RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542195.1

VSIG10-209, Transcript of V-set and immunoglobulin domain containing 10, humanhuman

TSL 2

Gene VSIG10, Length 730 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10-209ENST00000542195 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.6■■■■■ 6.33
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VSIG10-209ENST00000542195 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.47■■■■■ 5.03
VSIG10-209ENST00000542195 NACADO15069 1562 aa46.23■■■■■ 4.99
VSIG10-209ENST00000542195 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.98■■■■■ 4.95
VSIG10-209ENST00000542195 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.74■■■■■ 4.91
VSIG10-209ENST00000542195 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.32■■■■■ 4.85
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VSIG10-209ENST00000542195 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.28■■■■■ 4.84
VSIG10-209ENST00000542195 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.21■■■■■ 4.83
VSIG10-209ENST00000542195 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.16■■■■■ 4.82
VSIG10-209ENST00000542195 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.97■■■■■ 4.79
VSIG10-209ENST00000542195 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.66■■■■■ 4.74
VSIG10-209ENST00000542195 SCRIBQ14160 1630 aa44.5■■■■■ 4.71
VSIG10-209ENST00000542195 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.92■■■■■ 4.62
VSIG10-209ENST00000542195 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.91■■■■■ 4.62
VSIG10-209ENST00000542195 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.83■■■■■ 4.61
VSIG10-209ENST00000542195 NCAPD3P42695 1498 aa42.67■■■■■ 4.42
VSIG10-209ENST00000542195 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.54■■■■■ 4.4
VSIG10-209ENST00000542195 SMARCA4P51532 1647 aa42.51■■■■■ 4.4
VSIG10-209ENST00000542195 SMARCA2P51531 1590 aa42.49■■■■■ 4.39
VSIG10-209ENST00000542195 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.43■■■■■ 4.38
VSIG10-209ENST00000542195 HMGXB3Q12766 1538 aa42.38■■■■■ 4.37
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VSIG10-209ENST00000542195 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.16■■■■■ 4.34
VSIG10-209ENST00000542195 ERCC6Q03468 1493 aa42.07■■■■■ 4.33
VSIG10-209ENST00000542195 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.01■■■■■ 4.32
VSIG10-209ENST00000542195 CUX2O14529 1486 aa41.93■■■■■ 4.3
VSIG10-209ENST00000542195 NESP48681 1621 aa41.77■■■■■ 4.28
VSIG10-209ENST00000542195 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.67■■■■■ 4.26
VSIG10-209ENST00000542195 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.62■■■■■ 4.25
VSIG10-209ENST00000542195 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.48■■■■■ 4.23
VSIG10-209ENST00000542195 WIZO95785 1651 aa41.47■■■■■ 4.23
VSIG10-209ENST00000542195 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.39■■■■■ 4.22
VSIG10-209ENST00000542195 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.34■■■■■ 4.21
VSIG10-209ENST00000542195 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.28■■■■■ 4.2
VSIG10-209ENST00000542195 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.21■■■■■ 4.19
VSIG10-209ENST00000542195 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.09■■■■■ 4.17
VSIG10-209ENST00000542195 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.04■■■■■ 4.16
VSIG10-209ENST00000542195 CFTRP13569 1480 aa40.96■■■■■ 4.15
VSIG10-209ENST00000542195 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.95■■■■■ 4.15
VSIG10-209ENST00000542195 WDR62O43379 1518 aa40.92■■■■■ 4.14
VSIG10-209ENST00000542195 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.9■■■■■ 4.14
VSIG10-209ENST00000542195 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.58■■■■■ 4.09
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VSIG10-209ENST00000542195 PRDM2Q13029 1718 aa40.43■■■■■ 4.06
