RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538611.1

CD6-209, Transcript of CD6 molecule, humanhuman

TSL 4

Gene CD6, Length 556 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD6-209ENST00000538611 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.52■■■■■ 7.12
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CD6-209ENST00000538611 ABCC9O60706 1549 aa52.32■■■■■ 5.97
CD6-209ENST00000538611 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.24■■■■■ 5.63
CD6-209ENST00000538611 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.17■■■■■ 5.62
CD6-209ENST00000538611 NACADO15069 1562 aa50.09■■■■■ 5.61
CD6-209ENST00000538611 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.65■■■■■ 5.54
CD6-209ENST00000538611 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.44■■■■■ 5.51
CD6-209ENST00000538611 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.27■■■■■ 5.48
CD6-209ENST00000538611 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.9■■■■■ 5.42
CD6-209ENST00000538611 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.79■■■■■ 5.4
CD6-209ENST00000538611 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.51■■■■■ 5.36
CD6-209ENST00000538611 SCRIBQ14160 1630 aa48.35■■■■■ 5.33
CD6-209ENST00000538611 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.3■■■■■ 5.32
CD6-209ENST00000538611 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.23■■■■■ 5.31
CD6-209ENST00000538611 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.37■■■■■ 5.17
CD6-209ENST00000538611 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.27■■■■■ 5.16
CD6-209ENST00000538611 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.12■■■■■ 5.13
CD6-209ENST00000538611 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.22■■■■■ 4.99
CD6-209ENST00000538611 SMARCA4P51532 1647 aa46.21■■■■■ 4.99
CD6-209ENST00000538611 NCAPD3P42695 1498 aa46.2■■■■■ 4.99
CD6-209ENST00000538611 SMARCA2P51531 1590 aa46.13■■■■■ 4.98
CD6-209ENST00000538611 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.12■■■■■ 4.97
CD6-209ENST00000538611 HMGXB3Q12766 1538 aa45.89■■■■■ 4.94
CD6-209ENST00000538611 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.8■■■■■ 4.92
CD6-209ENST00000538611 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.79■■■■■ 4.92
CD6-209ENST00000538611 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.78■■■■■ 4.92
CD6-209ENST00000538611 ERCC6Q03468 1493 aa45.29■■■■■ 4.84
CD6-209ENST00000538611 WIZO95785 1651 aa45.25■■■■■ 4.83
CD6-209ENST00000538611 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.2■■■■■ 4.83
CD6-209ENST00000538611 NESP48681 1621 aa45.08■■■■■ 4.81
CD6-209ENST00000538611 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.04■■■■■ 4.8
CD6-209ENST00000538611 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.9■■■■■ 4.78
CD6-209ENST00000538611 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.89■■■■■ 4.78
CD6-209ENST00000538611 CUX2O14529 1486 aa44.89■■■■■ 4.78
CD6-209ENST00000538611 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.84■■■■■ 4.77
CD6-209ENST00000538611 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.49■■■■■ 4.71
CD6-209ENST00000538611 CFTRP13569 1480 aa44.47■■■■■ 4.71
CD6-209ENST00000538611 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.43■■■■■ 4.7
CD6-209ENST00000538611 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.34■■■■■ 4.69
CD6-209ENST00000538611 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.34■■■■■ 4.69
CD6-209ENST00000538611 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.33■■■■■ 4.69
CD6-209ENST00000538611 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.33■■■■■ 4.69
CD6-209ENST00000538611 WDR62O43379 1518 aa44.11■■■■■ 4.65
CD6-209ENST00000538611 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.02■■■■■ 4.64
CD6-209ENST00000538611 PRDM2Q13029 1718 aa43.96■■■■■ 4.63
CD6-209ENST00000538611 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.95■■■■■ 4.63
