RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546935.5

CSRNP2-202, Transcript of cysteine and serine rich nuclear protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene CSRNP2, Length 681 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP2-202ENST00000546935 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.96■■■■■ 5.75
CSRNP2-202ENST00000546935 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.48■■■■■ 4.87
CSRNP2-202ENST00000546935 ABCC9O60706 1549 aa44.63■■■■■ 4.73
CSRNP2-202ENST00000546935 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.94■■■■■ 4.46
CSRNP2-202ENST00000546935 NACADO15069 1562 aa42.82■■■■■ 4.45
CSRNP2-202ENST00000546935 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.73■■■■■ 4.43
CSRNP2-202ENST00000546935 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.55■■■■■ 4.4
CSRNP2-202ENST00000546935 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.32■■■■■ 4.37
CSRNP2-202ENST00000546935 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.28■■■■■ 4.36
CSRNP2-202ENST00000546935 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.86■■■■■ 4.29
CSRNP2-202ENST00000546935 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.59■■■■■ 4.25
CSRNP2-202ENST00000546935 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.54■■■■■ 4.24
CSRNP2-202ENST00000546935 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.37■■■■■ 4.21
CSRNP2-202ENST00000546935 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.25■■■■■ 4.19
CSRNP2-202ENST00000546935 SCRIBQ14160 1630 aa41.25■■■■■ 4.19
CSRNP2-202ENST00000546935 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.54■■■■■ 4.08
CSRNP2-202ENST00000546935 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.43■■■■■ 4.06
CSRNP2-202ENST00000546935 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.23■■■■■ 4.03
CSRNP2-202ENST00000546935 SMARCA4P51532 1647 aa39.52■■■■□ 3.92
CSRNP2-202ENST00000546935 NCAPD3P42695 1498 aa39.49■■■■□ 3.91
CSRNP2-202ENST00000546935 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.46■■■■□ 3.91
CSRNP2-202ENST00000546935 SMARCA2P51531 1590 aa39.41■■■■□ 3.9
CSRNP2-202ENST00000546935 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.39■■■■□ 3.9
CSRNP2-202ENST00000546935 HMGXB3Q12766 1538 aa39.3■■■■□ 3.88
CSRNP2-202ENST00000546935 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.28■■■■□ 3.88
CSRNP2-202ENST00000546935 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.26■■■■□ 3.88
CSRNP2-202ENST00000546935 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.25■■■■□ 3.87
CSRNP2-202ENST00000546935 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.05■■■■□ 3.84
CSRNP2-202ENST00000546935 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39■■■■□ 3.83
CSRNP2-202ENST00000546935 WIZO95785 1651 aa38.94■■■■□ 3.82
CSRNP2-202ENST00000546935 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.6■■■■□ 3.77
CSRNP2-202ENST00000546935 ERCC6Q03468 1493 aa38.57■■■■□ 3.76
CSRNP2-202ENST00000546935 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.53■■■■□ 3.76
CSRNP2-202ENST00000546935 NESP48681 1621 aa38.49■■■■□ 3.75
CSRNP2-202ENST00000546935 CUX2O14529 1486 aa38.44■■■■□ 3.74
CSRNP2-202ENST00000546935 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.27■■■■□ 3.72
CSRNP2-202ENST00000546935 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.26■■■■□ 3.72
CSRNP2-202ENST00000546935 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.14■■■■□ 3.7
CSRNP2-202ENST00000546935 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.1■■■■□ 3.69
CSRNP2-202ENST00000546935 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.09■■■■□ 3.69
CSRNP2-202ENST00000546935 CFTRP13569 1480 aa38■■■■□ 3.67
CSRNP2-202ENST00000546935 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.87■■■■□ 3.65
CSRNP2-202ENST00000546935 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.84■■■■□ 3.65
CSRNP2-202ENST00000546935 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.81■■■■□ 3.64
CSRNP2-202ENST00000546935 WDR62O43379 1518 aa37.79■■■■□ 3.64
CSRNP2-202ENST00000546935 PRDM2Q13029 1718 aa37.7■■■■□ 3.63
CSRNP2-202ENST00000546935 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.6■■■■□ 3.61
