RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546585.1

CS-203, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,803 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-203ENST00000546585 NISCHQ9Y2I1 1504 aa15.74■□□□□ 0.11
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CS-203ENST00000546585 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
CS-203ENST00000546585 CHIC1Q5VXU3 224 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-203ENST00000546585 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa13.04□□□□□ -0.32
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CS-203ENST00000546585 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
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CS-203ENST00000546585 DCAF8L2P0C7V8 631 aa12.81□□□□□ -0.36
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CS-203ENST00000546585 SCRIBQ14160 1630 aa12.57□□□□□ -0.4
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CS-203ENST00000546585 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
CS-203ENST00000546585 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
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CS-203ENST00000546585 MROH2BQ7Z745 1585 aa12.19□□□□□ -0.46
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CS-203ENST00000546585 PEG3Q9GZU2 1588 aa11.99□□□□□ -0.49
CS-203ENST00000546585 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
CS-203ENST00000546585 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
CS-203ENST00000546585 SMARCA2P51531 1590 aa11.91□□□□□ -0.5
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CS-203ENST00000546585 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa11.83□□□□□ -0.52
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CS-203ENST00000546585 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
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CS-203ENST00000546585 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
CS-203ENST00000546585 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa11.49□□□□□ -0.57
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CS-203ENST00000546585 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP11.47□□□□□ -0.57
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CS-203ENST00000546585 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa11.41□□□□□ -0.58
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CS-203ENST00000546585 GOLGA3Q08378 1498 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-203ENST00000546585 FGD5Q6ZNL6 1462 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-203ENST00000546585 PRXQ9BXM0 1461 aa11.19□□□□□ -0.62
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CS-203ENST00000546585 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa11.18□□□□□ -0.62
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CS-203ENST00000546585 WDR97A6NE52 1622 aa11.17□□□□□ -0.62
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CS-203ENST00000546585 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
CS-203ENST00000546585 CEP162Q5TB80 1403 aa11.16□□□□□ -0.62
CS-203ENST00000546585 ERCC6Q03468 1493 aa11.15□□□□□ -0.62
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CS-203ENST00000546585 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa11.12□□□□□ -0.63
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CS-203ENST00000546585 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
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CS-203ENST00000546585 GRIN2BQ13224 1484 aa10.93□□□□□ -0.66
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