RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543575.5

PDE2A-223, Transcript of phosphodiesterase 2A, humanhuman

TSL 4

Gene PDE2A, Length 544 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE2A-223ENST00000543575 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.28■■■■■ 7.56
PDE2A-223ENST00000543575 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.8■■■■■ 6.52
PDE2A-223ENST00000543575 ABCC9O60706 1549 aa55.31■■■■■ 6.45
PDE2A-223ENST00000543575 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.89■■■■■ 6.06
PDE2A-223ENST00000543575 NACADO15069 1562 aa52.61■■■■■ 6.01
PDE2A-223ENST00000543575 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.24■■■■■ 5.95
PDE2A-223ENST00000543575 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.04■■■■■ 5.92
PDE2A-223ENST00000543575 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.75■■■■■ 5.88
PDE2A-223ENST00000543575 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.69■■■■■ 5.86
PDE2A-223ENST00000543575 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.51■■■■■ 5.84
PDE2A-223ENST00000543575 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.48■■■■■ 5.83
PDE2A-223ENST00000543575 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.43■■■■■ 5.82
PDE2A-223ENST00000543575 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.31■■■■■ 5.8
PDE2A-223ENST00000543575 SCRIBQ14160 1630 aa50.84■■■■■ 5.73
PDE2A-223ENST00000543575 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.74■■■■■ 5.71
PDE2A-223ENST00000543575 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.03■■■■■ 5.6
PDE2A-223ENST00000543575 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.02■■■■■ 5.6
PDE2A-223ENST00000543575 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.81■■■■■ 5.56
PDE2A-223ENST00000543575 SMARCA4P51532 1647 aa48.54■■■■■ 5.36
PDE2A-223ENST00000543575 NCAPD3P42695 1498 aa48.53■■■■■ 5.36
PDE2A-223ENST00000543575 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.44■■■■■ 5.35
PDE2A-223ENST00000543575 SMARCA2P51531 1590 aa48.38■■■■■ 5.33
PDE2A-223ENST00000543575 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.34■■■■■ 5.33
PDE2A-223ENST00000543575 HMGXB3Q12766 1538 aa48.27■■■■■ 5.32
PDE2A-223ENST00000543575 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.07■■■■■ 5.29
PDE2A-223ENST00000543575 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.02■■■■■ 5.28
PDE2A-223ENST00000543575 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.99■■■■■ 5.27
PDE2A-223ENST00000543575 ERCC6Q03468 1493 aa47.76■■■■■ 5.24
PDE2A-223ENST00000543575 NESP48681 1621 aa47.63■■■■■ 5.21
PDE2A-223ENST00000543575 CUX2O14529 1486 aa47.57■■■■■ 5.21
PDE2A-223ENST00000543575 WIZO95785 1651 aa47.44■■■■■ 5.18
PDE2A-223ENST00000543575 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.41■■■■■ 5.18
PDE2A-223ENST00000543575 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.15■■■■■ 5.14
PDE2A-223ENST00000543575 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.12■■■■■ 5.13
PDE2A-223ENST00000543575 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.09■■■■■ 5.13
PDE2A-223ENST00000543575 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.08■■■■■ 5.13
PDE2A-223ENST00000543575 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.05■■■■■ 5.12
PDE2A-223ENST00000543575 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.96■■■■■ 5.11
PDE2A-223ENST00000543575 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.92■■■■■ 5.1
PDE2A-223ENST00000543575 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.7■■■■■ 5.07
PDE2A-223ENST00000543575 CFTRP13569 1480 aa46.63■■■■■ 5.05
PDE2A-223ENST00000543575 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.59■■■■■ 5.05
PDE2A-223ENST00000543575 WDR62O43379 1518 aa46.59■■■■■ 5.05
PDE2A-223ENST00000543575 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.56■■■■■ 5.04
PDE2A-223ENST00000543575 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.31■■■■■ 5
PDE2A-223ENST00000543575 PRDM2Q13029 1718 aa46.28■■■■■ 5
PDE2A-223ENST00000543575 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.15■■■■■ 4.98
PDE2A-223ENST00000543575 TOPBP1Q92547 1522 aa45.72■■■■■ 4.91
