RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540276.1

TMEM132A-211, Transcript of transmembrane protein 132A, humanhuman

TSL 3

Gene TMEM132A, Length 514 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM132A-211ENST00000540276 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.64■■■■■ 7.62
TMEM132A-211ENST00000540276 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.1■■■■■ 6.57
TMEM132A-211ENST00000540276 ABCC9O60706 1549 aa55.85■■■■■ 6.53
TMEM132A-211ENST00000540276 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.27■■■■■ 6.12
TMEM132A-211ENST00000540276 NACADO15069 1562 aa52.95■■■■■ 6.07
TMEM132A-211ENST00000540276 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.72■■■■■ 6.03
TMEM132A-211ENST00000540276 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.31■■■■■ 5.96
TMEM132A-211ENST00000540276 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.14■■■■■ 5.94
TMEM132A-211ENST00000540276 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.1■■■■■ 5.93
TMEM132A-211ENST00000540276 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.02■■■■■ 5.92
TMEM132A-211ENST00000540276 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.99■■■■■ 5.91
TMEM132A-211ENST00000540276 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.74■■■■■ 5.87
TMEM132A-211ENST00000540276 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.73■■■■■ 5.87
TMEM132A-211ENST00000540276 SCRIBQ14160 1630 aa51.16■■■■■ 5.78
TMEM132A-211ENST00000540276 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.03■■■■■ 5.76
TMEM132A-211ENST00000540276 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.47■■■■■ 5.67
TMEM132A-211ENST00000540276 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.43■■■■■ 5.66
TMEM132A-211ENST00000540276 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.27■■■■■ 5.64
TMEM132A-211ENST00000540276 NCAPD3P42695 1498 aa48.88■■■■■ 5.42
TMEM132A-211ENST00000540276 SMARCA4P51532 1647 aa48.83■■■■■ 5.41
TMEM132A-211ENST00000540276 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.79■■■■■ 5.4
TMEM132A-211ENST00000540276 SMARCA2P51531 1590 aa48.66■■■■■ 5.38
TMEM132A-211ENST00000540276 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.6■■■■■ 5.37
TMEM132A-211ENST00000540276 HMGXB3Q12766 1538 aa48.57■■■■■ 5.37
TMEM132A-211ENST00000540276 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.34■■■■■ 5.33
TMEM132A-211ENST00000540276 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.34■■■■■ 5.33
TMEM132A-211ENST00000540276 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.29■■■■■ 5.32
TMEM132A-211ENST00000540276 ERCC6Q03468 1493 aa48.19■■■■■ 5.31
TMEM132A-211ENST00000540276 NESP48681 1621 aa48.07■■■■■ 5.29
TMEM132A-211ENST00000540276 CUX2O14529 1486 aa48.01■■■■■ 5.28
TMEM132A-211ENST00000540276 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.75■■■■■ 5.24
TMEM132A-211ENST00000540276 WIZO95785 1651 aa47.73■■■■■ 5.23
TMEM132A-211ENST00000540276 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.65■■■■■ 5.22
TMEM132A-211ENST00000540276 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.54■■■■■ 5.2
TMEM132A-211ENST00000540276 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.47■■■■■ 5.19
TMEM132A-211ENST00000540276 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.45■■■■■ 5.19
TMEM132A-211ENST00000540276 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.4■■■■■ 5.18
TMEM132A-211ENST00000540276 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.37■■■■■ 5.17
TMEM132A-211ENST00000540276 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.14■■■■■ 5.14
TMEM132A-211ENST00000540276 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.05■■■■■ 5.12
TMEM132A-211ENST00000540276 CFTRP13569 1480 aa46.94■■■■■ 5.1
TMEM132A-211ENST00000540276 WDR62O43379 1518 aa46.94■■■■■ 5.1
TMEM132A-211ENST00000540276 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.92■■■■■ 5.1
TMEM132A-211ENST00000540276 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.89■■■■■ 5.1
TMEM132A-211ENST00000540276 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.59■■■■■ 5.05
TMEM132A-211ENST00000540276 PRDM2Q13029 1718 aa46.51■■■■■ 5.04
TMEM132A-211ENST00000540276 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.5■■■■■ 5.03
TMEM132A-211ENST00000540276 TOPBP1Q92547 1522 aa46.04■■■■■ 4.96