CD6-209ENST00000538611 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.8■■■■■ 4.6
CD6-209ENST00000538611 ABCC8Q09428 1581 aa43.7■■■■■ 4.59
CD6-209ENST00000538611 TOPBP1Q92547 1522 aa43.53■■■■■ 4.56
CD6-209ENST00000538611 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.45■■■■■ 4.55
CD6-209ENST00000538611 IFT140Q96RY7 1462 aa43.45■■■■■ 4.55
CD6-209ENST00000538611 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.12■■■■■ 4.49
CD6-209ENST00000538611 OSCARQ8IYS5 282 aa43.12■■■■■ 4.49
CD6-209ENST00000538611 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.12■■■■■ 4.49
CD6-209ENST00000538611 SOGA1O94964 1423 aa43.06■■■■■ 4.48
CD6-209ENST00000538611 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43■■■■■ 4.47
CD6-209ENST00000538611 CUX1P39880 1505 aa42.98■■■■■ 4.47
CD6-209ENST00000538611 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.97■■■■■ 4.47
CD6-209ENST00000538611 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.94■■■■■ 4.46
CD6-209ENST00000538611 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.92■■■■■ 4.46
CD6-209ENST00000538611 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.92■■■■■ 4.46
CD6-209ENST00000538611 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.82■■■■■ 4.45
CD6-209ENST00000538611 WDR97A6NE52 1622 aa42.79■■■■■ 4.44
CD6-209ENST00000538611 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.71■■■■■ 4.43
CD6-209ENST00000538611 FBLN2P98095 1184 aa42.7■■■■■ 4.43
CD6-209ENST00000538611 GRIN2BQ13224 1484 aa42.59■■■■■ 4.41
CD6-209ENST00000538611 TOP2BQ02880 1626 aa42.57■■■■■ 4.41
CD6-209ENST00000538611 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.56■■■■■ 4.4
CD6-209ENST00000538611 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.54■■■■■ 4.4
CD6-209ENST00000538611 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.52■■■■■ 4.4
CD6-209ENST00000538611 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.51■■■■■ 4.4
CD6-209ENST00000538611 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.51■■■■■ 4.4
CD6-209ENST00000538611 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.49■■■■■ 4.39
CD6-209ENST00000538611 SYNJ1O43426 1573 aa42.45■■■■■ 4.39
CD6-209ENST00000538611 TRIM41Q8WV44 630 aa42.44■■■■■ 4.38
CD6-209ENST00000538611 CHD1O14646 1710 aa42.43■■■■■ 4.38
CD6-209ENST00000538611 SYNJ2O15056 1496 aa42.34■■■■■ 4.37
CD6-209ENST00000538611 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.31■■■■■ 4.36
CD6-209ENST00000538611 PBRM1Q86U86 1689 aa42.29■■■■■ 4.36
CD6-209ENST00000538611 ARHGEF11O15085 1522 aa42.18■■■■■ 4.34
CD6-209ENST00000538611 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.17■■■■■ 4.34
CD6-209ENST00000538611 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.17■■■■■ 4.34
CD6-209ENST00000538611 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.17■■■■■ 4.34
CD6-209ENST00000538611 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.08■■■■■ 4.33
CD6-209ENST00000538611 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.05■■■■■ 4.32
CD6-209ENST00000538611 CLASP1Q7Z460 1538 aa42■■■■■ 4.31
CD6-209ENST00000538611 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.99■■■■■ 4.31
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CD6-209ENST00000538611 ADAMTS12P58397 1594 aa41.96■■■■■ 4.31
CD6-209ENST00000538611 KIF27Q86VH2 1401 aa41.94■■■■■ 4.3
CD6-209ENST00000538611 NUP160Q12769 1436 aa41.78■■■■■ 4.28
CD6-209ENST00000538611 ARAP1Q96P48 1450 aa41.76■■■■■ 4.28
CD6-209ENST00000538611 IGF1RP08069 1367 aa41.73■■■■■ 4.27
CD6-209ENST00000538611 CEP170Q5SW79 1584 aa41.67■■■■■ 4.26
CD6-209ENST00000538611 CUL7Q14999 1698 aa41.6■■■■■ 4.25
CD6-209ENST00000538611 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.52■■■■■ 4.24
CD6-209ENST00000538611 JPH4Q96JJ6 628 aa41.52■■■■■ 4.24
CD6-209ENST00000538611 SHROOM2Q13796 1616 aa41.44■■■■■ 4.22
CD6-209ENST00000538611 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.4■■■■■ 4.22
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