RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545829.1

PRB2-202, Transcript of proline rich protein BstNI subfamily 2, humanhuman

TSL 4

Gene PRB2, Length 406 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB2-202ENST00000545829 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.88■■■■■ 7.02
PRB2-202ENST00000545829 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.77■■■■■ 6.04
PRB2-202ENST00000545829 ABCC9O60706 1549 aa52.36■■■■■ 5.97
PRB2-202ENST00000545829 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.02■■■■■ 5.6
PRB2-202ENST00000545829 NACADO15069 1562 aa49.78■■■■■ 5.56
PRB2-202ENST00000545829 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.31■■■■■ 5.48
PRB2-202ENST00000545829 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.25■■■■■ 5.48
PRB2-202ENST00000545829 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.97■■■■■ 5.43
PRB2-202ENST00000545829 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.9■■■■■ 5.42
PRB2-202ENST00000545829 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.89■■■■■ 5.42
PRB2-202ENST00000545829 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.73■■■■■ 5.39
PRB2-202ENST00000545829 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.73■■■■■ 5.39
PRB2-202ENST00000545829 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.64■■■■■ 5.38
PRB2-202ENST00000545829 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.01■■■■■ 5.28
PRB2-202ENST00000545829 SCRIBQ14160 1630 aa47.99■■■■■ 5.27
PRB2-202ENST00000545829 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.38■■■■■ 5.17
PRB2-202ENST00000545829 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.37■■■■■ 5.17
PRB2-202ENST00000545829 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.15■■■■■ 5.14
PRB2-202ENST00000545829 NCAPD3P42695 1498 aa45.96■■■■■ 4.95
PRB2-202ENST00000545829 SMARCA4P51532 1647 aa45.88■■■■■ 4.94
PRB2-202ENST00000545829 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.84■■■■■ 4.93
PRB2-202ENST00000545829 SMARCA2P51531 1590 aa45.72■■■■■ 4.91
PRB2-202ENST00000545829 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.67■■■■■ 4.9
PRB2-202ENST00000545829 HMGXB3Q12766 1538 aa45.67■■■■■ 4.9
PRB2-202ENST00000545829 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.5■■■■■ 4.87
PRB2-202ENST00000545829 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.37■■■■■ 4.85
PRB2-202ENST00000545829 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.36■■■■■ 4.85
PRB2-202ENST00000545829 ERCC6Q03468 1493 aa45.14■■■■■ 4.82
PRB2-202ENST00000545829 NESP48681 1621 aa45.1■■■■■ 4.81
PRB2-202ENST00000545829 CUX2O14529 1486 aa45.07■■■■■ 4.81
PRB2-202ENST00000545829 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.87■■■■■ 4.77
PRB2-202ENST00000545829 WIZO95785 1651 aa44.83■■■■■ 4.77
PRB2-202ENST00000545829 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.67■■■■■ 4.74
PRB2-202ENST00000545829 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.66■■■■■ 4.74
PRB2-202ENST00000545829 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.57■■■■■ 4.73
PRB2-202ENST00000545829 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.53■■■■■ 4.72
PRB2-202ENST00000545829 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.53■■■■■ 4.72
PRB2-202ENST00000545829 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.52■■■■■ 4.72
PRB2-202ENST00000545829 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.29■■■■■ 4.68
PRB2-202ENST00000545829 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.16■■■■■ 4.66
PRB2-202ENST00000545829 CFTRP13569 1480 aa44.13■■■■■ 4.65
PRB2-202ENST00000545829 WDR62O43379 1518 aa44.1■■■■■ 4.65
PRB2-202ENST00000545829 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.03■■■■■ 4.64
PRB2-202ENST00000545829 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.02■■■■■ 4.64
PRB2-202ENST00000545829 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.76■■■■■ 4.6
PRB2-202ENST00000545829 PRDM2Q13029 1718 aa43.74■■■■■ 4.59
PRB2-202ENST00000545829 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.68■■■■■ 4.58
