RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544578.1

PKD1P5-204, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting pseudogene 5, humanhuman

TSL 2

Gene PKD1P5, Length 727 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P5-204ENST00000544578 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.37■■■■■ 7.89
PKD1P5-204ENST00000544578 ABCC9O60706 1549 aa58.01■■■■■ 6.88
PKD1P5-204ENST00000544578 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.88■■■■■ 6.86
PKD1P5-204ENST00000544578 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.2■■■■■ 6.43
PKD1P5-204ENST00000544578 NACADO15069 1562 aa54.78■■■■■ 6.36
PKD1P5-204ENST00000544578 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.56■■■■■ 6.32
PKD1P5-204ENST00000544578 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.42■■■■■ 6.3
PKD1P5-204ENST00000544578 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.98■■■■■ 6.23
PKD1P5-204ENST00000544578 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.97■■■■■ 6.23
PKD1P5-204ENST00000544578 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.88■■■■■ 6.22
PKD1P5-204ENST00000544578 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.53■■■■■ 6.16
PKD1P5-204ENST00000544578 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.29■■■■■ 6.12
PKD1P5-204ENST00000544578 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.21■■■■■ 6.11
PKD1P5-204ENST00000544578 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.9■■■■■ 6.06
PKD1P5-204ENST00000544578 SCRIBQ14160 1630 aa52.66■■■■■ 6.02
PKD1P5-204ENST00000544578 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.42■■■■■ 5.98
PKD1P5-204ENST00000544578 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.31■■■■■ 5.96
PKD1P5-204ENST00000544578 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.26■■■■■ 5.96
PKD1P5-204ENST00000544578 NCAPD3P42695 1498 aa50.57■■■■■ 5.69
PKD1P5-204ENST00000544578 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.35■■■■■ 5.65
PKD1P5-204ENST00000544578 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.33■■■■■ 5.65
PKD1P5-204ENST00000544578 SMARCA2P51531 1590 aa50.25■■■■■ 5.63
PKD1P5-204ENST00000544578 SMARCA4P51532 1647 aa50.25■■■■■ 5.63
PKD1P5-204ENST00000544578 HMGXB3Q12766 1538 aa50.16■■■■■ 5.62
PKD1P5-204ENST00000544578 CUX2O14529 1486 aa50.15■■■■■ 5.62
PKD1P5-204ENST00000544578 ERCC6Q03468 1493 aa50.14■■■■■ 5.62
PKD1P5-204ENST00000544578 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50■■■■■ 5.6
PKD1P5-204ENST00000544578 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.87■■■■■ 5.57
PKD1P5-204ENST00000544578 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.79■■■■■ 5.56
PKD1P5-204ENST00000544578 NESP48681 1621 aa49.75■■■■■ 5.56
PKD1P5-204ENST00000544578 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.56■■■■■ 5.52
PKD1P5-204ENST00000544578 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.46■■■■■ 5.51
PKD1P5-204ENST00000544578 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.32■■■■■ 5.49
PKD1P5-204ENST00000544578 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.21■■■■■ 5.47
PKD1P5-204ENST00000544578 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.13■■■■■ 5.46
PKD1P5-204ENST00000544578 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.02■■■■■ 5.44
PKD1P5-204ENST00000544578 WIZO95785 1651 aa48.96■■■■■ 5.43
PKD1P5-204ENST00000544578 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.75■■■■■ 5.4
PKD1P5-204ENST00000544578 WDR62O43379 1518 aa48.63■■■■■ 5.38
PKD1P5-204ENST00000544578 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.53■■■■■ 5.36
PKD1P5-204ENST00000544578 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.48■■■■■ 5.35
PKD1P5-204ENST00000544578 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.44■■■■■ 5.35
PKD1P5-204ENST00000544578 CFTRP13569 1480 aa48.41■■■■■ 5.34
PKD1P5-204ENST00000544578 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.36■■■■■ 5.33
PKD1P5-204ENST00000544578 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.02■■■■■ 5.28
PKD1P5-204ENST00000544578 TRIM41Q8WV44 630 aa48.01■■■■■ 5.28
PKD1P5-204ENST00000544578 PRDM2Q13029 1718 aa47.92■■■■■ 5.26
PKD1P5-204ENST00000544578 OSCARQ8IYS5 282 aa47.85■■■■■ 5.25
