RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543088.5

TM7SF3-212, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 4

Gene TM7SF3, Length 601 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-212ENST00000543088 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.25■■■■■ 7.4
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TM7SF3-212ENST00000543088 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.67■■■■■ 5.86
TM7SF3-212ENST00000543088 NACADO15069 1562 aa51.5■■■■■ 5.84
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TM7SF3-212ENST00000543088 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.4■■■■■ 5.34
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TM7SF3-212ENST00000543088 SMARCA2P51531 1590 aa47.45■■■■■ 5.19
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TM7SF3-212ENST00000543088 HMGXB3Q12766 1538 aa47.27■■■■■ 5.16
TM7SF3-212ENST00000543088 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.18■■■■■ 5.14
TM7SF3-212ENST00000543088 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.16■■■■■ 5.14
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TM7SF3-212ENST00000543088 NESP48681 1621 aa46.4■■■■■ 5.02
TM7SF3-212ENST00000543088 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.35■■■■■ 5.01
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TM7SF3-212ENST00000543088 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.04■■■■■ 4.96
TM7SF3-212ENST00000543088 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.92■■■■■ 4.94
TM7SF3-212ENST00000543088 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.86■■■■■ 4.93
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TM7SF3-212ENST00000543088 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.59■■■■■ 4.89
TM7SF3-212ENST00000543088 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.58■■■■■ 4.89
TM7SF3-212ENST00000543088 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.58■■■■■ 4.89
TM7SF3-212ENST00000543088 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.56■■■■■ 4.88
TM7SF3-212ENST00000543088 PRDM2Q13029 1718 aa45.44■■■■■ 4.87
TM7SF3-212ENST00000543088 WDR62O43379 1518 aa45.43■■■■■ 4.86
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TM7SF3-212ENST00000543088 ABCC8Q09428 1581 aa44.83■■■■■ 4.77
TM7SF3-212ENST00000543088 TOPBP1Q92547 1522 aa44.78■■■■■ 4.76
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TM7SF3-212ENST00000543088 IFT140Q96RY7 1462 aa44.63■■■■■ 4.73
TM7SF3-212ENST00000543088 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.38■■■■■ 4.69
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TM7SF3-212ENST00000543088 SOGA1O94964 1423 aa44.18■■■■■ 4.66
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TM7SF3-212ENST00000543088 WDR97A6NE52 1622 aa44.06■■■■■ 4.64
TM7SF3-212ENST00000543088 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.94■■■■■ 4.63
TM7SF3-212ENST00000543088 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.9■■■■■ 4.62
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TM7SF3-212ENST00000543088 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.69■■■■■ 4.58
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TM7SF3-212ENST00000543088 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.66■■■■■ 4.58
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TM7SF3-212ENST00000543088 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.43■■■■■ 4.54
TM7SF3-212ENST00000543088 TRIM41Q8WV44 630 aa43.42■■■■■ 4.54
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TM7SF3-212ENST00000543088 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.28■■■■■ 4.52
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TM7SF3-212ENST00000543088 CEP170Q5SW79 1584 aa42.96■■■■■ 4.47
TM7SF3-212ENST00000543088 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.95■■■■■ 4.47
TM7SF3-212ENST00000543088 CUL7Q14999 1698 aa42.86■■■■■ 4.45
TM7SF3-212ENST00000543088 IGF1RP08069 1367 aa42.81■■■■■ 4.44
TM7SF3-212ENST00000543088 SHROOM2Q13796 1616 aa42.72■■■■■ 4.43
TM7SF3-212ENST00000543088 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.66■■■■■ 4.42
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TM7SF3-212ENST00000543088 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.58■■■■■ 4.41
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