RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539784.1

TSPAN9-IT1-201, TSPAN9 intronic transcript 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene TSPAN9-IT1, Length 562 nt, Biotype sense intronic.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.49■■■□□ 2.63
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TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.25■■□□□ 1.63
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TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 SMARCA2P51531 1590 aa24.42■■□□□ 1.5
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TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
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TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 ERCC6Q03468 1493 aa24.14■■□□□ 1.46
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TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.91■■□□□ 1.42
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TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.78■■□□□ 1.4
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TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 CFTRP13569 1480 aa23.55■■□□□ 1.36
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.55■■□□□ 1.36
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.54■■□□□ 1.36
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 WDR62O43379 1518 aa23.49■■□□□ 1.35
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.45■■□□□ 1.34
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 PRDM2Q13029 1718 aa23.34■■□□□ 1.33
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TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 TOPBP1Q92547 1522 aa23.11■■□□□ 1.29
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TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.05■■□□□ 1.28
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 ABCC8Q09428 1581 aa23.04■■□□□ 1.28
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 IFT140Q96RY7 1462 aa23.04■■□□□ 1.28
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 OSCARQ8IYS5 282 aa22.93■■□□□ 1.26
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TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
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TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.25
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.84■■□□□ 1.25
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 CUX1P39880 1505 aa22.81■■□□□ 1.24
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 SOGA1O94964 1423 aa22.81■■□□□ 1.24
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.8■■□□□ 1.24
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 FBLN2P98095 1184 aa22.7■■□□□ 1.22
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 CHD1O14646 1710 aa22.68■■□□□ 1.22
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.61■■□□□ 1.21
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 WDR97A6NE52 1622 aa22.61■■□□□ 1.21
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TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.61■■□□□ 1.21
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.61■■□□□ 1.21
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 GRIN2BQ13224 1484 aa22.56■■□□□ 1.2
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 ARHGEF11O15085 1522 aa22.56■■□□□ 1.2
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.53■■□□□ 1.2
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
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TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 SYNJ1O43426 1573 aa22.5■■□□□ 1.19
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 TOP2BQ02880 1626 aa22.49■■□□□ 1.19
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.49■■□□□ 1.19
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.47■■□□□ 1.19
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TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.39■■□□□ 1.17
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TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.24■■□□□ 1.15
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.23■■□□□ 1.15
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 CEP170Q5SW79 1584 aa22.2■■□□□ 1.14
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 NUP160Q12769 1436 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 KIF27Q86VH2 1401 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 SHROOM2Q13796 1616 aa22.04■■□□□ 1.12
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 IGF1RP08069 1367 aa22.02■■□□□ 1.12
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 CUL7Q14999 1698 aa21.98■■□□□ 1.11
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