PKD1P5-204ENST00000544578 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.8■■■■■ 5.24
PKD1P5-204ENST00000544578 IFT140Q96RY7 1462 aa47.57■■■■■ 5.21
PKD1P5-204ENST00000544578 TOPBP1Q92547 1522 aa47.5■■■■■ 5.19
PKD1P5-204ENST00000544578 ABCC8Q09428 1581 aa47.46■■■■■ 5.19
PKD1P5-204ENST00000544578 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.45■■■■■ 5.19
PKD1P5-204ENST00000544578 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.32■■■■■ 5.17
PKD1P5-204ENST00000544578 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.2■■■■■ 5.15
PKD1P5-204ENST00000544578 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.17■■■■■ 5.14
PKD1P5-204ENST00000544578 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.17■■■■■ 5.14
PKD1P5-204ENST00000544578 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.17■■■■■ 5.14
PKD1P5-204ENST00000544578 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.08■■■■■ 5.13
PKD1P5-204ENST00000544578 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.02■■■■■ 5.12
PKD1P5-204ENST00000544578 ARHGEF11O15085 1522 aa47.01■■■■■ 5.12
PKD1P5-204ENST00000544578 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.99■■■■■ 5.11
PKD1P5-204ENST00000544578 CHD1O14646 1710 aa46.88■■■■■ 5.1
PKD1P5-204ENST00000544578 SOGA1O94964 1423 aa46.8■■■■■ 5.08
PKD1P5-204ENST00000544578 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.79■■■■■ 5.08
PKD1P5-204ENST00000544578 FBLN2P98095 1184 aa46.78■■■■■ 5.08
PKD1P5-204ENST00000544578 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.7■■■■■ 5.07
PKD1P5-204ENST00000544578 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.7■■■■■ 5.07
PKD1P5-204ENST00000544578 WDR97A6NE52 1622 aa46.67■■■■■ 5.06
PKD1P5-204ENST00000544578 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.66■■■■■ 5.06
PKD1P5-204ENST00000544578 CUX1P39880 1505 aa46.58■■■■■ 5.05
PKD1P5-204ENST00000544578 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.54■■■■■ 5.04
PKD1P5-204ENST00000544578 ARAP1Q96P48 1450 aa46.52■■■■■ 5.04
PKD1P5-204ENST00000544578 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.45■■■■■ 5.03
PKD1P5-204ENST00000544578 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.44■■■■■ 5.02
PKD1P5-204ENST00000544578 GRIN2BQ13224 1484 aa46.43■■■■■ 5.02
PKD1P5-204ENST00000544578 SYNJ1O43426 1573 aa46.35■■■■■ 5.01
PKD1P5-204ENST00000544578 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.35■■■■■ 5.01
PKD1P5-204ENST00000544578 SYNJ2O15056 1496 aa46.3■■■■■ 5
PKD1P5-204ENST00000544578 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.26■■■■■ 5
PKD1P5-204ENST00000544578 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.23■■■■■ 4.99
PKD1P5-204ENST00000544578 PBRM1Q86U86 1689 aa46.2■■■■■ 4.99
PKD1P5-204ENST00000544578 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.18■■■■■ 4.98
PKD1P5-204ENST00000544578 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.15■■■■■ 4.98
PKD1P5-204ENST00000544578 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.08■■■■■ 4.97
PKD1P5-204ENST00000544578 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.95■■■■■ 4.95
PKD1P5-204ENST00000544578 TOP2BQ02880 1626 aa45.81■■■■■ 4.92
PKD1P5-204ENST00000544578 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.81■■■■■ 4.92
PKD1P5-204ENST00000544578 GRIN2AQ12879 1464 aa45.81■■■■■ 4.92
PKD1P5-204ENST00000544578 ADAMTS12P58397 1594 aa45.74■■■■■ 4.91
PKD1P5-204ENST00000544578 NUP160Q12769 1436 aa45.67■■■■■ 4.9
PKD1P5-204ENST00000544578 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.64■■■■■ 4.9
PKD1P5-204ENST00000544578 CEP170Q5SW79 1584 aa45.62■■■■■ 4.89
PKD1P5-204ENST00000544578 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.59■■■■■ 4.89
PKD1P5-204ENST00000544578 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.57■■■■■ 4.89
PKD1P5-204ENST00000544578 SHROOM2Q13796 1616 aa45.48■■■■■ 4.87
PKD1P5-204ENST00000544578 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.25■■■■■ 4.83
PKD1P5-204ENST00000544578 JPH4Q96JJ6 628 aa45.23■■■■■ 4.83
PKD1P5-204ENST00000544578 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.1■■■■■ 4.81
PKD1P5-204ENST00000544578 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP45.09■■■■■ 4.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.1 ms