RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542722.5

GABARAPL1-211, Transcript of GABA type A receptor associated protein like 1, humanhuman

TSL 5

Gene GABARAPL1, Length 1,423 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL1-211ENST00000542722 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.76■■■■□ 3.96
GABARAPL1-211ENST00000542722 ABCC9O60706 1549 aa35.79■■■■□ 3.32
GABARAPL1-211ENST00000542722 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.4■■■■□ 3.26
GABARAPL1-211ENST00000542722 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.01■■■■□ 3.03
GABARAPL1-211ENST00000542722 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.91■■■■□ 3.02
GABARAPL1-211ENST00000542722 NACADO15069 1562 aa33.6■■■□□ 2.97
GABARAPL1-211ENST00000542722 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.35■■■□□ 2.93
GABARAPL1-211ENST00000542722 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.26■■■□□ 2.91
GABARAPL1-211ENST00000542722 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.24■■■□□ 2.91
GABARAPL1-211ENST00000542722 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.09■■■□□ 2.89
GABARAPL1-211ENST00000542722 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.06■■■□□ 2.88
GABARAPL1-211ENST00000542722 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.95■■■□□ 2.87
GABARAPL1-211ENST00000542722 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.94■■■□□ 2.86
GABARAPL1-211ENST00000542722 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.52■■■□□ 2.8
GABARAPL1-211ENST00000542722 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.33■■■□□ 2.77
GABARAPL1-211ENST00000542722 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.31■■■□□ 2.76
GABARAPL1-211ENST00000542722 SCRIBQ14160 1630 aa32.19■■■□□ 2.74
GABARAPL1-211ENST00000542722 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
GABARAPL1-211ENST00000542722 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.55■■■□□ 2.64
GABARAPL1-211ENST00000542722 CUX2O14529 1486 aa31.08■■■□□ 2.57
GABARAPL1-211ENST00000542722 NCAPD3P42695 1498 aa31.05■■■□□ 2.56
GABARAPL1-211ENST00000542722 ERCC6Q03468 1493 aa30.93■■■□□ 2.54
GABARAPL1-211ENST00000542722 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.87■■■□□ 2.53
GABARAPL1-211ENST00000542722 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.78■■■□□ 2.52
GABARAPL1-211ENST00000542722 HMGXB3Q12766 1538 aa30.76■■■□□ 2.51
GABARAPL1-211ENST00000542722 SMARCA2P51531 1590 aa30.75■■■□□ 2.51
GABARAPL1-211ENST00000542722 SMARCA4P51532 1647 aa30.7■■■□□ 2.51
GABARAPL1-211ENST00000542722 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.67■■■□□ 2.5
GABARAPL1-211ENST00000542722 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
GABARAPL1-211ENST00000542722 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
GABARAPL1-211ENST00000542722 NESP48681 1621 aa30.63■■■□□ 2.49
GABARAPL1-211ENST00000542722 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
GABARAPL1-211ENST00000542722 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.46■■■□□ 2.47
GABARAPL1-211ENST00000542722 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
GABARAPL1-211ENST00000542722 WIZO95785 1651 aa30.41■■■□□ 2.46
GABARAPL1-211ENST00000542722 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.38■■■□□ 2.45
GABARAPL1-211ENST00000542722 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.23■■■□□ 2.43
GABARAPL1-211ENST00000542722 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.18■■■□□ 2.42
GABARAPL1-211ENST00000542722 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
GABARAPL1-211ENST00000542722 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.08■■■□□ 2.41
GABARAPL1-211ENST00000542722 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.98■■■□□ 2.39
GABARAPL1-211ENST00000542722 WDR62O43379 1518 aa29.93■■■□□ 2.38
GABARAPL1-211ENST00000542722 TRIM41Q8WV44 630 aa29.89■■■□□ 2.38
GABARAPL1-211ENST00000542722 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.76■■■□□ 2.35
GABARAPL1-211ENST00000542722 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.75■■■□□ 2.35
GABARAPL1-211ENST00000542722 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.71■■■□□ 2.35
GABARAPL1-211ENST00000542722 CFTRP13569 1480 aa29.65■■■□□ 2.34
