RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543656.1

RUSC1-AS1-204, RUSC1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RUSC1-AS1, Length 1,357 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.11■■■■■ 4.17
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RUSC1-AS1-204ENST00000543656 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.72■■■■□ 3.31
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RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.2■■■■□ 3.06
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RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.12■■■■□ 3.05
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RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SCRIBQ14160 1630 aa33.91■■■■□ 3.02
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RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ERCC6Q03468 1493 aa32.73■■■□□ 2.83
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 NCAPD3P42695 1498 aa32.58■■■□□ 2.81
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.42■■■□□ 2.78
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 NESP48681 1621 aa32.38■■■□□ 2.77
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 HMGXB3Q12766 1538 aa32.31■■■□□ 2.76
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SMARCA2P51531 1590 aa32.27■■■□□ 2.76
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SMARCA4P51532 1647 aa32.25■■■□□ 2.75
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RUSC1-AS1-204ENST00000543656 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.98■■■□□ 2.71
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.96■■■□□ 2.71
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.7
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RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.91■■■□□ 2.7
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RUSC1-AS1-204ENST00000543656 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.71■■■□□ 2.67
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.6■■■□□ 2.65
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.56■■■□□ 2.64
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 WDR62O43379 1518 aa31.56■■■□□ 2.64
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.33■■■□□ 2.61
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 WIZO95785 1651 aa31.32■■■□□ 2.6
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.24■■■□□ 2.59
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 OSCARQ8IYS5 282 aa31.23■■■□□ 2.59
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CFTRP13569 1480 aa31.08■■■□□ 2.57
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RUSC1-AS1-204ENST00000543656 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31■■■□□ 2.55
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31■■■□□ 2.55
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31■■■□□ 2.55
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ARHGEF11O15085 1522 aa30.82■■■□□ 2.52
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
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RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PRDM2Q13029 1718 aa30.77■■■□□ 2.52
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 IFT140Q96RY7 1462 aa30.72■■■□□ 2.51
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RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TOPBP1Q92547 1522 aa30.58■■■□□ 2.49
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CHD1O14646 1710 aa30.52■■■□□ 2.48
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.48■■■□□ 2.47
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ARAP1Q96P48 1450 aa30.47■■■□□ 2.47
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.41■■■□□ 2.46
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RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ABCC8Q09428 1581 aa30.39■■■□□ 2.46
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RUSC1-AS1-204ENST00000543656 FBLN2P98095 1184 aa30.31■■■□□ 2.44
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RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.12■■■□□ 2.41
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
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RUSC1-AS1-204ENST00000543656 WDR97A6NE52 1622 aa29.96■■■□□ 2.39
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.95■■■□□ 2.39
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
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RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SYNJ2O15056 1496 aa29.86■■■□□ 2.37
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CUX1P39880 1505 aa29.83■■■□□ 2.37
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.82■■■□□ 2.36
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PBRM1Q86U86 1689 aa29.77■■■□□ 2.36
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.64■■■□□ 2.34
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RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.55■■■□□ 2.32
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 GRIN2AQ12879 1464 aa29.5■■■□□ 2.31
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CEP170Q5SW79 1584 aa29.49■■■□□ 2.31
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ADAMTS12P58397 1594 aa29.43■■■□□ 2.3
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 NUP160Q12769 1436 aa29.43■■■□□ 2.3
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.42■■■□□ 2.3
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SHROOM2Q13796 1616 aa29.4■■■□□ 2.3
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.26■■■□□ 2.27
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.26■■■□□ 2.27
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.17■■■□□ 2.26
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.15■■■□□ 2.26
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RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.12■■■□□ 2.25
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