RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546157.1

LRTM2-211, Transcript of leucine rich repeats and transmembrane domains 2, humanhuman

TSL 4

Gene LRTM2, Length 560 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRTM2-211ENST00000546157 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.48■■■■■ 6.15
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LRTM2-211ENST00000546157 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.38■■■■■ 4.86
LRTM2-211ENST00000546157 NACADO15069 1562 aa45.15■■■■■ 4.82
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LRTM2-211ENST00000546157 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.63■■■■■ 4.73
LRTM2-211ENST00000546157 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.5■■■■■ 4.71
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LRTM2-211ENST00000546157 SCRIBQ14160 1630 aa43.66■■■■■ 4.58
LRTM2-211ENST00000546157 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.46■■■■■ 4.55
LRTM2-211ENST00000546157 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.99■■■■■ 4.47
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LRTM2-211ENST00000546157 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.76■■■■■ 4.44
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LRTM2-211ENST00000546157 NCAPD3P42695 1498 aa41.66■■■■■ 4.26
LRTM2-211ENST00000546157 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.6■■■■■ 4.25
LRTM2-211ENST00000546157 SMARCA2P51531 1590 aa41.49■■■■■ 4.23
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LRTM2-211ENST00000546157 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.27■■■■■ 4.2
LRTM2-211ENST00000546157 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.25■■■■■ 4.19
LRTM2-211ENST00000546157 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
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LRTM2-211ENST00000546157 ERCC6Q03468 1493 aa40.96■■■■■ 4.15
LRTM2-211ENST00000546157 CUX2O14529 1486 aa40.8■■■■■ 4.12
LRTM2-211ENST00000546157 WIZO95785 1651 aa40.8■■■■■ 4.12
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LRTM2-211ENST00000546157 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.39■■■■■ 4.06
LRTM2-211ENST00000546157 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.38■■■■■ 4.05
LRTM2-211ENST00000546157 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.03
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LRTM2-211ENST00000546157 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.97■■■■□ 3.99
LRTM2-211ENST00000546157 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.96■■■■□ 3.99
LRTM2-211ENST00000546157 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.79■■■■□ 3.96
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LRTM2-211ENST00000546157 TOPBP1Q92547 1522 aa39.26■■■■□ 3.88
LRTM2-211ENST00000546157 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.16■■■■□ 3.86
LRTM2-211ENST00000546157 IFT140Q96RY7 1462 aa39.14■■■■□ 3.86
LRTM2-211ENST00000546157 ABCC8Q09428 1581 aa39.13■■■■□ 3.85
LRTM2-211ENST00000546157 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.1■■■■□ 3.85
LRTM2-211ENST00000546157 OSCARQ8IYS5 282 aa38.94■■■■□ 3.82
LRTM2-211ENST00000546157 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.93■■■■□ 3.82
LRTM2-211ENST00000546157 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.93■■■■□ 3.82
LRTM2-211ENST00000546157 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.89■■■■□ 3.82
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LRTM2-211ENST00000546157 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.74■■■■□ 3.79
LRTM2-211ENST00000546157 CUX1P39880 1505 aa38.73■■■■□ 3.79
LRTM2-211ENST00000546157 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.69■■■■□ 3.78
LRTM2-211ENST00000546157 SOGA1O94964 1423 aa38.66■■■■□ 3.78
LRTM2-211ENST00000546157 CHD1O14646 1710 aa38.61■■■■□ 3.77
LRTM2-211ENST00000546157 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.57■■■■□ 3.76
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LRTM2-211ENST00000546157 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.52■■■■□ 3.76
LRTM2-211ENST00000546157 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.52■■■■□ 3.76
LRTM2-211ENST00000546157 WDR97A6NE52 1622 aa38.5■■■■□ 3.75
LRTM2-211ENST00000546157 ARHGEF11O15085 1522 aa38.4■■■■□ 3.74
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LRTM2-211ENST00000546157 FBLN2P98095 1184 aa38.38■■■■□ 3.73
LRTM2-211ENST00000546157 GRIN2BQ13224 1484 aa38.3■■■■□ 3.72
LRTM2-211ENST00000546157 PBRM1Q86U86 1689 aa38.28■■■■□ 3.72
LRTM2-211ENST00000546157 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.28■■■■□ 3.72
LRTM2-211ENST00000546157 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.26■■■■□ 3.72
LRTM2-211ENST00000546157 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.23■■■■□ 3.71
LRTM2-211ENST00000546157 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.23■■■■□ 3.71
LRTM2-211ENST00000546157 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.22■■■■□ 3.71
LRTM2-211ENST00000546157 TOP2BQ02880 1626 aa38.19■■■■□ 3.7
LRTM2-211ENST00000546157 SYNJ1O43426 1573 aa38.18■■■■□ 3.7
LRTM2-211ENST00000546157 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.15■■■■□ 3.7
LRTM2-211ENST00000546157 SYNJ2O15056 1496 aa38.15■■■■□ 3.7
LRTM2-211ENST00000546157 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.14■■■■□ 3.7
LRTM2-211ENST00000546157 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.13■■■■□ 3.69
LRTM2-211ENST00000546157 ARAP1Q96P48 1450 aa38.06■■■■□ 3.68
LRTM2-211ENST00000546157 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.03■■■■□ 3.68
LRTM2-211ENST00000546157 ADAMTS12P58397 1594 aa37.89■■■■□ 3.66
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LRTM2-211ENST00000546157 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.78■■■■□ 3.64
LRTM2-211ENST00000546157 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.74■■■■□ 3.63
LRTM2-211ENST00000546157 CEP170Q5SW79 1584 aa37.73■■■■□ 3.63
LRTM2-211ENST00000546157 NUP160Q12769 1436 aa37.7■■■■□ 3.62
LRTM2-211ENST00000546157 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.6■■■■□ 3.61
LRTM2-211ENST00000546157 SHROOM2Q13796 1616 aa37.54■■■■□ 3.6
LRTM2-211ENST00000546157 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.48■■■■□ 3.59
LRTM2-211ENST00000546157 KIF27Q86VH2 1401 aa37.38■■■■□ 3.57
LRTM2-211ENST00000546157 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.36■■■■□ 3.57
LRTM2-211ENST00000546157 IGF1RP08069 1367 aa37.35■■■■□ 3.57
LRTM2-211ENST00000546157 CUL7Q14999 1698 aa37.31■■■■□ 3.56
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