RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538064.1

LRRK1-211, Transcript of leucine rich repeat kinase 1, humanhuman

TSL 5

Gene LRRK1, Length 493 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRK1-211ENST00000538064 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.18■■■■□ 3.54
LRRK1-211ENST00000538064 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.38■■■□□ 2.93
LRRK1-211ENST00000538064 ABCC9O60706 1549 aa32.89■■■□□ 2.86
LRRK1-211ENST00000538064 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.54■■■□□ 2.64
LRRK1-211ENST00000538064 NACADO15069 1562 aa31.4■■■□□ 2.62
LRRK1-211ENST00000538064 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.09■■■□□ 2.57
LRRK1-211ENST00000538064 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.01■■■□□ 2.55
LRRK1-211ENST00000538064 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.93■■■□□ 2.54
LRRK1-211ENST00000538064 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
LRRK1-211ENST00000538064 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.79■■■□□ 2.52
LRRK1-211ENST00000538064 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.61■■■□□ 2.49
LRRK1-211ENST00000538064 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.57■■■□□ 2.48
LRRK1-211ENST00000538064 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.48■■■□□ 2.47
LRRK1-211ENST00000538064 SCRIBQ14160 1630 aa30.33■■■□□ 2.45
LRRK1-211ENST00000538064 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.3■■■□□ 2.44
LRRK1-211ENST00000538064 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
LRRK1-211ENST00000538064 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.81■■■□□ 2.36
LRRK1-211ENST00000538064 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.62■■■□□ 2.33
LRRK1-211ENST00000538064 SMARCA4P51532 1647 aa29■■■□□ 2.23
LRRK1-211ENST00000538064 NCAPD3P42695 1498 aa28.91■■■□□ 2.22
LRRK1-211ENST00000538064 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
LRRK1-211ENST00000538064 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.87■■■□□ 2.21
LRRK1-211ENST00000538064 SMARCA2P51531 1590 aa28.87■■■□□ 2.21
LRRK1-211ENST00000538064 HMGXB3Q12766 1538 aa28.83■■■□□ 2.21
LRRK1-211ENST00000538064 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.73■■■□□ 2.19
LRRK1-211ENST00000538064 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.63■■■□□ 2.17
LRRK1-211ENST00000538064 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
LRRK1-211ENST00000538064 ERCC6Q03468 1493 aa28.4■■■□□ 2.14
LRRK1-211ENST00000538064 NESP48681 1621 aa28.35■■■□□ 2.13
LRRK1-211ENST00000538064 WIZO95785 1651 aa28.34■■■□□ 2.13
LRRK1-211ENST00000538064 CUX2O14529 1486 aa28.31■■■□□ 2.12
LRRK1-211ENST00000538064 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.29■■■□□ 2.12
LRRK1-211ENST00000538064 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
LRRK1-211ENST00000538064 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.12■■■□□ 2.09
LRRK1-211ENST00000538064 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
LRRK1-211ENST00000538064 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
LRRK1-211ENST00000538064 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.03■■■□□ 2.08
LRRK1-211ENST00000538064 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.01■■■□□ 2.07
LRRK1-211ENST00000538064 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.83■■■□□ 2.04
LRRK1-211ENST00000538064 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.81■■■□□ 2.04
LRRK1-211ENST00000538064 CFTRP13569 1480 aa27.81■■■□□ 2.04
LRRK1-211ENST00000538064 WDR62O43379 1518 aa27.79■■■□□ 2.04
LRRK1-211ENST00000538064 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.76■■■□□ 2.04
LRRK1-211ENST00000538064 PRDM2Q13029 1718 aa27.75■■■□□ 2.03
LRRK1-211ENST00000538064 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.74■■■□□ 2.03
LRRK1-211ENST00000538064 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.62■■■□□ 2.01
LRRK1-211ENST00000538064 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
