RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539613.5

RHBDD1-215, Transcript of rhomboid domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene RHBDD1, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1-215ENST00000539613 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.45■■■■■ 5.99
RHBDD1-215ENST00000539613 ABCC9O60706 1549 aa47.6■■■■■ 5.21
RHBDD1-215ENST00000539613 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.34■■■■■ 5.17
RHBDD1-215ENST00000539613 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.18■■■■■ 4.82
RHBDD1-215ENST00000539613 NACADO15069 1562 aa44.73■■■■■ 4.75
RHBDD1-215ENST00000539613 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.72■■■■■ 4.75
RHBDD1-215ENST00000539613 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.45■■■■■ 4.71
RHBDD1-215ENST00000539613 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.27■■■■■ 4.68
RHBDD1-215ENST00000539613 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.18■■■■■ 4.66
RHBDD1-215ENST00000539613 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.91■■■■■ 4.62
RHBDD1-215ENST00000539613 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.81■■■■■ 4.6
RHBDD1-215ENST00000539613 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.44■■■■■ 4.54
RHBDD1-215ENST00000539613 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.27■■■■■ 4.52
RHBDD1-215ENST00000539613 SCRIBQ14160 1630 aa43.17■■■■■ 4.5
RHBDD1-215ENST00000539613 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.17■■■■■ 4.5
RHBDD1-215ENST00000539613 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43■■■■■ 4.47
RHBDD1-215ENST00000539613 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.87■■■■■ 4.45
RHBDD1-215ENST00000539613 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.81■■■■■ 4.44
RHBDD1-215ENST00000539613 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.3■■■■■ 4.2
RHBDD1-215ENST00000539613 NCAPD3P42695 1498 aa41.2■■■■■ 4.19
RHBDD1-215ENST00000539613 ERCC6Q03468 1493 aa41.17■■■■■ 4.18
RHBDD1-215ENST00000539613 CUX2O14529 1486 aa41.1■■■■■ 4.17
RHBDD1-215ENST00000539613 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.09■■■■■ 4.17
RHBDD1-215ENST00000539613 SMARCA4P51532 1647 aa41.08■■■■■ 4.17
RHBDD1-215ENST00000539613 SMARCA2P51531 1590 aa41.03■■■■■ 4.16
RHBDD1-215ENST00000539613 HMGXB3Q12766 1538 aa40.99■■■■■ 4.15
RHBDD1-215ENST00000539613 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.8■■■■■ 4.12
RHBDD1-215ENST00000539613 NESP48681 1621 aa40.78■■■■■ 4.12
RHBDD1-215ENST00000539613 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.77■■■■■ 4.12
RHBDD1-215ENST00000539613 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.59■■■■■ 4.09
RHBDD1-215ENST00000539613 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.49■■■■■ 4.07
RHBDD1-215ENST00000539613 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.46■■■■■ 4.07
RHBDD1-215ENST00000539613 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.44■■■■■ 4.06
RHBDD1-215ENST00000539613 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.37■■■■■ 4.05
RHBDD1-215ENST00000539613 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.17■■■■■ 4.02
RHBDD1-215ENST00000539613 WIZO95785 1651 aa40.02■■■■■ 4
RHBDD1-215ENST00000539613 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.96■■■■□ 3.99
RHBDD1-215ENST00000539613 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.9■■■■□ 3.98
RHBDD1-215ENST00000539613 WDR62O43379 1518 aa39.81■■■■□ 3.96
RHBDD1-215ENST00000539613 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.71■■■■□ 3.95
RHBDD1-215ENST00000539613 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.6■■■■□ 3.93
RHBDD1-215ENST00000539613 TRIM41Q8WV44 630 aa39.55■■■■□ 3.92
RHBDD1-215ENST00000539613 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.46■■■■□ 3.91
RHBDD1-215ENST00000539613 CFTRP13569 1480 aa39.45■■■■□ 3.91
RHBDD1-215ENST00000539613 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.42■■■■□ 3.9
RHBDD1-215ENST00000539613 PRDM2Q13029 1718 aa39.3■■■■□ 3.88
RHBDD1-215ENST00000539613 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.29■■■■□ 3.88
RHBDD1-215ENST00000539613 OSCARQ8IYS5 282 aa39.09■■■■□ 3.85
RHBDD1-215ENST00000539613 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.94■■■■□ 3.82
