RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542964.5

MEIS1-215, Transcript of Meis homeobox 1, humanhuman

TSL 5

Gene MEIS1, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1-215ENST00000542964 NISCHQ9Y2I1 1504 aa22.11■■□□□ 1.13
MEIS1-215ENST00000542964 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa19.81■□□□□ 0.76
MEIS1-215ENST00000542964 ABCC9O60706 1549 aa19.64■□□□□ 0.73
MEIS1-215ENST00000542964 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa18.79■□□□□ 0.6
MEIS1-215ENST00000542964 NACADO15069 1562 aa18.68■□□□□ 0.58
MEIS1-215ENST00000542964 DCAF8L2P0C7V8 631 aa18.65■□□□□ 0.58
MEIS1-215ENST00000542964 MYO15BQ96JP2 1530 aa18.44■□□□□ 0.54
MEIS1-215ENST00000542964 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
MEIS1-215ENST00000542964 UNC13AQ9UPW8 1703 aa18.29■□□□□ 0.52
MEIS1-215ENST00000542964 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP18.28■□□□□ 0.52
MEIS1-215ENST00000542964 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa18.28■□□□□ 0.52
MEIS1-215ENST00000542964 BICRAQ9NZM4 1560 aa18.14■□□□□ 0.49
MEIS1-215ENST00000542964 DNAJC5BQ9UF47 199 aa18.14■□□□□ 0.49
MEIS1-215ENST00000542964 SCRIBQ14160 1630 aa18.08■□□□□ 0.48
MEIS1-215ENST00000542964 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa18.01■□□□□ 0.47
MEIS1-215ENST00000542964 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
MEIS1-215ENST00000542964 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa17.73■□□□□ 0.43
MEIS1-215ENST00000542964 CECR2Q9BXF3 1484 aa17.68■□□□□ 0.42
MEIS1-215ENST00000542964 SMARCA4P51532 1647 aa17.24■□□□□ 0.35
MEIS1-215ENST00000542964 NCAPD3P42695 1498 aa17.2■□□□□ 0.34
MEIS1-215ENST00000542964 SMARCA2P51531 1590 aa17.19■□□□□ 0.34
MEIS1-215ENST00000542964 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
MEIS1-215ENST00000542964 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa17.18■□□□□ 0.34
MEIS1-215ENST00000542964 HMGXB3Q12766 1538 aa17.13■□□□□ 0.33
MEIS1-215ENST00000542964 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
MEIS1-215ENST00000542964 PEG3Q9GZU2 1588 aa17.04■□□□□ 0.32
MEIS1-215ENST00000542964 MROH2BQ7Z745 1585 aa17.02■□□□□ 0.32
MEIS1-215ENST00000542964 ERCC6Q03468 1493 aa17.01■□□□□ 0.31
MEIS1-215ENST00000542964 NESP48681 1621 aa16.88■□□□□ 0.29
MEIS1-215ENST00000542964 CUX2O14529 1486 aa16.86■□□□□ 0.29
MEIS1-215ENST00000542964 WIZO95785 1651 aa16.85■□□□□ 0.29
MEIS1-215ENST00000542964 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.84■□□□□ 0.29
MEIS1-215ENST00000542964 PDS5BQ9NTI5 1447 aa16.74■□□□□ 0.27
MEIS1-215ENST00000542964 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
MEIS1-215ENST00000542964 CADPSQ9ULU8 1353 aa16.71■□□□□ 0.27
MEIS1-215ENST00000542964 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
MEIS1-215ENST00000542964 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa16.69■□□□□ 0.26
MEIS1-215ENST00000542964 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
MEIS1-215ENST00000542964 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa16.59■□□□□ 0.25
MEIS1-215ENST00000542964 MRC2Q9UBG0 1479 aa16.59■□□□□ 0.25
MEIS1-215ENST00000542964 CEP164Q9UPV0 1460 aa16.57■□□□□ 0.24
MEIS1-215ENST00000542964 CFTRP13569 1480 aa16.54■□□□□ 0.24
MEIS1-215ENST00000542964 FANCD2Q9BXW9 1451 aa16.54■□□□□ 0.24
MEIS1-215ENST00000542964 WDR62O43379 1518 aa16.52■□□□□ 0.24
MEIS1-215ENST00000542964 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.45■□□□□ 0.22
MEIS1-215ENST00000542964 PRDM2Q13029 1718 aa16.43■□□□□ 0.22
MEIS1-215ENST00000542964 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
MEIS1-215ENST00000542964 ABCC8Q09428 1581 aa16.24■□□□□ 0.19
MEIS1-215ENST00000542964 TOPBP1Q92547 1522 aa16.24■□□□□ 0.19