PDE2A-223ENST00000543575 ABCC8Q09428 1581 aa45.64■■■■■ 4.9
PDE2A-223ENST00000543575 IFT140Q96RY7 1462 aa45.64■■■■■ 4.9
PDE2A-223ENST00000543575 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.62■■■■■ 4.89
PDE2A-223ENST00000543575 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.49■■■■■ 4.87
PDE2A-223ENST00000543575 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.33■■■■■ 4.85
PDE2A-223ENST00000543575 OSCARQ8IYS5 282 aa45.33■■■■■ 4.85
PDE2A-223ENST00000543575 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.3■■■■■ 4.84
PDE2A-223ENST00000543575 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.29■■■■■ 4.84
PDE2A-223ENST00000543575 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.24■■■■■ 4.83
PDE2A-223ENST00000543575 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.1■■■■■ 4.81
PDE2A-223ENST00000543575 CUX1P39880 1505 aa45.08■■■■■ 4.81
PDE2A-223ENST00000543575 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.07■■■■■ 4.81
PDE2A-223ENST00000543575 TRIM41Q8WV44 630 aa45.07■■■■■ 4.81
PDE2A-223ENST00000543575 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.06■■■■■ 4.8
PDE2A-223ENST00000543575 SOGA1O94964 1423 aa45.03■■■■■ 4.8
PDE2A-223ENST00000543575 WDR97A6NE52 1622 aa44.92■■■■■ 4.78
PDE2A-223ENST00000543575 CHD1O14646 1710 aa44.91■■■■■ 4.78
PDE2A-223ENST00000543575 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.88■■■■■ 4.78
PDE2A-223ENST00000543575 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.82■■■■■ 4.77
PDE2A-223ENST00000543575 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.82■■■■■ 4.77
PDE2A-223ENST00000543575 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.82■■■■■ 4.77
PDE2A-223ENST00000543575 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.72■■■■■ 4.75
PDE2A-223ENST00000543575 ARHGEF11O15085 1522 aa44.71■■■■■ 4.75
PDE2A-223ENST00000543575 FBLN2P98095 1184 aa44.68■■■■■ 4.74
PDE2A-223ENST00000543575 GRIN2BQ13224 1484 aa44.65■■■■■ 4.74
PDE2A-223ENST00000543575 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.63■■■■■ 4.73
PDE2A-223ENST00000543575 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.58■■■■■ 4.73
PDE2A-223ENST00000543575 PBRM1Q86U86 1689 aa44.55■■■■■ 4.72
PDE2A-223ENST00000543575 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.53■■■■■ 4.72
PDE2A-223ENST00000543575 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.52■■■■■ 4.72
PDE2A-223ENST00000543575 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.5■■■■■ 4.71
PDE2A-223ENST00000543575 TOP2BQ02880 1626 aa44.48■■■■■ 4.71
PDE2A-223ENST00000543575 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.47■■■■■ 4.71
PDE2A-223ENST00000543575 SYNJ2O15056 1496 aa44.47■■■■■ 4.71
PDE2A-223ENST00000543575 SYNJ1O43426 1573 aa44.44■■■■■ 4.71
PDE2A-223ENST00000543575 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.43■■■■■ 4.7
PDE2A-223ENST00000543575 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.41■■■■■ 4.7
PDE2A-223ENST00000543575 ARAP1Q96P48 1450 aa44.31■■■■■ 4.68
PDE2A-223ENST00000543575 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.24■■■■■ 4.67
PDE2A-223ENST00000543575 ADAMTS12P58397 1594 aa44.17■■■■■ 4.66
PDE2A-223ENST00000543575 GRIN2AQ12879 1464 aa44.08■■■■■ 4.65
PDE2A-223ENST00000543575 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.04■■■■■ 4.64
PDE2A-223ENST00000543575 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.99■■■■■ 4.63
PDE2A-223ENST00000543575 CEP170Q5SW79 1584 aa43.92■■■■■ 4.62
PDE2A-223ENST00000543575 NUP160Q12769 1436 aa43.92■■■■■ 4.62
PDE2A-223ENST00000543575 SHROOM2Q13796 1616 aa43.71■■■■■ 4.59
PDE2A-223ENST00000543575 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.71■■■■■ 4.59
PDE2A-223ENST00000543575 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.63■■■■■ 4.57
PDE2A-223ENST00000543575 KIF27Q86VH2 1401 aa43.59■■■■■ 4.57
PDE2A-223ENST00000543575 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.53■■■■■ 4.56
PDE2A-223ENST00000543575 CUL7Q14999 1698 aa43.51■■■■■ 4.56
PDE2A-223ENST00000543575 IGF1RP08069 1367 aa43.47■■■■■ 4.55
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