RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546907.1

TPCN1-208, Transcript of two pore segment channel 1, humanhuman

TSL 4

Gene TPCN1, Length 565 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1-208ENST00000546907 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.82■■■■□ 3.64
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TPCN1-208ENST00000546907 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.71■■■□□ 2.67
TPCN1-208ENST00000546907 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.6■■■□□ 2.65
TPCN1-208ENST00000546907 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.51■■■□□ 2.63
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TPCN1-208ENST00000546907 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.28■■■□□ 2.6
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TPCN1-208ENST00000546907 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.26■■■□□ 2.44
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TPCN1-208ENST00000546907 SMARCA2P51531 1590 aa29.39■■■□□ 2.29
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TPCN1-208ENST00000546907 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
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TPCN1-208ENST00000546907 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.82■■■□□ 2.2
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TPCN1-208ENST00000546907 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.59■■■□□ 2.17
TPCN1-208ENST00000546907 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
TPCN1-208ENST00000546907 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.57■■■□□ 2.16
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TPCN1-208ENST00000546907 CFTRP13569 1480 aa28.31■■■□□ 2.12
TPCN1-208ENST00000546907 WDR62O43379 1518 aa28.31■■■□□ 2.12
TPCN1-208ENST00000546907 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.29■■■□□ 2.12
TPCN1-208ENST00000546907 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.27■■■□□ 2.12
TPCN1-208ENST00000546907 PRDM2Q13029 1718 aa28.2■■■□□ 2.1
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TPCN1-208ENST00000546907 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
TPCN1-208ENST00000546907 TOPBP1Q92547 1522 aa27.77■■■□□ 2.04
TPCN1-208ENST00000546907 ABCC8Q09428 1581 aa27.72■■■□□ 2.03
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TPCN1-208ENST00000546907 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
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TPCN1-208ENST00000546907 CHD1O14646 1710 aa27.35■■□□□ 1.97
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TPCN1-208ENST00000546907 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.27■■□□□ 1.96
TPCN1-208ENST00000546907 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.27■■□□□ 1.96
TPCN1-208ENST00000546907 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
TPCN1-208ENST00000546907 ARHGEF11O15085 1522 aa27.19■■□□□ 1.94
TPCN1-208ENST00000546907 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.15■■□□□ 1.94
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TPCN1-208ENST00000546907 GRIN2BQ13224 1484 aa27.11■■□□□ 1.93
TPCN1-208ENST00000546907 PBRM1Q86U86 1689 aa27.11■■□□□ 1.93
TPCN1-208ENST00000546907 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
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TPCN1-208ENST00000546907 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.05■■□□□ 1.92
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TPCN1-208ENST00000546907 TOP2BQ02880 1626 aa27.01■■□□□ 1.92
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TPCN1-208ENST00000546907 SYNJ1O43426 1573 aa26.99■■□□□ 1.91
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TPCN1-208ENST00000546907 ARAP1Q96P48 1450 aa26.93■■□□□ 1.9
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TPCN1-208ENST00000546907 ADAMTS12P58397 1594 aa26.83■■□□□ 1.89
TPCN1-208ENST00000546907 GRIN2AQ12879 1464 aa26.77■■□□□ 1.88
TPCN1-208ENST00000546907 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.75■■□□□ 1.87
TPCN1-208ENST00000546907 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.7■■□□□ 1.86
TPCN1-208ENST00000546907 CEP170Q5SW79 1584 aa26.68■■□□□ 1.86
TPCN1-208ENST00000546907 NUP160Q12769 1436 aa26.67■■□□□ 1.86
TPCN1-208ENST00000546907 SHROOM2Q13796 1616 aa26.57■■□□□ 1.84
TPCN1-208ENST00000546907 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.57■■□□□ 1.84
TPCN1-208ENST00000546907 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
TPCN1-208ENST00000546907 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.44■■□□□ 1.82
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TPCN1-208ENST00000546907 CUL7Q14999 1698 aa26.43■■□□□ 1.82
TPCN1-208ENST00000546907 IGF1RP08069 1367 aa26.38■■□□□ 1.81
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