MEIS1-215ENST00000542964 IFT140Q96RY7 1462 aa16.22■□□□□ 0.19
MEIS1-215ENST00000542964 DNMBPQ6XZF7 1577 aa16.21■□□□□ 0.19
MEIS1-215ENST00000542964 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
MEIS1-215ENST00000542964 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
MEIS1-215ENST00000542964 OSCARQ8IYS5 282 aa16.11■□□□□ 0.17
MEIS1-215ENST00000542964 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
MEIS1-215ENST00000542964 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
MEIS1-215ENST00000542964 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
MEIS1-215ENST00000542964 TRIM41Q8WV44 630 aa16.03■□□□□ 0.16
MEIS1-215ENST00000542964 FGD5Q6ZNL6 1462 aa16.02■□□□□ 0.15
MEIS1-215ENST00000542964 SOGA1O94964 1423 aa16.02■□□□□ 0.15
MEIS1-215ENST00000542964 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.15
MEIS1-215ENST00000542964 CUX1P39880 1505 aa16■□□□□ 0.15
MEIS1-215ENST00000542964 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa16■□□□□ 0.15
MEIS1-215ENST00000542964 WDR97A6NE52 1622 aa15.97■□□□□ 0.15
MEIS1-215ENST00000542964 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
MEIS1-215ENST00000542964 FBLN2P98095 1184 aa15.94■□□□□ 0.14
MEIS1-215ENST00000542964 CHD1O14646 1710 aa15.93■□□□□ 0.14
MEIS1-215ENST00000542964 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.9■□□□□ 0.14
MEIS1-215ENST00000542964 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa15.88■□□□□ 0.13
MEIS1-215ENST00000542964 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa15.88■□□□□ 0.13
MEIS1-215ENST00000542964 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa15.88■□□□□ 0.13
MEIS1-215ENST00000542964 GRIN2BQ13224 1484 aa15.88■□□□□ 0.13
MEIS1-215ENST00000542964 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
MEIS1-215ENST00000542964 ARHGEF11O15085 1522 aa15.85■□□□□ 0.13
MEIS1-215ENST00000542964 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
MEIS1-215ENST00000542964 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP15.84■□□□□ 0.13
MEIS1-215ENST00000542964 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.84■□□□□ 0.13
MEIS1-215ENST00000542964 PBRM1Q86U86 1689 aa15.83■□□□□ 0.13
MEIS1-215ENST00000542964 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa15.83■□□□□ 0.12
MEIS1-215ENST00000542964 TOP2BQ02880 1626 aa15.81■□□□□ 0.12
MEIS1-215ENST00000542964 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.81■□□□□ 0.12
MEIS1-215ENST00000542964 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.8■□□□□ 0.12
MEIS1-215ENST00000542964 SYNJ1O43426 1573 aa15.8■□□□□ 0.12
MEIS1-215ENST00000542964 SYNJ2O15056 1496 aa15.8■□□□□ 0.12
MEIS1-215ENST00000542964 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.73■□□□□ 0.11
MEIS1-215ENST00000542964 CYB5RLQ6IPT4 315 aa15.72■□□□□ 0.11
MEIS1-215ENST00000542964 ARAP1Q96P48 1450 aa15.7■□□□□ 0.1
MEIS1-215ENST00000542964 ADAMTS12P58397 1594 aa15.69■□□□□ 0.1
MEIS1-215ENST00000542964 GRIN2AQ12879 1464 aa15.66■□□□□ 0.1
MEIS1-215ENST00000542964 ERICH3Q5RHP9 1530 aa15.65■□□□□ 0.1
MEIS1-215ENST00000542964 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.64■□□□□ 0.09
MEIS1-215ENST00000542964 CEP170Q5SW79 1584 aa15.58■□□□□ 0.09
MEIS1-215ENST00000542964 NUP160Q12769 1436 aa15.58■□□□□ 0.08
MEIS1-215ENST00000542964 TRHP20396 242 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
MEIS1-215ENST00000542964 KIF27Q86VH2 1401 aa15.54■□□□□ 0.08
MEIS1-215ENST00000542964 CUL7Q14999 1698 aa15.49■□□□□ 0.07
MEIS1-215ENST00000542964 SHROOM2Q13796 1616 aa15.49■□□□□ 0.07
MEIS1-215ENST00000542964 ERCC6L2Q5T890 1561 aa15.48■□□□□ 0.07
MEIS1-215ENST00000542964 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa15.47■□□□□ 0.07
MEIS1-215ENST00000542964 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms