RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541434.5

CADM1-211, Transcript of cell adhesion molecule 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CADM1, Length 1,112 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1-211ENST00000541434 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.9■■■■□ 3.5
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CADM1-211ENST00000541434 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
CADM1-211ENST00000541434 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.79■■■□□ 2.52
CADM1-211ENST00000541434 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.51■■■□□ 2.47
CADM1-211ENST00000541434 NACADO15069 1562 aa30.4■■■□□ 2.46
CADM1-211ENST00000541434 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.39■■■□□ 2.46
CADM1-211ENST00000541434 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.26■■■□□ 2.43
CADM1-211ENST00000541434 SCRIBQ14160 1630 aa29.71■■■□□ 2.35
CADM1-211ENST00000541434 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.66■■■□□ 2.34
CADM1-211ENST00000541434 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.54■■■□□ 2.32
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CADM1-211ENST00000541434 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.72■■■□□ 2.19
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CADM1-211ENST00000541434 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.46■■■□□ 2.15
CADM1-211ENST00000541434 SMARCA4P51532 1647 aa28.46■■■□□ 2.15
CADM1-211ENST00000541434 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
CADM1-211ENST00000541434 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
CADM1-211ENST00000541434 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.25■■■□□ 2.11
CADM1-211ENST00000541434 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.2■■■□□ 2.1
CADM1-211ENST00000541434 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.19■■■□□ 2.1
CADM1-211ENST00000541434 WIZO95785 1651 aa28.17■■■□□ 2.1
CADM1-211ENST00000541434 SMARCA2P51531 1590 aa28.16■■■□□ 2.1
CADM1-211ENST00000541434 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.15■■■□□ 2.1
CADM1-211ENST00000541434 NCAPD3P42695 1498 aa28.08■■■□□ 2.09
CADM1-211ENST00000541434 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
CADM1-211ENST00000541434 HMGXB3Q12766 1538 aa27.92■■■□□ 2.06
CADM1-211ENST00000541434 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
CADM1-211ENST00000541434 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.64■■■□□ 2.01
CADM1-211ENST00000541434 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.34■■□□□ 1.97
CADM1-211ENST00000541434 CFTRP13569 1480 aa27.26■■□□□ 1.95
CADM1-211ENST00000541434 NESP48681 1621 aa27.23■■□□□ 1.95
CADM1-211ENST00000541434 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.18■■□□□ 1.94
CADM1-211ENST00000541434 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.05■■□□□ 1.92
CADM1-211ENST00000541434 PRDM2Q13029 1718 aa26.99■■□□□ 1.91
CADM1-211ENST00000541434 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.98■■□□□ 1.91
CADM1-211ENST00000541434 ERCC6Q03468 1493 aa26.87■■□□□ 1.89
CADM1-211ENST00000541434 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.87■■□□□ 1.89
CADM1-211ENST00000541434 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.84■■□□□ 1.89
CADM1-211ENST00000541434 ABCC8Q09428 1581 aa26.79■■□□□ 1.88
CADM1-211ENST00000541434 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.77■■□□□ 1.88
CADM1-211ENST00000541434 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.75■■□□□ 1.87
CADM1-211ENST00000541434 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.69■■□□□ 1.86
CADM1-211ENST00000541434 TRIM41Q8WV44 630 aa26.69■■□□□ 1.86
CADM1-211ENST00000541434 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
CADM1-211ENST00000541434 CUX1P39880 1505 aa26.65■■□□□ 1.86
CADM1-211ENST00000541434 TOPBP1Q92547 1522 aa26.61■■□□□ 1.85
CADM1-211ENST00000541434 SYNJ1O43426 1573 aa26.6■■□□□ 1.85
CADM1-211ENST00000541434 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.6■■□□□ 1.85
CADM1-211ENST00000541434 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
CADM1-211ENST00000541434 TOP2BQ02880 1626 aa26.57■■□□□ 1.84
CADM1-211ENST00000541434 WDR62O43379 1518 aa26.55■■□□□ 1.84
CADM1-211ENST00000541434 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.53■■□□□ 1.84
CADM1-211ENST00000541434 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.47■■□□□ 1.83
CADM1-211ENST00000541434 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
CADM1-211ENST00000541434 SOGA1O94964 1423 aa26.4■■□□□ 1.82
CADM1-211ENST00000541434 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.36■■□□□ 1.81
CADM1-211ENST00000541434 CUX2O14529 1486 aa26.35■■□□□ 1.81
CADM1-211ENST00000541434 IFT140Q96RY7 1462 aa26.3■■□□□ 1.8
CADM1-211ENST00000541434 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
CADM1-211ENST00000541434 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.23■■□□□ 1.79
CADM1-211ENST00000541434 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
CADM1-211ENST00000541434 KIF27Q86VH2 1401 aa26.15■■□□□ 1.78
CADM1-211ENST00000541434 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
CADM1-211ENST00000541434 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.14■■□□□ 1.78
CADM1-211ENST00000541434 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.77
CADM1-211ENST00000541434 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.11■■□□□ 1.77
CADM1-211ENST00000541434 WDR97A6NE52 1622 aa26.11■■□□□ 1.77
CADM1-211ENST00000541434 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.07■■□□□ 1.76
CADM1-211ENST00000541434 EEA1Q15075 1411 aa26.05■■□□□ 1.76
CADM1-211ENST00000541434 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.04■■□□□ 1.76
CADM1-211ENST00000541434 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.02■■□□□ 1.76
CADM1-211ENST00000541434 IGF1RP08069 1367 aa26.01■■□□□ 1.75
CADM1-211ENST00000541434 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CADM1-211ENST00000541434 GRIN2BQ13224 1484 aa25.96■■□□□ 1.75
CADM1-211ENST00000541434 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.91■■□□□ 1.74
CADM1-211ENST00000541434 PBRM1Q86U86 1689 aa25.87■■□□□ 1.73
CADM1-211ENST00000541434 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.87■■□□□ 1.73
CADM1-211ENST00000541434 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.82■■□□□ 1.72
CADM1-211ENST00000541434 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
CADM1-211ENST00000541434 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.79■■□□□ 1.72
CADM1-211ENST00000541434 PRXQ9BXM0 1461 aa25.79■■□□□ 1.72
CADM1-211ENST00000541434 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.77■■□□□ 1.72
CADM1-211ENST00000541434 CUL7Q14999 1698 aa25.77■■□□□ 1.72
CADM1-211ENST00000541434 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
CADM1-211ENST00000541434 FBLN2P98095 1184 aa25.75■■□□□ 1.71
CADM1-211ENST00000541434 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.73■■□□□ 1.71
CADM1-211ENST00000541434 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.73■■□□□ 1.71
CADM1-211ENST00000541434 ADAMTS12P58397 1594 aa25.72■■□□□ 1.71
CADM1-211ENST00000541434 SYNJ2O15056 1496 aa25.71■■□□□ 1.71
CADM1-211ENST00000541434 KIF21BO75037 1637 aa25.68■■□□□ 1.7
CADM1-211ENST00000541434 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
CADM1-211ENST00000541434 GOLGA3Q08378 1498 aa25.64■■□□□ 1.69
CADM1-211ENST00000541434 GRIN2AQ12879 1464 aa25.61■■□□□ 1.69
CADM1-211ENST00000541434 CHD1O14646 1710 aa25.54■■□□□ 1.68
CADM1-211ENST00000541434 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.48■■□□□ 1.67
CADM1-211ENST00000541434 OSCARQ8IYS5 282 aa25.48■■□□□ 1.67
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