRDM4-202ENST00000547188 OSCARQ8IYS5 282 aa46.93■■■■■ 5.1
PRDM4-202ENST00000547188 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.68■■■■■ 5.06
PRDM4-202ENST00000547188 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.56■■■■■ 5.04
PRDM4-202ENST00000547188 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.56■■■■■ 5.04
PRDM4-202ENST00000547188 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.56■■■■■ 5.04
PRDM4-202ENST00000547188 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.52■■■■■ 5.04
PRDM4-202ENST00000547188 WIZO95785 1651 aa46.41■■■■■ 5.02
PRDM4-202ENST00000547188 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.27■■■■■ 5
PRDM4-202ENST00000547188 ARHGEF11O15085 1522 aa46.22■■■■■ 4.99
PRDM4-202ENST00000547188 CFTRP13569 1480 aa46.17■■■■■ 4.98
PRDM4-202ENST00000547188 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.02■■■■■ 4.96
PRDM4-202ENST00000547188 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.99■■■■■ 4.95
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.96■■■■■ 4.95
PRDM4-202ENST00000547188 IFT140Q96RY7 1462 aa45.77■■■■■ 4.92
PRDM4-202ENST00000547188 ARAP1Q96P48 1450 aa45.68■■■■■ 4.9
PRDM4-202ENST00000547188 PRDM2Q13029 1718 aa45.67■■■■■ 4.9
PRDM4-202ENST00000547188 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP45.66■■■■■ 4.9
PRDM4-202ENST00000547188 CHD1O14646 1710 aa45.61■■■■■ 4.89
PRDM4-202ENST00000547188 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.6■■■■■ 4.89
PRDM4-202ENST00000547188 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.6■■■■■ 4.89
PRDM4-202ENST00000547188 TOPBP1Q92547 1522 aa45.49■■■■■ 4.87
PRDM4-202ENST00000547188 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.45■■■■■ 4.87
PRDM4-202ENST00000547188 FBLN2P98095 1184 aa45.38■■■■■ 4.86
PRDM4-202ENST00000547188 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.36■■■■■ 4.854e-6■■■■■ 31
PRDM4-202ENST00000547188 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.2■■■■■ 4.83
PRDM4-202ENST00000547188 ABCC8Q09428 1581 aa45.18■■■■■ 4.82
PRDM4-202ENST00000547188 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.17■■■■■ 4.82
PRDM4-202ENST00000547188 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.15■■■■■ 4.82
PRDM4-202ENST00000547188 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.94■■■■■ 4.78
PRDM4-202ENST00000547188 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.93■■■■■ 4.78
PRDM4-202ENST00000547188 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.87■■■■■ 4.77
PRDM4-202ENST00000547188 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.86■■■■■ 4.77
PRDM4-202ENST00000547188 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.82■■■■■ 4.77
PRDM4-202ENST00000547188 SYNJ1O43426 1573 aa44.77■■■■■ 4.76
PRDM4-202ENST00000547188 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.73■■■■■ 4.75
PRDM4-202ENST00000547188 SOGA1O94964 1423 aa44.7■■■■■ 4.75
PRDM4-202ENST00000547188 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.59■■■■■ 4.73
PRDM4-202ENST00000547188 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.55■■■■■ 4.72
PRDM4-202ENST00000547188 WDR97A6NE52 1622 aa44.5■■■■■ 4.71
PRDM4-202ENST00000547188 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.47■■■■■ 4.71
PRDM4-202ENST00000547188 SYNJ2O15056 1496 aa44.46■■■■■ 4.71
PRDM4-202ENST00000547188 GRIN2BQ13224 1484 aa44.44■■■■■ 4.7
PRDM4-202ENST00000547188 PBRM1Q86U86 1689 aa44.27■■■■■ 4.68
PRDM4-202ENST00000547188 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.26■■■■■ 4.68
PRDM4-202ENST00000547188 CUX1P39880 1505 aa44.22■■■■■ 4.67
PRDM4-202ENST00000547188 KIF13AQ9H1H9 1805 aa44.1■■■■■ 4.65
PRDM4-202ENST00000547188 CEP170Q5SW79 1584 aa43.97■■■■■ 4.63
PRDM4-202ENST00000547188 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.92■■■■■ 4.62
PRDM4-202ENST00000547188 GRIN2AQ12879 1464 aa43.89■■■■■ 4.62
PRDM4-202ENST00000547188 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP43.88■■■■■ 4.62
PRDM4-202ENST00000547188 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.82■■■■■ 4.61
PRDM4-202ENST00000547188 NUP160Q12769 1436 aa43.77■■■■■ 4.6
PRDM4-202ENST00000547188 SHROOM2Q13796 1616 aa43.77■■■■■ 4.6
PRDM4-202ENST00000547188 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa43.71■■■■■ 4.59
PRDM4-202ENST00000547188 ADAMTS12P58397 1594 aa43.71■■■■■ 4.59
PRDM4-202ENST00000547188 FAM69CQ0P6D2 419 aa43.65■■■■■ 4.58
PRDM4-202ENST00000547188 ABCC10Q5T3U5 1492 aa43.55■■■■■ 4.56
PRDM4-202ENST00000547188 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.53■■■■■ 4.56
PRDM4-202ENST00000547188 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.47■■■■■ 4.55
PRDM4-202ENST00000547188 KDM6BO15054 1643 aa43.46■■■■■ 4.55
PRDM4-202ENST00000547188 DIP2BQ9P265 1576 aa43.45■■■■■ 4.55
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