GABARAPL1-211ENST00000542722 OSCARQ8IYS5 282 aa29.58■■■□□ 2.33
GABARAPL1-211ENST00000542722 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
GABARAPL1-211ENST00000542722 PRDM2Q13029 1718 aa29.22■■■□□ 2.27
GABARAPL1-211ENST00000542722 IFT140Q96RY7 1462 aa29.21■■■□□ 2.27
GABARAPL1-211ENST00000542722 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.2■■■□□ 2.26
GABARAPL1-211ENST00000542722 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.2■■■□□ 2.26
GABARAPL1-211ENST00000542722 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.2■■■□□ 2.26
GABARAPL1-211ENST00000542722 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
GABARAPL1-211ENST00000542722 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.15■■■□□ 2.26
GABARAPL1-211ENST00000542722 TOPBP1Q92547 1522 aa29.1■■■□□ 2.25
GABARAPL1-211ENST00000542722 ARHGEF11O15085 1522 aa29.08■■■□□ 2.25
GABARAPL1-211ENST00000542722 ABCC8Q09428 1581 aa29.02■■■□□ 2.24
GABARAPL1-211ENST00000542722 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
GABARAPL1-211ENST00000542722 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.94■■■□□ 2.22
GABARAPL1-211ENST00000542722 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.91■■■□□ 2.22
GABARAPL1-211ENST00000542722 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.88■■■□□ 2.21
GABARAPL1-211ENST00000542722 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.87■■■□□ 2.21
GABARAPL1-211ENST00000542722 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
GABARAPL1-211ENST00000542722 CHD1O14646 1710 aa28.81■■■□□ 2.2
GABARAPL1-211ENST00000542722 SYNJ1O43426 1573 aa28.8■■■□□ 2.2
GABARAPL1-211ENST00000542722 ARAP1Q96P48 1450 aa28.78■■■□□ 2.2
GABARAPL1-211ENST00000542722 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
GABARAPL1-211ENST00000542722 TOP2BQ02880 1626 aa28.75■■■□□ 2.19
GABARAPL1-211ENST00000542722 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.75■■■□□ 2.19
GABARAPL1-211ENST00000542722 CUX1P39880 1505 aa28.73■■■□□ 2.19
GABARAPL1-211ENST00000542722 FBLN2P98095 1184 aa28.72■■■□□ 2.19
GABARAPL1-211ENST00000542722 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
GABARAPL1-211ENST00000542722 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.66■■■□□ 2.18
GABARAPL1-211ENST00000542722 SOGA1O94964 1423 aa28.64■■■□□ 2.17
GABARAPL1-211ENST00000542722 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
GABARAPL1-211ENST00000542722 WDR97A6NE52 1622 aa28.57■■■□□ 2.16
GABARAPL1-211ENST00000542722 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.55■■■□□ 2.16
GABARAPL1-211ENST00000542722 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.55■■■□□ 2.16
GABARAPL1-211ENST00000542722 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.52■■■□□ 2.16
GABARAPL1-211ENST00000542722 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
GABARAPL1-211ENST00000542722 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
GABARAPL1-211ENST00000542722 GRIN2BQ13224 1484 aa28.44■■■□□ 2.14
GABARAPL1-211ENST00000542722 SYNJ2O15056 1496 aa28.39■■■□□ 2.14
GABARAPL1-211ENST00000542722 EEA1Q15075 1411 aa28.36■■■□□ 2.13
GABARAPL1-211ENST00000542722 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
GABARAPL1-211ENST00000542722 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.28■■■□□ 2.12
GABARAPL1-211ENST00000542722 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.25■■■□□ 2.11
GABARAPL1-211ENST00000542722 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.23■■■□□ 2.11
GABARAPL1-211ENST00000542722 PBRM1Q86U86 1689 aa28.23■■■□□ 2.11
GABARAPL1-211ENST00000542722 KIF27Q86VH2 1401 aa28.23■■■□□ 2.11
GABARAPL1-211ENST00000542722 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.17■■■□□ 2.1
GABARAPL1-211ENST00000542722 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
GABARAPL1-211ENST00000542722 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.12■■■□□ 2.09
GABARAPL1-211ENST00000542722 GRIN2AQ12879 1464 aa28.07■■■□□ 2.08
GABARAPL1-211ENST00000542722 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.04■■■□□ 2.08
GABARAPL1-211ENST00000542722 NUP160Q12769 1436 aa28.03■■■□□ 2.08
GABARAPL1-211ENST00000542722 KIF21BO75037 1637 aa28■■■□□ 2.07
GABARAPL1-211ENST00000542722 ADAMTS12P58397 1594 aa27.99■■■□□ 2.07
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