RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540088.1

RASSF3-203, Transcript of Ras association domain family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene RASSF3, Length 435 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3-203ENST00000540088 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.37■■■■■ 6.77
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RASSF3-203ENST00000540088 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.42■■■■■ 5.34
RASSF3-203ENST00000540088 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.29■■■■■ 5.32
RASSF3-203ENST00000540088 NACADO15069 1562 aa48.22■■■■■ 5.31
RASSF3-203ENST00000540088 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.72■■■■■ 5.23
RASSF3-203ENST00000540088 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.71■■■■■ 5.23
RASSF3-203ENST00000540088 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.38■■■■■ 5.18
RASSF3-203ENST00000540088 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.28■■■■■ 5.16
RASSF3-203ENST00000540088 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.19■■■■■ 5.14
RASSF3-203ENST00000540088 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.9■■■■■ 5.1
RASSF3-203ENST00000540088 SCRIBQ14160 1630 aa46.77■■■■■ 5.08
RASSF3-203ENST00000540088 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.68■■■■■ 5.06
RASSF3-203ENST00000540088 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.36■■■■■ 5.01
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RASSF3-203ENST00000540088 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.67■■■■■ 4.9
RASSF3-203ENST00000540088 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.45■■■■■ 4.87
RASSF3-203ENST00000540088 SMARCA4P51532 1647 aa44.63■■■■■ 4.73
RASSF3-203ENST00000540088 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.52■■■■■ 4.72
RASSF3-203ENST00000540088 NCAPD3P42695 1498 aa44.47■■■■■ 4.71
RASSF3-203ENST00000540088 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.47■■■■■ 4.71
RASSF3-203ENST00000540088 SMARCA2P51531 1590 aa44.43■■■■■ 4.7
RASSF3-203ENST00000540088 HMGXB3Q12766 1538 aa44.24■■■■■ 4.67
RASSF3-203ENST00000540088 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.23■■■■■ 4.67
RASSF3-203ENST00000540088 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.15■■■■■ 4.66
RASSF3-203ENST00000540088 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.12■■■■■ 4.65
RASSF3-203ENST00000540088 WIZO95785 1651 aa43.76■■■■■ 4.6
RASSF3-203ENST00000540088 ERCC6Q03468 1493 aa43.67■■■■■ 4.58
RASSF3-203ENST00000540088 NESP48681 1621 aa43.6■■■■■ 4.57
RASSF3-203ENST00000540088 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.56■■■■■ 4.56
RASSF3-203ENST00000540088 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.41■■■■■ 4.54
RASSF3-203ENST00000540088 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.26■■■■■ 4.52
RASSF3-203ENST00000540088 CUX2O14529 1486 aa43.25■■■■■ 4.51
RASSF3-203ENST00000540088 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.19■■■■■ 4.5
RASSF3-203ENST00000540088 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.16■■■■■ 4.5
RASSF3-203ENST00000540088 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.08■■■■■ 4.49
RASSF3-203ENST00000540088 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43■■■■■ 4.47
RASSF3-203ENST00000540088 CFTRP13569 1480 aa42.83■■■■■ 4.45
RASSF3-203ENST00000540088 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.74■■■■■ 4.43
RASSF3-203ENST00000540088 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.74■■■■■ 4.43
RASSF3-203ENST00000540088 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.74■■■■■ 4.43
RASSF3-203ENST00000540088 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.74■■■■■ 4.43
RASSF3-203ENST00000540088 WDR62O43379 1518 aa42.57■■■■■ 4.41
RASSF3-203ENST00000540088 PRDM2Q13029 1718 aa42.52■■■■■ 4.4
RASSF3-203ENST00000540088 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.36■■■■■ 4.37
RASSF3-203ENST00000540088 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.31■■■■■ 4.36