PRB2-202ENST00000545829 TOPBP1Q92547 1522 aa43.24■■■■■ 4.51
PRB2-202ENST00000545829 IFT140Q96RY7 1462 aa43.15■■■■■ 4.5
PRB2-202ENST00000545829 ABCC8Q09428 1581 aa43.15■■■■■ 4.5
PRB2-202ENST00000545829 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.12■■■■■ 4.49
PRB2-202ENST00000545829 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.07■■■■■ 4.48
PRB2-202ENST00000545829 OSCARQ8IYS5 282 aa42.95■■■■■ 4.47
PRB2-202ENST00000545829 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.89■■■■■ 4.46
PRB2-202ENST00000545829 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.86■■■■■ 4.45
PRB2-202ENST00000545829 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.82■■■■■ 4.45
PRB2-202ENST00000545829 TRIM41Q8WV44 630 aa42.7■■■■■ 4.43
PRB2-202ENST00000545829 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.68■■■■■ 4.42
PRB2-202ENST00000545829 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.62■■■■■ 4.41
PRB2-202ENST00000545829 CUX1P39880 1505 aa42.61■■■■■ 4.41
PRB2-202ENST00000545829 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.57■■■■■ 4.41
PRB2-202ENST00000545829 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.56■■■■■ 4.4
PRB2-202ENST00000545829 SOGA1O94964 1423 aa42.56■■■■■ 4.4
PRB2-202ENST00000545829 CHD1O14646 1710 aa42.49■■■■■ 4.39
PRB2-202ENST00000545829 WDR97A6NE52 1622 aa42.47■■■■■ 4.39
PRB2-202ENST00000545829 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.47■■■■■ 4.39
PRB2-202ENST00000545829 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.47■■■■■ 4.39
PRB2-202ENST00000545829 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.47■■■■■ 4.39
PRB2-202ENST00000545829 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.43■■■■■ 4.38
PRB2-202ENST00000545829 ARHGEF11O15085 1522 aa42.36■■■■■ 4.37
PRB2-202ENST00000545829 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.26■■■■■ 4.36
PRB2-202ENST00000545829 GRIN2BQ13224 1484 aa42.2■■■■■ 4.35
PRB2-202ENST00000545829 FBLN2P98095 1184 aa42.2■■■■■ 4.35
PRB2-202ENST00000545829 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.19■■■■■ 4.34
PRB2-202ENST00000545829 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.14■■■■■ 4.34
PRB2-202ENST00000545829 PBRM1Q86U86 1689 aa42.09■■■■■ 4.33
PRB2-202ENST00000545829 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.09■■■■■ 4.33
PRB2-202ENST00000545829 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.08■■■■■ 4.33
PRB2-202ENST00000545829 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.05■■■■■ 4.32
PRB2-202ENST00000545829 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.04■■■■■ 4.32
PRB2-202ENST00000545829 SYNJ2O15056 1496 aa42.04■■■■■ 4.32
PRB2-202ENST00000545829 TOP2BQ02880 1626 aa42.02■■■■■ 4.32
PRB2-202ENST00000545829 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.99■■■■■ 4.31
PRB2-202ENST00000545829 SYNJ1O43426 1573 aa41.98■■■■■ 4.31
PRB2-202ENST00000545829 ARAP1Q96P48 1450 aa41.98■■■■■ 4.31
PRB2-202ENST00000545829 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.95■■■■■ 4.31
PRB2-202ENST00000545829 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.91■■■■■ 4.3
PRB2-202ENST00000545829 ADAMTS12P58397 1594 aa41.72■■■■■ 4.27
PRB2-202ENST00000545829 GRIN2AQ12879 1464 aa41.67■■■■■ 4.26
PRB2-202ENST00000545829 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.61■■■■■ 4.25
PRB2-202ENST00000545829 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.56■■■■■ 4.24
PRB2-202ENST00000545829 NUP160Q12769 1436 aa41.56■■■■■ 4.24
PRB2-202ENST00000545829 CEP170Q5SW79 1584 aa41.54■■■■■ 4.24
PRB2-202ENST00000545829 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.38■■■■■ 4.22
PRB2-202ENST00000545829 SHROOM2Q13796 1616 aa41.38■■■■■ 4.21
PRB2-202ENST00000545829 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.28■■■■■ 4.2
PRB2-202ENST00000545829 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.13■■■■■ 4.18
PRB2-202ENST00000545829 KIF27Q86VH2 1401 aa41.12■■■■■ 4.17
PRB2-202ENST00000545829 IGF1RP08069 1367 aa41.12■■■■■ 4.17
PRB2-202ENST00000545829 CUL7Q14999 1698 aa41.05■■■■■ 4.16
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