LRRK1-211ENST00000538064 TOPBP1Q92547 1522 aa27.26■■□□□ 1.96
LRRK1-211ENST00000538064 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.24■■□□□ 1.95
LRRK1-211ENST00000538064 ABCC8Q09428 1581 aa27.23■■□□□ 1.95
LRRK1-211ENST00000538064 IFT140Q96RY7 1462 aa27.19■■□□□ 1.94
LRRK1-211ENST00000538064 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
LRRK1-211ENST00000538064 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
LRRK1-211ENST00000538064 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
LRRK1-211ENST00000538064 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
LRRK1-211ENST00000538064 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
LRRK1-211ENST00000538064 OSCARQ8IYS5 282 aa26.91■■□□□ 1.9
LRRK1-211ENST00000538064 CUX1P39880 1505 aa26.9■■□□□ 1.9
LRRK1-211ENST00000538064 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.87■■□□□ 1.89
LRRK1-211ENST00000538064 WDR97A6NE52 1622 aa26.87■■□□□ 1.89
LRRK1-211ENST00000538064 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.84■■□□□ 1.89
LRRK1-211ENST00000538064 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.83■■□□□ 1.89
LRRK1-211ENST00000538064 CHD1O14646 1710 aa26.82■■□□□ 1.88
LRRK1-211ENST00000538064 SOGA1O94964 1423 aa26.81■■□□□ 1.88
LRRK1-211ENST00000538064 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.69■■□□□ 1.86
LRRK1-211ENST00000538064 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.69■■□□□ 1.86
LRRK1-211ENST00000538064 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.69■■□□□ 1.86
LRRK1-211ENST00000538064 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
LRRK1-211ENST00000538064 TRIM41Q8WV44 630 aa26.67■■□□□ 1.86
LRRK1-211ENST00000538064 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.65■■□□□ 1.86
LRRK1-211ENST00000538064 PBRM1Q86U86 1689 aa26.65■■□□□ 1.86
LRRK1-211ENST00000538064 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.64■■□□□ 1.85
LRRK1-211ENST00000538064 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
LRRK1-211ENST00000538064 ARHGEF11O15085 1522 aa26.61■■□□□ 1.85
LRRK1-211ENST00000538064 GRIN2BQ13224 1484 aa26.61■■□□□ 1.85
LRRK1-211ENST00000538064 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.61■■□□□ 1.85
LRRK1-211ENST00000538064 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.6■■□□□ 1.85
LRRK1-211ENST00000538064 TOP2BQ02880 1626 aa26.6■■□□□ 1.85
LRRK1-211ENST00000538064 SYNJ1O43426 1573 aa26.56■■□□□ 1.84
LRRK1-211ENST00000538064 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.54■■□□□ 1.84
LRRK1-211ENST00000538064 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.84
LRRK1-211ENST00000538064 FBLN2P98095 1184 aa26.51■■□□□ 1.83
LRRK1-211ENST00000538064 SYNJ2O15056 1496 aa26.5■■□□□ 1.83
LRRK1-211ENST00000538064 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.49■■□□□ 1.83
LRRK1-211ENST00000538064 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
LRRK1-211ENST00000538064 ADAMTS12P58397 1594 aa26.37■■□□□ 1.81
LRRK1-211ENST00000538064 ARAP1Q96P48 1450 aa26.36■■□□□ 1.81
LRRK1-211ENST00000538064 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.29■■□□□ 1.8
LRRK1-211ENST00000538064 GRIN2AQ12879 1464 aa26.28■■□□□ 1.8
LRRK1-211ENST00000538064 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.23■■□□□ 1.79
LRRK1-211ENST00000538064 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.22■■□□□ 1.79
LRRK1-211ENST00000538064 CEP170Q5SW79 1584 aa26.2■■□□□ 1.79
LRRK1-211ENST00000538064 NUP160Q12769 1436 aa26.19■■□□□ 1.78
LRRK1-211ENST00000538064 SHROOM2Q13796 1616 aa26.11■■□□□ 1.77
LRRK1-211ENST00000538064 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.04■■□□□ 1.76
LRRK1-211ENST00000538064 CUL7Q14999 1698 aa26.03■■□□□ 1.76
LRRK1-211ENST00000538064 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.01■■□□□ 1.75
LRRK1-211ENST00000538064 KIF27Q86VH2 1401 aa26■■□□□ 1.75
LRRK1-211ENST00000538064 IGF1RP08069 1367 aa25.9■■□□□ 1.74
LRRK1-211ENST00000538064 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
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