RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		40.16	■■■■■ 4.02
DDX11-222	ENST00000542777	ABCC9	O60706	1549 aa		36.02	■■■■□ 3.36
DDX11-222	ENST00000542777	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		36.01	■■■■□ 3.35
DDX11-222	ENST00000542777	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		34.28	■■■■□ 3.08
DDX11-222	ENST00000542777	NACAD	O15069	1562 aa		34.05	■■■■□ 3.04
DDX11-222	ENST00000542777	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		33.96	■■■■□ 3.03
DDX11-222	ENST00000542777	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		33.79	■■■■□ 3
DDX11-222	ENST00000542777	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		33.58	■■■□□ 2.97
DDX11-222	ENST00000542777	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	33.57	■■■□□ 2.96
DDX11-222	ENST00000542777	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		33.51	■■■□□ 2.96
DDX11-222	ENST00000542777	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		33.27	■■■□□ 2.92
DDX11-222	ENST00000542777	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	33.27	■■■□□ 2.92
DDX11-222	ENST00000542777	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		33.16	■■■□□ 2.9
DDX11-222	ENST00000542777	SCRIB	Q14160	1630 aa		32.83	■■■□□ 2.85
DDX11-222	ENST00000542777	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		32.8	■■■□□ 2.84
DDX11-222	ENST00000542777	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		32.53	■■■□□ 2.8
DDX11-222	ENST00000542777	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.79
DDX11-222	ENST00000542777	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		32.44	■■■□□ 2.78
DDX11-222	ENST00000542777	NCAPD3	P42695	1498 aa		31.44	■■■□□ 2.62
DDX11-222	ENST00000542777	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		31.35	■■■□□ 2.61
DDX11-222	ENST00000542777	SMARCA4	P51532	1647 aa		31.31	■■■□□ 2.6
DDX11-222	ENST00000542777	SMARCA2	P51531	1590 aa		31.26	■■■□□ 2.59
DDX11-222	ENST00000542777	HMGXB3	Q12766	1538 aa		31.19	■■■□□ 2.58
DDX11-222	ENST00000542777	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	31.17	■■■□□ 2.58
DDX11-222	ENST00000542777	ERCC6	Q03468	1493 aa		31.1	■■■□□ 2.57
DDX11-222	ENST00000542777	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	31.05	■■■□□ 2.56
DDX11-222	ENST00000542777	CUX2	O14529	1486 aa		31.01	■■■□□ 2.56
DDX11-222	ENST00000542777	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		31.01	■■■□□ 2.55
DDX11-222	ENST00000542777	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		31	■■■□□ 2.55
DDX11-222	ENST00000542777	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		30.95	■■■□□ 2.54
DDX11-222	ENST00000542777	NES	P48681	1621 aa		30.95	■■■□□ 2.54
DDX11-222	ENST00000542777	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		30.72	■■■□□ 2.51
DDX11-222	ENST00000542777	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	30.6	■■■□□ 2.49
DDX11-222	ENST00000542777	WIZ	O95785	1651 aa		30.58	■■■□□ 2.49
DDX11-222	ENST00000542777	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		30.56	■■■□□ 2.48
DDX11-222	ENST00000542777	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		30.55	■■■□□ 2.48
DDX11-222	ENST00000542777	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		30.5	■■■□□ 2.47
DDX11-222	ENST00000542777	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	30.31	■■■□□ 2.44
DDX11-222	ENST00000542777	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		30.28	■■■□□ 2.44
DDX11-222	ENST00000542777	WDR62	O43379	1518 aa		30.19	■■■□□ 2.42
DDX11-222	ENST00000542777	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	30.18	■■■□□ 2.42
DDX11-222	ENST00000542777	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		30.17	■■■□□ 2.42
DDX11-222	ENST00000542777	CFTR	P13569	1480 aa		30.14	■■■□□ 2.42
DDX11-222	ENST00000542777	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		30.14	■■■□□ 2.42
DDX11-222	ENST00000542777	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	29.89	■■■□□ 2.38
DDX11-222	ENST00000542777	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		29.87	■■■□□ 2.37
DDX11-222	ENST00000542777	PRDM2	Q13029	1718 aa		29.84	■■■□□ 2.37
DDX11-222	ENST00000542777	TRIM41	Q8WV44	630 aa		29.68	■■■□□ 2.34
DDX11-222	ENST00000542777	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		29.65	■■■□□ 2.34