VSIG10-209ENST00000542195 ABCC8Q09428 1581 aa40.18■■■■■ 4.02
VSIG10-209ENST00000542195 IFT140Q96RY7 1462 aa40.14■■■■■ 4.02
VSIG10-209ENST00000542195 TOPBP1Q92547 1522 aa40.12■■■■■ 4.01
VSIG10-209ENST00000542195 OSCARQ8IYS5 282 aa40.05■■■■■ 4
VSIG10-209ENST00000542195 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.01■■■■■ 4
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VSIG10-209ENST00000542195 TRIM41Q8WV44 630 aa39.8■■■■□ 3.96
VSIG10-209ENST00000542195 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.74■■■■□ 3.95
VSIG10-209ENST00000542195 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.73■■■■□ 3.95
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VSIG10-209ENST00000542195 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.62■■■■□ 3.93
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VSIG10-209ENST00000542195 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.52■■■■□ 3.92
VSIG10-209ENST00000542195 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.51■■■■□ 3.92
VSIG10-209ENST00000542195 CUX1P39880 1505 aa39.47■■■■□ 3.91
VSIG10-209ENST00000542195 WDR97A6NE52 1622 aa39.47■■■■□ 3.91
VSIG10-209ENST00000542195 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.43■■■■□ 3.9
VSIG10-209ENST00000542195 FBLN2P98095 1184 aa39.37■■■■□ 3.89
VSIG10-209ENST00000542195 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.36■■■■□ 3.89
VSIG10-209ENST00000542195 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.36■■■■□ 3.89
VSIG10-209ENST00000542195 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.36■■■■□ 3.89
VSIG10-209ENST00000542195 ARHGEF11O15085 1522 aa39.33■■■■□ 3.89
VSIG10-209ENST00000542195 CHD1O14646 1710 aa39.31■■■■□ 3.88
VSIG10-209ENST00000542195 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.25■■■■□ 3.87
VSIG10-209ENST00000542195 GRIN2BQ13224 1484 aa39.24■■■■□ 3.87
VSIG10-209ENST00000542195 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.24■■■■□ 3.87
VSIG10-209ENST00000542195 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.17■■■■□ 3.86
VSIG10-209ENST00000542195 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.12■■■■□ 3.85
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VSIG10-209ENST00000542195 SYNJ2O15056 1496 aa39.09■■■■□ 3.85
VSIG10-209ENST00000542195 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.06■■■■□ 3.84
VSIG10-209ENST00000542195 SYNJ1O43426 1573 aa39.04■■■■□ 3.84
VSIG10-209ENST00000542195 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.03■■■■□ 3.84
VSIG10-209ENST00000542195 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.98■■■■□ 3.83
VSIG10-209ENST00000542195 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.97■■■■□ 3.83
VSIG10-209ENST00000542195 PBRM1Q86U86 1689 aa38.96■■■■□ 3.83
VSIG10-209ENST00000542195 TOP2BQ02880 1626 aa38.95■■■■□ 3.83
VSIG10-209ENST00000542195 ARAP1Q96P48 1450 aa38.93■■■■□ 3.82
VSIG10-209ENST00000542195 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.92■■■■□ 3.82
VSIG10-209ENST00000542195 GRIN2AQ12879 1464 aa38.71■■■■□ 3.79
VSIG10-209ENST00000542195 ADAMTS12P58397 1594 aa38.68■■■■□ 3.78
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VSIG10-209ENST00000542195 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.66■■■■□ 3.78
VSIG10-209ENST00000542195 NUP160Q12769 1436 aa38.57■■■■□ 3.77
VSIG10-209ENST00000542195 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.56■■■■□ 3.76
VSIG10-209ENST00000542195 CEP170Q5SW79 1584 aa38.48■■■■□ 3.75
VSIG10-209ENST00000542195 SHROOM2Q13796 1616 aa38.31■■■■□ 3.72
VSIG10-209ENST00000542195 KIF27Q86VH2 1401 aa38.29■■■■□ 3.72
VSIG10-209ENST00000542195 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.27■■■■□ 3.72
VSIG10-209ENST00000542195 JPH4Q96JJ6 628 aa38.19■■■■□ 3.7
VSIG10-209ENST00000542195 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.18■■■■□ 3.7
VSIG10-209ENST00000542195 IGF1RP08069 1367 aa38.17■■■■□ 3.7
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