RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541028.5

MYO5C-202, Transcript of myosin VC, humanhuman

TSL 2

Gene MYO5C, Length 999 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO5C-202ENST00000541028 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.08■■■■■ 4.17
MYO5C-202ENST00000541028 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.77■■■■□ 3.48
MYO5C-202ENST00000541028 ABCC9O60706 1549 aa36.29■■■■□ 3.4
MYO5C-202ENST00000541028 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.78■■■■□ 3.16
MYO5C-202ENST00000541028 NACADO15069 1562 aa34.66■■■■□ 3.14
MYO5C-202ENST00000541028 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.35■■■■□ 3.09
MYO5C-202ENST00000541028 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.31■■■■□ 3.08
MYO5C-202ENST00000541028 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
MYO5C-202ENST00000541028 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.04■■■■□ 3.04
MYO5C-202ENST00000541028 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.03■■■■□ 3.04
MYO5C-202ENST00000541028 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.79■■■■□ 3
MYO5C-202ENST00000541028 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.77■■■■□ 3
MYO5C-202ENST00000541028 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.72■■■□□ 2.99
MYO5C-202ENST00000541028 SCRIBQ14160 1630 aa33.42■■■□□ 2.94
MYO5C-202ENST00000541028 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.42■■■□□ 2.94
MYO5C-202ENST00000541028 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.9■■■□□ 2.86
MYO5C-202ENST00000541028 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.87■■■□□ 2.85
MYO5C-202ENST00000541028 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.68■■■□□ 2.82
MYO5C-202ENST00000541028 SMARCA4P51532 1647 aa31.98■■■□□ 2.71
MYO5C-202ENST00000541028 NCAPD3P42695 1498 aa31.97■■■□□ 2.71
MYO5C-202ENST00000541028 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.91■■■□□ 2.7
MYO5C-202ENST00000541028 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.87■■■□□ 2.69
MYO5C-202ENST00000541028 SMARCA2P51531 1590 aa31.85■■■□□ 2.69
MYO5C-202ENST00000541028 HMGXB3Q12766 1538 aa31.8■■■□□ 2.68
MYO5C-202ENST00000541028 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.73■■■□□ 2.67
MYO5C-202ENST00000541028 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.64■■■□□ 2.65
MYO5C-202ENST00000541028 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
MYO5C-202ENST00000541028 ERCC6Q03468 1493 aa31.3■■■□□ 2.6
MYO5C-202ENST00000541028 NESP48681 1621 aa31.29■■■□□ 2.6
MYO5C-202ENST00000541028 WIZO95785 1651 aa31.27■■■□□ 2.6
MYO5C-202ENST00000541028 CUX2O14529 1486 aa31.21■■■□□ 2.59
MYO5C-202ENST00000541028 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.21■■■□□ 2.59
MYO5C-202ENST00000541028 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.11■■■□□ 2.57
MYO5C-202ENST00000541028 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
MYO5C-202ENST00000541028 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.98■■■□□ 2.55
MYO5C-202ENST00000541028 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.97■■■□□ 2.55
MYO5C-202ENST00000541028 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.96■■■□□ 2.55
MYO5C-202ENST00000541028 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
MYO5C-202ENST00000541028 CFTRP13569 1480 aa30.74■■■□□ 2.51
MYO5C-202ENST00000541028 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.72■■■□□ 2.51
MYO5C-202ENST00000541028 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.69■■■□□ 2.5
MYO5C-202ENST00000541028 WDR62O43379 1518 aa30.64■■■□□ 2.5
MYO5C-202ENST00000541028 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.63■■■□□ 2.49
MYO5C-202ENST00000541028 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.63■■■□□ 2.49
MYO5C-202ENST00000541028 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.55■■■□□ 2.48
MYO5C-202ENST00000541028 PRDM2Q13029 1718 aa30.53■■■□□ 2.48
MYO5C-202ENST00000541028 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