DDX11-222	ENST00000542777	TOPBP1	Q92547	1522 aa		29.57	■■■□□ 2.32
DDX11-222	ENST00000542777	IFT140	Q96RY7	1462 aa		29.57	■■■□□ 2.32
DDX11-222	ENST00000542777	ABCC8	Q09428	1581 aa		29.52	■■■□□ 2.32
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	29.52	■■■□□ 2.32
DDX11-222	ENST00000542777	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		29.46	■■■□□ 2.31
DDX11-222	ENST00000542777	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	29.35	■■■□□ 2.29
DDX11-222	ENST00000542777	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	29.31	■■■□□ 2.28
DDX11-222	ENST00000542777	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	29.28	■■■□□ 2.28
DDX11-222	ENST00000542777	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	29.27	■■■□□ 2.28
DDX11-222	ENST00000542777	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		29.23	■■■□□ 2.27
DDX11-222	ENST00000542777	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		29.23	■■■□□ 2.27
DDX11-222	ENST00000542777	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		29.23	■■■□□ 2.27
DDX11-222	ENST00000542777	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		29.18	■■■□□ 2.26
DDX11-222	ENST00000542777	SOGA1	O94964	1423 aa		29.17	■■■□□ 2.26
DDX11-222	ENST00000542777	CHD1	O14646	1710 aa		29.14	■■■□□ 2.25
DDX11-222	ENST00000542777	ARHGEF11	O15085	1522 aa		29.13	■■■□□ 2.25
DDX11-222	ENST00000542777	FBLN2	P98095	1184 aa		29.11	■■■□□ 2.25
DDX11-222	ENST00000542777	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	29.1	■■■□□ 2.25
DDX11-222	ENST00000542777	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		29.1	■■■□□ 2.25
DDX11-222	ENST00000542777	CUX1	P39880	1505 aa		29.07	■■■□□ 2.24
DDX11-222	ENST00000542777	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
DDX11-222	ENST00000542777	WDR97	A6NE52	1622 aa		28.99	■■■□□ 2.23
DDX11-222	ENST00000542777	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		28.97	■■■□□ 2.23
DDX11-222	ENST00000542777	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		28.96	■■■□□ 2.23
DDX11-222	ENST00000542777	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
DDX11-222	ENST00000542777	GRIN2B	Q13224	1484 aa		28.89	■■■□□ 2.22
DDX11-222	ENST00000542777	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
DDX11-222	ENST00000542777	ARAP1	Q96P48	1450 aa		28.85	■■■□□ 2.21
DDX11-222	ENST00000542777	SYNJ1	O43426	1573 aa		28.79	■■■□□ 2.2
DDX11-222	ENST00000542777	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		28.79	■■■□□ 2.2
DDX11-222	ENST00000542777	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		28.79	■■■□□ 2.2
DDX11-222	ENST00000542777	SYNJ2	O15056	1496 aa		28.78	■■■□□ 2.2
DDX11-222	ENST00000542777	PBRM1	Q86U86	1689 aa		28.77	■■■□□ 2.2
DDX11-222	ENST00000542777	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		28.76	■■■□□ 2.19
DDX11-222	ENST00000542777	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		28.71	■■■□□ 2.19
DDX11-222	ENST00000542777	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	28.67	■■■□□ 2.18
DDX11-222	ENST00000542777	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	28.65	■■■□□ 2.18
DDX11-222	ENST00000542777	TOP2B	Q02880	1626 aa		28.61	■■■□□ 2.17
DDX11-222	ENST00000542777	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		28.61	■■■□□ 2.17
DDX11-222	ENST00000542777	GRIN2A	Q12879	1464 aa		28.51	■■■□□ 2.15
DDX11-222	ENST00000542777	ADAMTS12	P58397	1594 aa		28.48	■■■□□ 2.15
DDX11-222	ENST00000542777	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		28.43	■■■□□ 2.14
DDX11-222	ENST00000542777	NUP160	Q12769	1436 aa		28.41	■■■□□ 2.14
DDX11-222	ENST00000542777	CEP170	Q5SW79	1584 aa		28.41	■■■□□ 2.14
DDX11-222	ENST00000542777	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		28.4	■■■□□ 2.14
DDX11-222	ENST00000542777	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		28.36	■■■□□ 2.13
DDX11-222	ENST00000542777	SHROOM2	Q13796	1616 aa		28.28	■■■□□ 2.12
DDX11-222	ENST00000542777	JPH4	Q96JJ6	628 aa		28.17	■■■□□ 2.1
DDX11-222	ENST00000542777	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	28.17	■■■□□ 2.1
DDX11-222	ENST00000542777	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		28.08	■■■□□ 2.08
DDX11-222	ENST00000542777	IGF1R	P08069	1367 aa		28.07	■■■□□ 2.08

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