RHBDD1-215ENST00000539613 IFT140Q96RY7 1462 aa38.86■■■■□ 3.81
RHBDD1-215ENST00000539613 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.84■■■■□ 3.81
RHBDD1-215ENST00000539613 TOPBP1Q92547 1522 aa38.81■■■■□ 3.8
RHBDD1-215ENST00000539613 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.79■■■■□ 3.8
RHBDD1-215ENST00000539613 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.79■■■■□ 3.8
RHBDD1-215ENST00000539613 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.79■■■■□ 3.8
RHBDD1-215ENST00000539613 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.74■■■■□ 3.79
RHBDD1-215ENST00000539613 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.68■■■■□ 3.78
RHBDD1-215ENST00000539613 ABCC8Q09428 1581 aa38.66■■■■□ 3.78
RHBDD1-215ENST00000539613 ARHGEF11O15085 1522 aa38.59■■■■□ 3.77
RHBDD1-215ENST00000539613 CHD1O14646 1710 aa38.56■■■■□ 3.76
RHBDD1-215ENST00000539613 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.5■■■■□ 3.75
RHBDD1-215ENST00000539613 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.43■■■■□ 3.74
RHBDD1-215ENST00000539613 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.39■■■■□ 3.74
RHBDD1-215ENST00000539613 FBLN2P98095 1184 aa38.3■■■■□ 3.72
RHBDD1-215ENST00000539613 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.25■■■■□ 3.71
RHBDD1-215ENST00000539613 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.25■■■■□ 3.71
RHBDD1-215ENST00000539613 ARAP1Q96P48 1450 aa38.17■■■■□ 3.7
RHBDD1-215ENST00000539613 SOGA1O94964 1423 aa38.17■■■■□ 3.7
RHBDD1-215ENST00000539613 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.14■■■■□ 3.7
RHBDD1-215ENST00000539613 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.14■■■■□ 3.7
RHBDD1-215ENST00000539613 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.11■■■■□ 3.69
RHBDD1-215ENST00000539613 WDR97A6NE52 1622 aa38.1■■■■□ 3.69
RHBDD1-215ENST00000539613 CUX1P39880 1505 aa38.04■■■■□ 3.68
RHBDD1-215ENST00000539613 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.01■■■■□ 3.68
RHBDD1-215ENST00000539613 SYNJ1O43426 1573 aa37.97■■■■□ 3.67
RHBDD1-215ENST00000539613 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.97■■■■□ 3.67
RHBDD1-215ENST00000539613 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.96■■■■□ 3.67
RHBDD1-215ENST00000539613 PBRM1Q86U86 1689 aa37.92■■■■□ 3.66
RHBDD1-215ENST00000539613 GRIN2BQ13224 1484 aa37.9■■■■□ 3.66
RHBDD1-215ENST00000539613 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.9■■■■□ 3.66
RHBDD1-215ENST00000539613 SYNJ2O15056 1496 aa37.83■■■■□ 3.65
RHBDD1-215ENST00000539613 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.74■■■■□ 3.63
RHBDD1-215ENST00000539613 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.69■■■■□ 3.62
RHBDD1-215ENST00000539613 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.63■■■■□ 3.61
RHBDD1-215ENST00000539613 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.53■■■■□ 3.6
RHBDD1-215ENST00000539613 ADAMTS12P58397 1594 aa37.46■■■■□ 3.59
RHBDD1-215ENST00000539613 GRIN2AQ12879 1464 aa37.45■■■■□ 3.59
RHBDD1-215ENST00000539613 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.42■■■■□ 3.58
RHBDD1-215ENST00000539613 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.4■■■■□ 3.58
RHBDD1-215ENST00000539613 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.38■■■■□ 3.57
RHBDD1-215ENST00000539613 TOP2BQ02880 1626 aa37.36■■■■□ 3.57
RHBDD1-215ENST00000539613 CEP170Q5SW79 1584 aa37.36■■■■□ 3.57
RHBDD1-215ENST00000539613 NUP160Q12769 1436 aa37.27■■■■□ 3.56
RHBDD1-215ENST00000539613 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.22■■■■□ 3.55
RHBDD1-215ENST00000539613 SHROOM2Q13796 1616 aa37.21■■■■□ 3.55
RHBDD1-215ENST00000539613 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.18■■■■□ 3.54
RHBDD1-215ENST00000539613 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP37.14■■■■□ 3.54
RHBDD1-215ENST00000539613 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.97■■■■□ 3.51
RHBDD1-215ENST00000539613 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.97■■■■□ 3.51
RHBDD1-215ENST00000539613 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.95■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.7 ms