TMEM132A-211ENST00000540276 IFT140Q96RY7 1462 aa45.96■■■■■ 4.95
TMEM132A-211ENST00000540276 ABCC8Q09428 1581 aa45.92■■■■■ 4.94
TMEM132A-211ENST00000540276 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.9■■■■■ 4.94
TMEM132A-211ENST00000540276 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.89■■■■■ 4.94
TMEM132A-211ENST00000540276 OSCARQ8IYS5 282 aa45.82■■■■■ 4.93
TMEM132A-211ENST00000540276 TRIM41Q8WV44 630 aa45.7■■■■■ 4.91
TMEM132A-211ENST00000540276 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.67■■■■■ 4.9
TMEM132A-211ENST00000540276 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.62■■■■■ 4.89
TMEM132A-211ENST00000540276 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.59■■■■■ 4.89
TMEM132A-211ENST00000540276 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.49■■■■■ 4.87
TMEM132A-211ENST00000540276 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.46■■■■■ 4.87
TMEM132A-211ENST00000540276 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.42■■■■■ 4.86
TMEM132A-211ENST00000540276 CUX1P39880 1505 aa45.36■■■■■ 4.85
TMEM132A-211ENST00000540276 SOGA1O94964 1423 aa45.35■■■■■ 4.85
TMEM132A-211ENST00000540276 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.35■■■■■ 4.85
TMEM132A-211ENST00000540276 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.26■■■■■ 4.84
TMEM132A-211ENST00000540276 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.26■■■■■ 4.84
TMEM132A-211ENST00000540276 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.26■■■■■ 4.84
TMEM132A-211ENST00000540276 CHD1O14646 1710 aa45.26■■■■■ 4.84
TMEM132A-211ENST00000540276 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.25■■■■■ 4.83
TMEM132A-211ENST00000540276 WDR97A6NE52 1622 aa45.15■■■■■ 4.82
TMEM132A-211ENST00000540276 ARHGEF11O15085 1522 aa45.15■■■■■ 4.82
TMEM132A-211ENST00000540276 FBLN2P98095 1184 aa45.11■■■■■ 4.81
TMEM132A-211ENST00000540276 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.05■■■■■ 4.8
TMEM132A-211ENST00000540276 GRIN2BQ13224 1484 aa44.94■■■■■ 4.78
TMEM132A-211ENST00000540276 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.92■■■■■ 4.78
TMEM132A-211ENST00000540276 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.84■■■■■ 4.77
TMEM132A-211ENST00000540276 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.83■■■■■ 4.77
TMEM132A-211ENST00000540276 PBRM1Q86U86 1689 aa44.83■■■■■ 4.77
TMEM132A-211ENST00000540276 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.82■■■■■ 4.77
TMEM132A-211ENST00000540276 SYNJ2O15056 1496 aa44.78■■■■■ 4.76
TMEM132A-211ENST00000540276 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.77■■■■■ 4.76
TMEM132A-211ENST00000540276 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.75■■■■■ 4.76
TMEM132A-211ENST00000540276 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.75■■■■■ 4.75
TMEM132A-211ENST00000540276 SYNJ1O43426 1573 aa44.73■■■■■ 4.75
TMEM132A-211ENST00000540276 ARAP1Q96P48 1450 aa44.72■■■■■ 4.75
TMEM132A-211ENST00000540276 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.7■■■■■ 4.75
TMEM132A-211ENST00000540276 TOP2BQ02880 1626 aa44.69■■■■■ 4.74
TMEM132A-211ENST00000540276 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.68■■■■■ 4.74
TMEM132A-211ENST00000540276 ADAMTS12P58397 1594 aa44.42■■■■■ 4.7
TMEM132A-211ENST00000540276 GRIN2AQ12879 1464 aa44.38■■■■■ 4.69
TMEM132A-211ENST00000540276 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.28■■■■■ 4.68
TMEM132A-211ENST00000540276 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.26■■■■■ 4.68
TMEM132A-211ENST00000540276 CEP170Q5SW79 1584 aa44.23■■■■■ 4.67
TMEM132A-211ENST00000540276 NUP160Q12769 1436 aa44.22■■■■■ 4.67
TMEM132A-211ENST00000540276 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.17■■■■■ 4.66
TMEM132A-211ENST00000540276 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.09■■■■■ 4.65
TMEM132A-211ENST00000540276 SHROOM2Q13796 1616 aa44■■■■■ 4.63
TMEM132A-211ENST00000540276 KIF27Q86VH2 1401 aa43.8■■■■■ 4.6
TMEM132A-211ENST00000540276 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.78■■■■■ 4.6
TMEM132A-211ENST00000540276 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.76■■■■■ 4.6
TMEM132A-211ENST00000540276 IGF1RP08069 1367 aa43.76■■■■■ 4.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 229.2 ms