CSRNP2-202ENST00000546935 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.44■■■■□ 3.58
CSRNP2-202ENST00000546935 ABCC8Q09428 1581 aa37.25■■■■□ 3.55
CSRNP2-202ENST00000546935 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.21■■■■□ 3.55
CSRNP2-202ENST00000546935 TOPBP1Q92547 1522 aa37.16■■■■□ 3.54
CSRNP2-202ENST00000546935 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.13■■■■□ 3.53
CSRNP2-202ENST00000546935 IFT140Q96RY7 1462 aa37.08■■■■□ 3.53
CSRNP2-202ENST00000546935 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.95■■■■□ 3.51
CSRNP2-202ENST00000546935 SYNJ1O43426 1573 aa36.86■■■■□ 3.49
CSRNP2-202ENST00000546935 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.83■■■■□ 3.49
CSRNP2-202ENST00000546935 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.82■■■■□ 3.49
CSRNP2-202ENST00000546935 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.82■■■■□ 3.48
CSRNP2-202ENST00000546935 TRIM41Q8WV44 630 aa36.82■■■■□ 3.48
CSRNP2-202ENST00000546935 TOP2BQ02880 1626 aa36.81■■■■□ 3.48
CSRNP2-202ENST00000546935 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.81■■■■□ 3.48
CSRNP2-202ENST00000546935 CUX1P39880 1505 aa36.79■■■■□ 3.48
CSRNP2-202ENST00000546935 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
CSRNP2-202ENST00000546935 WDR97A6NE52 1622 aa36.67■■■■□ 3.46
CSRNP2-202ENST00000546935 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.65■■■■□ 3.46
CSRNP2-202ENST00000546935 OSCARQ8IYS5 282 aa36.64■■■■□ 3.46
CSRNP2-202ENST00000546935 SOGA1O94964 1423 aa36.63■■■■□ 3.45
CSRNP2-202ENST00000546935 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.56■■■■□ 3.44
CSRNP2-202ENST00000546935 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.55■■■■□ 3.44
CSRNP2-202ENST00000546935 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
CSRNP2-202ENST00000546935 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.35■■■■□ 3.41
CSRNP2-202ENST00000546935 GRIN2BQ13224 1484 aa36.32■■■■□ 3.41
CSRNP2-202ENST00000546935 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
CSRNP2-202ENST00000546935 CHD1O14646 1710 aa36.31■■■■□ 3.4
CSRNP2-202ENST00000546935 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.26■■■■□ 3.4
CSRNP2-202ENST00000546935 EEA1Q15075 1411 aa36.24■■■■□ 3.39
CSRNP2-202ENST00000546935 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.24■■■■□ 3.39
CSRNP2-202ENST00000546935 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.23■■■■□ 3.39
CSRNP2-202ENST00000546935 PBRM1Q86U86 1689 aa36.17■■■■□ 3.38
CSRNP2-202ENST00000546935 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.14■■■■□ 3.38
CSRNP2-202ENST00000546935 SYNJ2O15056 1496 aa36.14■■■■□ 3.38
CSRNP2-202ENST00000546935 FBLN2P98095 1184 aa36.11■■■■□ 3.37
CSRNP2-202ENST00000546935 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.1■■■■□ 3.37
CSRNP2-202ENST00000546935 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.1■■■■□ 3.37
CSRNP2-202ENST00000546935 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.1■■■■□ 3.37
CSRNP2-202ENST00000546935 ARHGEF11O15085 1522 aa36.08■■■■□ 3.37
CSRNP2-202ENST00000546935 KIF27Q86VH2 1401 aa36.08■■■■□ 3.37
CSRNP2-202ENST00000546935 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
CSRNP2-202ENST00000546935 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.99■■■■□ 3.35
CSRNP2-202ENST00000546935 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.98■■■■□ 3.35
CSRNP2-202ENST00000546935 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.93■■■■□ 3.34
CSRNP2-202ENST00000546935 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.93■■■■□ 3.34
CSRNP2-202ENST00000546935 ADAMTS12P58397 1594 aa35.91■■■■□ 3.34
CSRNP2-202ENST00000546935 GRIN2AQ12879 1464 aa35.84■■■■□ 3.33
CSRNP2-202ENST00000546935 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.83■■■■□ 3.33
CSRNP2-202ENST00000546935 KIF21BO75037 1637 aa35.81■■■■□ 3.32
CSRNP2-202ENST00000546935 IGF1RP08069 1367 aa35.79■■■■□ 3.32
CSRNP2-202ENST00000546935 ARAP1Q96P48 1450 aa35.75■■■■□ 3.31
CSRNP2-202ENST00000546935 PRXQ9BXM0 1461 aa35.75■■■■□ 3.31
CSRNP2-202ENST00000546935 NUP160Q12769 1436 aa35.73■■■■□ 3.31
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