RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542157.5

CD6-211, Transcript of CD6 molecule, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD6, Length 835 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD6-211ENST00000542157 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.12■■■■■ 6.57
CD6-211ENST00000542157 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.33■■■■■ 5.65
CD6-211ENST00000542157 ABCC9O60706 1549 aa50.33■■■■■ 5.65
CD6-211ENST00000542157 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.91■■■■■ 5.26
CD6-211ENST00000542157 NACADO15069 1562 aa47.57■■■■■ 5.21
CD6-211ENST00000542157 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.48■■■■■ 5.19
CD6-211ENST00000542157 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.11■■■■■ 5.13
CD6-211ENST00000542157 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.89■■■■■ 5.1
CD6-211ENST00000542157 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.87■■■■■ 5.09
CD6-211ENST00000542157 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.85■■■■■ 5.09
CD6-211ENST00000542157 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.51■■■■■ 5.04
CD6-211ENST00000542157 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.47■■■■■ 5.03
CD6-211ENST00000542157 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.32■■■■■ 5.01
CD6-211ENST00000542157 SCRIBQ14160 1630 aa45.92■■■■■ 4.94
CD6-211ENST00000542157 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.82■■■■■ 4.93
CD6-211ENST00000542157 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.44■■■■■ 4.87
CD6-211ENST00000542157 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.35■■■■■ 4.85
CD6-211ENST00000542157 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.31■■■■■ 4.84
CD6-211ENST00000542157 NCAPD3P42695 1498 aa43.89■■■■■ 4.62
CD6-211ENST00000542157 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.79■■■■■ 4.6
CD6-211ENST00000542157 SMARCA4P51532 1647 aa43.78■■■■■ 4.6
CD6-211ENST00000542157 SMARCA2P51531 1590 aa43.69■■■■■ 4.58
CD6-211ENST00000542157 HMGXB3Q12766 1538 aa43.58■■■■■ 4.57
CD6-211ENST00000542157 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.57■■■■■ 4.57
CD6-211ENST00000542157 ERCC6Q03468 1493 aa43.47■■■■■ 4.55
CD6-211ENST00000542157 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.41■■■■■ 4.54
CD6-211ENST00000542157 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.3■■■■■ 4.52
CD6-211ENST00000542157 CUX2O14529 1486 aa43.3■■■■■ 4.52
CD6-211ENST00000542157 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.25■■■■■ 4.51
CD6-211ENST00000542157 NESP48681 1621 aa43.23■■■■■ 4.51
CD6-211ENST00000542157 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.23■■■■■ 4.51
CD6-211ENST00000542157 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.92■■■■■ 4.46
CD6-211ENST00000542157 WIZO95785 1651 aa42.76■■■■■ 4.44
CD6-211ENST00000542157 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.76■■■■■ 4.44
CD6-211ENST00000542157 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.7■■■■■ 4.43
CD6-211ENST00000542157 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.69■■■■■ 4.42
CD6-211ENST00000542157 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.59■■■■■ 4.41
CD6-211ENST00000542157 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.37■■■■■ 4.37
CD6-211ENST00000542157 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.32■■■■■ 4.37
CD6-211ENST00000542157 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
CD6-211ENST00000542157 WDR62O43379 1518 aa42.19■■■■■ 4.34
CD6-211ENST00000542157 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.17■■■■■ 4.34
CD6-211ENST00000542157 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.12■■■■■ 4.33
CD6-211ENST00000542157 CFTRP13569 1480 aa42.1■■■■■ 4.33
CD6-211ENST00000542157 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.28
CD6-211ENST00000542157 PRDM2Q13029 1718 aa41.75■■■■■ 4.27
CD6-211ENST00000542157 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.72■■■■■ 4.27
