RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546023.1

TCP1-217, Transcript of t-complex 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TCP1, Length 1,135 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1-217ENST00000546023 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.11■■■■■ 7.53
TCP1-217ENST00000546023 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.41■■■■■ 6.46
TCP1-217ENST00000546023 ABCC9O60706 1549 aa54.29■■■■■ 6.28
TCP1-217ENST00000546023 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.2■■■■■ 5.95
TCP1-217ENST00000546023 NACADO15069 1562 aa52.07■■■■■ 5.93
TCP1-217ENST00000546023 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.8■■■■■ 5.88
TCP1-217ENST00000546023 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.75■■■■■ 5.88
TCP1-217ENST00000546023 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.69■■■■■ 5.87
TCP1-217ENST00000546023 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.41■■■■■ 5.82
TCP1-217ENST00000546023 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.03■■■■■ 5.76
TCP1-217ENST00000546023 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.6■■■■■ 5.69
TCP1-217ENST00000546023 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.59■■■■■ 5.69
TCP1-217ENST00000546023 SCRIBQ14160 1630 aa50.51■■■■■ 5.68
TCP1-217ENST00000546023 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.13■■■■■ 5.62
TCP1-217ENST00000546023 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.84■■■■■ 5.57
TCP1-217ENST00000546023 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.3■■■■■ 5.48
TCP1-217ENST00000546023 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.13■■■■■ 5.46
TCP1-217ENST00000546023 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.81■■■■■ 5.4
TCP1-217ENST00000546023 SMARCA4P51532 1647 aa48.29■■■■■ 5.32
TCP1-217ENST00000546023 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.19■■■■■ 5.31
TCP1-217ENST00000546023 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48■■■■■ 5.27
TCP1-217ENST00000546023 SMARCA2P51531 1590 aa48■■■■■ 5.27
TCP1-217ENST00000546023 NCAPD3P42695 1498 aa47.99■■■■■ 5.27
TCP1-217ENST00000546023 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.86■■■■■ 5.25
TCP1-217ENST00000546023 HMGXB3Q12766 1538 aa47.84■■■■■ 5.25
TCP1-217ENST00000546023 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.81■■■■■ 5.24
TCP1-217ENST00000546023 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.65■■■■■ 5.22
TCP1-217ENST00000546023 WIZO95785 1651 aa47.35■■■■■ 5.17
TCP1-217ENST00000546023 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.21■■■■■ 5.15
TCP1-217ENST00000546023 NESP48681 1621 aa46.92■■■■■ 5.1
TCP1-217ENST00000546023 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.89■■■■■ 5.1
TCP1-217ENST00000546023 ERCC6Q03468 1493 aa46.85■■■■■ 5.09
TCP1-217ENST00000546023 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.84■■■■■ 5.09
TCP1-217ENST00000546023 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.56■■■■■ 5.04
TCP1-217ENST00000546023 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.46■■■■■ 5.03
TCP1-217ENST00000546023 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.44■■■■■ 5.02
TCP1-217ENST00000546023 CUX2O14529 1486 aa46.43■■■■■ 5.02
TCP1-217ENST00000546023 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.35■■■■■ 5.01
TCP1-217ENST00000546023 CFTRP13569 1480 aa46.29■■■■■ 5
TCP1-217ENST00000546023 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.24■■■■■ 4.99
TCP1-217ENST00000546023 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.09■■■■■ 4.97
TCP1-217ENST00000546023 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.09■■■■■ 4.97
TCP1-217ENST00000546023 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.06■■■■■ 4.96
TCP1-217ENST00000546023 PRDM2Q13029 1718 aa46.06■■■■■ 4.96
TCP1-217ENST00000546023 WDR62O43379 1518 aa45.93■■■■■ 4.94
TCP1-217ENST00000546023 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.78■■■■■ 4.92
TCP1-217ENST00000546023 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.64■■■■■ 4.9