MYO5C-202ENST00000541028 TOPBP1Q92547 1522 aa30.1■■■□□ 2.41
MYO5C-202ENST00000541028 ABCC8Q09428 1581 aa30.08■■■□□ 2.41
MYO5C-202ENST00000541028 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.04■■■□□ 2.4
MYO5C-202ENST00000541028 IFT140Q96RY7 1462 aa30.01■■■□□ 2.4
MYO5C-202ENST00000541028 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
MYO5C-202ENST00000541028 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
MYO5C-202ENST00000541028 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
MYO5C-202ENST00000541028 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
MYO5C-202ENST00000541028 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
MYO5C-202ENST00000541028 OSCARQ8IYS5 282 aa29.76■■■□□ 2.35
MYO5C-202ENST00000541028 CUX1P39880 1505 aa29.71■■■□□ 2.35
MYO5C-202ENST00000541028 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.66■■■□□ 2.34
MYO5C-202ENST00000541028 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.66■■■□□ 2.34
MYO5C-202ENST00000541028 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.65■■■□□ 2.34
MYO5C-202ENST00000541028 SOGA1O94964 1423 aa29.64■■■□□ 2.34
MYO5C-202ENST00000541028 WDR97A6NE52 1622 aa29.61■■■□□ 2.33
MYO5C-202ENST00000541028 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
MYO5C-202ENST00000541028 CHD1O14646 1710 aa29.51■■■□□ 2.32
MYO5C-202ENST00000541028 TRIM41Q8WV44 630 aa29.42■■■□□ 2.3
MYO5C-202ENST00000541028 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.39■■■□□ 2.3
MYO5C-202ENST00000541028 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.39■■■□□ 2.3
MYO5C-202ENST00000541028 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.39■■■□□ 2.3
MYO5C-202ENST00000541028 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.39■■■□□ 2.3
MYO5C-202ENST00000541028 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.39■■■□□ 2.3
MYO5C-202ENST00000541028 GRIN2BQ13224 1484 aa29.38■■■□□ 2.29
MYO5C-202ENST00000541028 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.38■■■□□ 2.29
MYO5C-202ENST00000541028 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
MYO5C-202ENST00000541028 TOP2BQ02880 1626 aa29.36■■■□□ 2.29
MYO5C-202ENST00000541028 ARHGEF11O15085 1522 aa29.34■■■□□ 2.29
MYO5C-202ENST00000541028 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.33■■■□□ 2.29
MYO5C-202ENST00000541028 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.33■■■□□ 2.29
MYO5C-202ENST00000541028 PBRM1Q86U86 1689 aa29.32■■■□□ 2.28
MYO5C-202ENST00000541028 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.32■■■□□ 2.28
MYO5C-202ENST00000541028 SYNJ1O43426 1573 aa29.3■■■□□ 2.28
MYO5C-202ENST00000541028 FBLN2P98095 1184 aa29.3■■■□□ 2.28
MYO5C-202ENST00000541028 SYNJ2O15056 1496 aa29.25■■■□□ 2.27
MYO5C-202ENST00000541028 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.2■■■□□ 2.27
MYO5C-202ENST00000541028 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
MYO5C-202ENST00000541028 ARAP1Q96P48 1450 aa29.07■■■□□ 2.24
MYO5C-202ENST00000541028 ADAMTS12P58397 1594 aa29.06■■■□□ 2.24
MYO5C-202ENST00000541028 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.04■■■□□ 2.24
MYO5C-202ENST00000541028 GRIN2AQ12879 1464 aa29.01■■■□□ 2.23
MYO5C-202ENST00000541028 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29■■■□□ 2.23
MYO5C-202ENST00000541028 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.96■■■□□ 2.23
MYO5C-202ENST00000541028 NUP160Q12769 1436 aa28.93■■■□□ 2.22
MYO5C-202ENST00000541028 CEP170Q5SW79 1584 aa28.89■■■□□ 2.22
MYO5C-202ENST00000541028 SHROOM2Q13796 1616 aa28.79■■■□□ 2.2
MYO5C-202ENST00000541028 KIF27Q86VH2 1401 aa28.74■■■□□ 2.19
MYO5C-202ENST00000541028 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.72■■■□□ 2.19
MYO5C-202ENST00000541028 IGF1RP08069 1367 aa28.7■■■□□ 2.18
MYO5C-202ENST00000541028 CUL7Q14999 1698 aa28.68■■■□□ 2.18
MYO5C-202ENST00000541028 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.65■■■□□ 2.18
MYO5C-202ENST00000541028 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
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