RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543125.5

PGA3-207, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PGA3, Length 968 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-207ENST00000543125 NISCHQ9Y2I1 1504 aa21.9■■□□□ 1.1
PGA3-207ENST00000543125 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
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PGA3-207ENST00000543125 ABCC9O60706 1549 aa19■□□□□ 0.63
PGA3-207ENST00000543125 CHIC1Q5VXU3 224 aa18.72■□□□□ 0.59
PGA3-207ENST00000543125 DNAJC5BQ9UF47 199 aa18.35■□□□□ 0.53
PGA3-207ENST00000543125 DCAF8L2P0C7V8 631 aa18.32■□□□□ 0.52
PGA3-207ENST00000543125 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa18.3■□□□□ 0.52
PGA3-207ENST00000543125 NACADO15069 1562 aa18.29■□□□□ 0.52
PGA3-207ENST00000543125 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
PGA3-207ENST00000543125 MYO15BQ96JP2 1530 aa18.17■□□□□ 0.5
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PGA3-207ENST00000543125 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP17.77■□□□□ 0.44
PGA3-207ENST00000543125 BICRAQ9NZM4 1560 aa17.74■□□□□ 0.43
PGA3-207ENST00000543125 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa17.54■□□□□ 0.4
PGA3-207ENST00000543125 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa17.28■□□□□ 0.36
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PGA3-207ENST00000543125 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa17.19■□□□□ 0.34
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PGA3-207ENST00000543125 CECR2Q9BXF3 1484 aa17.08■□□□□ 0.32
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PGA3-207ENST00000543125 MROH2BQ7Z745 1585 aa16.89■□□□□ 0.29
PGA3-207ENST00000543125 SMARCA2P51531 1590 aa16.88■□□□□ 0.29
PGA3-207ENST00000543125 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa16.87■□□□□ 0.29
PGA3-207ENST00000543125 NCAPD3P42695 1498 aa16.86■□□□□ 0.29
PGA3-207ENST00000543125 PEG3Q9GZU2 1588 aa16.81■□□□□ 0.28
PGA3-207ENST00000543125 HMGXB3Q12766 1538 aa16.79■□□□□ 0.28
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PGA3-207ENST00000543125 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
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PGA3-207ENST00000543125 NESP48681 1621 aa16.46■□□□□ 0.23
PGA3-207ENST00000543125 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.42■□□□□ 0.22
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PGA3-207ENST00000543125 CADPSQ9ULU8 1353 aa16.38■□□□□ 0.21
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PGA3-207ENST00000543125 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.34■□□□□ 0.21
PGA3-207ENST00000543125 PDS5BQ9NTI5 1447 aa16.31■□□□□ 0.2
PGA3-207ENST00000543125 CFTRP13569 1480 aa16.29■□□□□ 0.2
PGA3-207ENST00000543125 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa16.28■□□□□ 0.2
PGA3-207ENST00000543125 PRDM2Q13029 1718 aa16.22■□□□□ 0.19
PGA3-207ENST00000543125 FANCD2Q9BXW9 1451 aa16.2■□□□□ 0.18
PGA3-207ENST00000543125 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
PGA3-207ENST00000543125 CEP164Q9UPV0 1460 aa16.18■□□□□ 0.18
PGA3-207ENST00000543125 MRC2Q9UBG0 1479 aa16.15■□□□□ 0.18
PGA3-207ENST00000543125 FOXD1Q16676 465 aa16.08■□□□□ 0.16
PGA3-207ENST00000543125 WDR62O43379 1518 aa16.08■□□□□ 0.16
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PGA3-207ENST00000543125 SOGA1O94964 1423 aa15.76■□□□□ 0.11
PGA3-207ENST00000543125 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP15.76■□□□□ 0.11
PGA3-207ENST00000543125 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
PGA3-207ENST00000543125 OSCARQ8IYS5 282 aa15.75■□□□□ 0.11
PGA3-207ENST00000543125 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.74■□□□□ 0.11
PGA3-207ENST00000543125 TOP2BQ02880 1626 aa15.72■□□□□ 0.11
PGA3-207ENST00000543125 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.72■□□□□ 0.11
PGA3-207ENST00000543125 SYNJ1O43426 1573 aa15.72■□□□□ 0.11
PGA3-207ENST00000543125 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
PGA3-207ENST00000543125 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.67■□□□□ 0.1
PGA3-207ENST00000543125 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
PGA3-207ENST00000543125 WDR97A6NE52 1622 aa15.65■□□□□ 0.1
PGA3-207ENST00000543125 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa15.63■□□□□ 0.09
PGA3-207ENST00000543125 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.57■□□□□ 0.08
PGA3-207ENST00000543125 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.57■□□□□ 0.08
PGA3-207ENST00000543125 GRIN2BQ13224 1484 aa15.56■□□□□ 0.08
PGA3-207ENST00000543125 PBRM1Q86U86 1689 aa15.56■□□□□ 0.08
PGA3-207ENST00000543125 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa15.55■□□□□ 0.08
PGA3-207ENST00000543125 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa15.55■□□□□ 0.08
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PGA3-207ENST00000543125 POTEDQ86YR6 584 aa15.55■□□□□ 0.08
PGA3-207ENST00000543125 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.53■□□□□ 0.08
PGA3-207ENST00000543125 CHD1O14646 1710 aa15.52■□□□□ 0.08
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PGA3-207ENST00000543125 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
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PGA3-207ENST00000543125 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
PGA3-207ENST00000543125 SYNJ2O15056 1496 aa15.46■□□□□ 0.06
PGA3-207ENST00000543125 CYB5RLQ6IPT4 315 aa15.45■□□□□ 0.06
PGA3-207ENST00000543125 ERICH3Q5RHP9 1530 aa15.44■□□□□ 0.06
PGA3-207ENST00000543125 KIF27Q86VH2 1401 aa15.43■□□□□ 0.06
PGA3-207ENST00000543125 ADAMTS12P58397 1594 aa15.42■□□□□ 0.06
PGA3-207ENST00000543125 ARHGEF11O15085 1522 aa15.42■□□□□ 0.06
PGA3-207ENST00000543125 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.39■□□□□ 0.05
PGA3-207ENST00000543125 GRIN2AQ12879 1464 aa15.35■□□□□ 0.05
PGA3-207ENST00000543125 IGF1RP08069 1367 aa15.35■□□□□ 0.05
PGA3-207ENST00000543125 CUL7Q14999 1698 aa15.33■□□□□ 0.04
PGA3-207ENST00000543125 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.32■□□□□ 0.04
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