CD6-211ENST00000542157 TRIM41Q8WV44 630 aa41.46■■■■■ 4.23
CD6-211ENST00000542157 OSCARQ8IYS5 282 aa41.39■■■■■ 4.22
CD6-211ENST00000542157 TOPBP1Q92547 1522 aa41.33■■■■■ 4.21
CD6-211ENST00000542157 IFT140Q96RY7 1462 aa41.32■■■■■ 4.2
CD6-211ENST00000542157 ABCC8Q09428 1581 aa41.25■■■■■ 4.19
CD6-211ENST00000542157 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.24■■■■■ 4.19
CD6-211ENST00000542157 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.19■■■■■ 4.18
CD6-211ENST00000542157 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
CD6-211ENST00000542157 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.94■■■■■ 4.14
CD6-211ENST00000542157 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.9■■■■■ 4.14
CD6-211ENST00000542157 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.9■■■■■ 4.14
CD6-211ENST00000542157 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.83■■■■■ 4.13
CD6-211ENST00000542157 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.83■■■■■ 4.13
CD6-211ENST00000542157 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.83■■■■■ 4.13
CD6-211ENST00000542157 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.78■■■■■ 4.12
CD6-211ENST00000542157 CHD1O14646 1710 aa40.76■■■■■ 4.11
CD6-211ENST00000542157 SOGA1O94964 1423 aa40.75■■■■■ 4.11
CD6-211ENST00000542157 ARHGEF11O15085 1522 aa40.69■■■■■ 4.1
CD6-211ENST00000542157 FBLN2P98095 1184 aa40.69■■■■■ 4.1
CD6-211ENST00000542157 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.68■■■■■ 4.1
CD6-211ENST00000542157 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
CD6-211ENST00000542157 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
CD6-211ENST00000542157 CUX1P39880 1505 aa40.63■■■■■ 4.1
CD6-211ENST00000542157 WDR97A6NE52 1622 aa40.52■■■■■ 4.08
CD6-211ENST00000542157 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.48■■■■■ 4.07
CD6-211ENST00000542157 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.44■■■■■ 4.06
CD6-211ENST00000542157 GRIN2BQ13224 1484 aa40.38■■■■■ 4.05
CD6-211ENST00000542157 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.37■■■■■ 4.05
CD6-211ENST00000542157 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
CD6-211ENST00000542157 ARAP1Q96P48 1450 aa40.29■■■■■ 4.04
CD6-211ENST00000542157 PBRM1Q86U86 1689 aa40.25■■■■■ 4.03
CD6-211ENST00000542157 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.25■■■■■ 4.03
CD6-211ENST00000542157 SYNJ1O43426 1573 aa40.24■■■■■ 4.03
CD6-211ENST00000542157 SYNJ2O15056 1496 aa40.23■■■■■ 4.03
CD6-211ENST00000542157 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.21■■■■■ 4.03
CD6-211ENST00000542157 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.19■■■■■ 4.02
CD6-211ENST00000542157 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.13■■■■■ 4.01
CD6-211ENST00000542157 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.07■■■■■ 4
CD6-211ENST00000542157 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.02■■■■■ 4
CD6-211ENST00000542157 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.01■■■■■ 4
CD6-211ENST00000542157 TOP2BQ02880 1626 aa40■■■■□ 3.99
CD6-211ENST00000542157 GRIN2AQ12879 1464 aa39.85■■■■□ 3.97
CD6-211ENST00000542157 ADAMTS12P58397 1594 aa39.84■■■■□ 3.97
CD6-211ENST00000542157 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.73■■■■□ 3.95
CD6-211ENST00000542157 CEP170Q5SW79 1584 aa39.7■■■■□ 3.95
CD6-211ENST00000542157 NUP160Q12769 1436 aa39.69■■■■□ 3.94
CD6-211ENST00000542157 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.69■■■■□ 3.94
CD6-211ENST00000542157 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.63■■■■□ 3.93
CD6-211ENST00000542157 SHROOM2Q13796 1616 aa39.51■■■■□ 3.91
CD6-211ENST00000542157 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.35■■■■□ 3.89
CD6-211ENST00000542157 JPH4Q96JJ6 628 aa39.33■■■■□ 3.89
CD6-211ENST00000542157 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.27■■■■□ 3.88
CD6-211ENST00000542157 KIF27Q86VH2 1401 aa39.25■■■■□ 3.87
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