RASSF3-203ENST00000540088 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.3■■■■■ 4.36
RASSF3-203ENST00000540088 TOPBP1Q92547 1522 aa42■■■■■ 4.31
RASSF3-203ENST00000540088 ABCC8Q09428 1581 aa41.95■■■■■ 4.31
RASSF3-203ENST00000540088 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.92■■■■■ 4.3
RASSF3-203ENST00000540088 IFT140Q96RY7 1462 aa41.83■■■■■ 4.29
RASSF3-203ENST00000540088 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.68■■■■■ 4.26
RASSF3-203ENST00000540088 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.6■■■■■ 4.25
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RASSF3-203ENST00000540088 CUX1P39880 1505 aa41.53■■■■■ 4.24
RASSF3-203ENST00000540088 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.52■■■■■ 4.24
RASSF3-203ENST00000540088 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.47■■■■■ 4.23
RASSF3-203ENST00000540088 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.46■■■■■ 4.23
RASSF3-203ENST00000540088 SOGA1O94964 1423 aa41.45■■■■■ 4.23
RASSF3-203ENST00000540088 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.41■■■■■ 4.22
RASSF3-203ENST00000540088 OSCARQ8IYS5 282 aa41.41■■■■■ 4.22
RASSF3-203ENST00000540088 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.28■■■■■ 4.2
RASSF3-203ENST00000540088 WDR97A6NE52 1622 aa41.18■■■■■ 4.18
RASSF3-203ENST00000540088 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.13■■■■■ 4.17
RASSF3-203ENST00000540088 FBLN2P98095 1184 aa41.11■■■■■ 4.17
RASSF3-203ENST00000540088 CHD1O14646 1710 aa41.09■■■■■ 4.17
RASSF3-203ENST00000540088 TOP2BQ02880 1626 aa41.05■■■■■ 4.16
RASSF3-203ENST00000540088 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.04■■■■■ 4.16
RASSF3-203ENST00000540088 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.04■■■■■ 4.16
RASSF3-203ENST00000540088 SYNJ1O43426 1573 aa41.03■■■■■ 4.16
RASSF3-203ENST00000540088 GRIN2BQ13224 1484 aa41.02■■■■■ 4.16
RASSF3-203ENST00000540088 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.01■■■■■ 4.16
RASSF3-203ENST00000540088 TRIM41Q8WV44 630 aa40.97■■■■■ 4.15
RASSF3-203ENST00000540088 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.96■■■■■ 4.15
RASSF3-203ENST00000540088 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.94■■■■■ 4.14
RASSF3-203ENST00000540088 PBRM1Q86U86 1689 aa40.92■■■■■ 4.14
RASSF3-203ENST00000540088 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.89■■■■■ 4.14
RASSF3-203ENST00000540088 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
RASSF3-203ENST00000540088 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.79■■■■■ 4.12
RASSF3-203ENST00000540088 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.79■■■■■ 4.12
RASSF3-203ENST00000540088 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.79■■■■■ 4.12
RASSF3-203ENST00000540088 SYNJ2O15056 1496 aa40.78■■■■■ 4.12
RASSF3-203ENST00000540088 ARHGEF11O15085 1522 aa40.73■■■■■ 4.11
RASSF3-203ENST00000540088 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.57■■■■■ 4.09
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RASSF3-203ENST00000540088 GRIN2AQ12879 1464 aa40.48■■■■■ 4.07
RASSF3-203ENST00000540088 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.47■■■■■ 4.07
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RASSF3-203ENST00000540088 ARAP1Q96P48 1450 aa40.38■■■■■ 4.05
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RASSF3-203ENST00000540088 CEP170Q5SW79 1584 aa40.29■■■■■ 4.04
RASSF3-203ENST00000540088 NUP160Q12769 1436 aa40.27■■■■■ 4.04
RASSF3-203ENST00000540088 IGF1RP08069 1367 aa40.13■■■■■ 4.02
RASSF3-203ENST00000540088 CUL7Q14999 1698 aa40.11■■■■■ 4.01
RASSF3-203ENST00000540088 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.01■■■■■ 4
RASSF3-203ENST00000540088 SHROOM2Q13796 1616 aa40.01■■■■■ 4
RASSF3-203ENST00000540088 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.96■■■■□ 3.99
RASSF3-203ENST00000540088 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.95■■■■□ 3.99
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