TCP1-217ENST00000546023 TOPBP1Q92547 1522 aa45.34■■■■■ 4.85
TCP1-217ENST00000546023 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.32■■■■■ 4.85
TCP1-217ENST00000546023 ABCC8Q09428 1581 aa45.29■■■■■ 4.84
TCP1-217ENST00000546023 IFT140Q96RY7 1462 aa45.1■■■■■ 4.81
TCP1-217ENST00000546023 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.06■■■■■ 4.8
TCP1-217ENST00000546023 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.95■■■■■ 4.79
TCP1-217ENST00000546023 CUX1P39880 1505 aa44.93■■■■■ 4.78
TCP1-217ENST00000546023 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.89■■■■■ 4.78
TCP1-217ENST00000546023 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.88■■■■■ 4.78
TCP1-217ENST00000546023 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.82■■■■■ 4.76
TCP1-217ENST00000546023 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.81■■■■■ 4.76
TCP1-217ENST00000546023 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.71■■■■■ 4.75
TCP1-217ENST00000546023 SOGA1O94964 1423 aa44.68■■■■■ 4.74
TCP1-217ENST00000546023 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.57■■■■■ 4.736e-9■■■□□ 17.4
TCP1-217ENST00000546023 WDR97A6NE52 1622 aa44.57■■■■■ 4.72
TCP1-217ENST00000546023 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.56■■■■■ 4.72
TCP1-217ENST00000546023 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.54■■■■■ 4.72
TCP1-217ENST00000546023 TOP2BQ02880 1626 aa44.52■■■■■ 4.72
TCP1-217ENST00000546023 SYNJ1O43426 1573 aa44.5■■■■■ 4.71
TCP1-217ENST00000546023 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.45■■■■■ 4.71
TCP1-217ENST00000546023 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.36■■■■■ 4.69
TCP1-217ENST00000546023 OSCARQ8IYS5 282 aa44.31■■■■■ 4.68
TCP1-217ENST00000546023 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.27■■■■■ 4.68
TCP1-217ENST00000546023 CHD1O14646 1710 aa44.26■■■■■ 4.68
TCP1-217ENST00000546023 GRIN2BQ13224 1484 aa44.25■■■■■ 4.67
TCP1-217ENST00000546023 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.25■■■■■ 4.67
TCP1-217ENST00000546023 PBRM1Q86U86 1689 aa44.23■■■■■ 4.67
TCP1-217ENST00000546023 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.21■■■■■ 4.67
TCP1-217ENST00000546023 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.18■■■■■ 4.66
TCP1-217ENST00000546023 FBLN2P98095 1184 aa44.03■■■■■ 4.64
TCP1-217ENST00000546023 SYNJ2O15056 1496 aa44■■■■■ 4.63
TCP1-217ENST00000546023 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.88■■■■■ 4.62
TCP1-217ENST00000546023 ADAMTS12P58397 1594 aa43.88■■■■■ 4.61
TCP1-217ENST00000546023 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.84■■■■■ 4.61
TCP1-217ENST00000546023 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.79■■■■■ 4.6
TCP1-217ENST00000546023 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.79■■■■■ 4.6
TCP1-217ENST00000546023 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.79■■■■■ 4.6
TCP1-217ENST00000546023 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.77■■■■■ 4.6
TCP1-217ENST00000546023 ARHGEF11O15085 1522 aa43.76■■■■■ 4.6
TCP1-217ENST00000546023 GRIN2AQ12879 1464 aa43.7■■■■■ 4.59
TCP1-217ENST00000546023 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.69■■■■■ 4.58
TCP1-217ENST00000546023 KIF27Q86VH2 1401 aa43.63■■■■■ 4.57
TCP1-217ENST00000546023 TRIM41Q8WV44 630 aa43.55■■■■■ 4.56
TCP1-217ENST00000546023 CEP170Q5SW79 1584 aa43.52■■■■■ 4.56
TCP1-217ENST00000546023 NUP160Q12769 1436 aa43.49■■■■■ 4.55
TCP1-217ENST00000546023 CUL7Q14999 1698 aa43.46■■■■■ 4.55
TCP1-217ENST00000546023 IGF1RP08069 1367 aa43.39■■■■■ 4.54
TCP1-217ENST00000546023 ARAP1Q96P48 1450 aa43.38■■■■■ 4.54
TCP1-217ENST00000546023 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.25■■■■■ 4.51
TCP1-217ENST00000546023 SHROOM2Q13796 1616 aa43.24■■■■■ 4.51
TCP1-217ENST00000546023 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.2■■■■■ 4.51
TCP1-217ENST00000546023 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.15■■■■■ 4.5
TCP1-217ENST00000546023 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.11■■■■■ 4.49
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