RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537221.1

MSLNL-202, Transcript of mesothelin-like, humanhuman

TSL 5

Gene MSLNL, Length 820 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNL-202ENST00000537221 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.52■■■■■ 6.8
MSLNL-202ENST00000537221 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.46■■■■■ 5.83
MSLNL-202ENST00000537221 ABCC9O60706 1549 aa50.77■■■■■ 5.72
MSLNL-202ENST00000537221 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.67■■■■■ 5.38
MSLNL-202ENST00000537221 NACADO15069 1562 aa48.47■■■■■ 5.35
MSLNL-202ENST00000537221 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.14■■■■■ 5.3
MSLNL-202ENST00000537221 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.03■■■■■ 5.28
MSLNL-202ENST00000537221 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.84■■■■■ 5.25
MSLNL-202ENST00000537221 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.61■■■■■ 5.21
MSLNL-202ENST00000537221 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.53■■■■■ 5.2
MSLNL-202ENST00000537221 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.27■■■■■ 5.16
MSLNL-202ENST00000537221 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.18■■■■■ 5.14
MSLNL-202ENST00000537221 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.99■■■■■ 5.11
MSLNL-202ENST00000537221 SCRIBQ14160 1630 aa46.85■■■■■ 5.09
MSLNL-202ENST00000537221 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.74■■■■■ 5.07
MSLNL-202ENST00000537221 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.01■■■■■ 4.96
MSLNL-202ENST00000537221 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.93■■■■■ 4.94
MSLNL-202ENST00000537221 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.7■■■■■ 4.91
MSLNL-202ENST00000537221 SMARCA4P51532 1647 aa44.78■■■■■ 4.76
MSLNL-202ENST00000537221 NCAPD3P42695 1498 aa44.7■■■■■ 4.75
MSLNL-202ENST00000537221 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.65■■■■■ 4.74
MSLNL-202ENST00000537221 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.63■■■■■ 4.73
MSLNL-202ENST00000537221 SMARCA2P51531 1590 aa44.6■■■■■ 4.73
MSLNL-202ENST00000537221 HMGXB3Q12766 1538 aa44.5■■■■■ 4.71
MSLNL-202ENST00000537221 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.37■■■■■ 4.69
MSLNL-202ENST00000537221 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.3■■■■■ 4.68
MSLNL-202ENST00000537221 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.27■■■■■ 4.68
MSLNL-202ENST00000537221 ERCC6Q03468 1493 aa43.83■■■■■ 4.61
MSLNL-202ENST00000537221 WIZO95785 1651 aa43.8■■■■■ 4.6
MSLNL-202ENST00000537221 NESP48681 1621 aa43.77■■■■■ 4.6
MSLNL-202ENST00000537221 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.65■■■■■ 4.58
MSLNL-202ENST00000537221 CUX2O14529 1486 aa43.61■■■■■ 4.57
MSLNL-202ENST00000537221 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.58■■■■■ 4.57
MSLNL-202ENST00000537221 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.36■■■■■ 4.53
MSLNL-202ENST00000537221 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.35■■■■■ 4.53
MSLNL-202ENST00000537221 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.34■■■■■ 4.53
MSLNL-202ENST00000537221 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.3■■■■■ 4.52
MSLNL-202ENST00000537221 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.28■■■■■ 4.52
MSLNL-202ENST00000537221 CFTRP13569 1480 aa43■■■■■ 4.47
MSLNL-202ENST00000537221 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.94■■■■■ 4.47
MSLNL-202ENST00000537221 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.9■■■■■ 4.46
MSLNL-202ENST00000537221 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.87■■■■■ 4.45
MSLNL-202ENST00000537221 WDR62O43379 1518 aa42.84■■■■■ 4.45
MSLNL-202ENST00000537221 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.8■■■■■ 4.44
MSLNL-202ENST00000537221 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.78■■■■■ 4.44
MSLNL-202ENST00000537221 PRDM2Q13029 1718 aa42.69■■■■■ 4.42
MSLNL-202ENST00000537221 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.47■■■■■ 4.39
MSLNL-202ENST00000537221 TOPBP1Q92547 1522 aa42.13■■■■■ 4.33
MSLNL-202ENST00000537221 ABCC8Q09428 1581 aa42.11■■■■■ 4.33
MSLNL-202ENST00000537221 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.07■■■■■ 4.33
MSLNL-202ENST00000537221 IFT140Q96RY7 1462 aa42.02■■■■■ 4.32
MSLNL-202ENST00000537221 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.98■■■■■ 4.31
MSLNL-202ENST00000537221 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.84■■■■■ 4.29
MSLNL-202ENST00000537221 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.74■■■■■ 4.27
MSLNL-202ENST00000537221 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.73■■■■■ 4.27
MSLNL-202ENST00000537221 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.72■■■■■ 4.27
MSLNL-202ENST00000537221 CUX1P39880 1505 aa41.6■■■■■ 4.25
MSLNL-202ENST00000537221 OSCARQ8IYS5 282 aa41.59■■■■■ 4.25
MSLNL-202ENST00000537221 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.56■■■■■ 4.24
MSLNL-202ENST00000537221 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.52■■■■■ 4.24
MSLNL-202ENST00000537221 SOGA1O94964 1423 aa41.52■■■■■ 4.24
MSLNL-202ENST00000537221 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.51■■■■■ 4.24
MSLNL-202ENST00000537221 WDR97A6NE52 1622 aa41.44■■■■■ 4.22
MSLNL-202ENST00000537221 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
MSLNL-202ENST00000537221 CHD1O14646 1710 aa41.27■■■■■ 4.2
MSLNL-202ENST00000537221 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.17■■■■■ 4.18
MSLNL-202ENST00000537221 GRIN2BQ13224 1484 aa41.15■■■■■ 4.18
MSLNL-202ENST00000537221 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.15■■■■■ 4.18
MSLNL-202ENST00000537221 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.14■■■■■ 4.18
MSLNL-202ENST00000537221 TOP2BQ02880 1626 aa41.14■■■■■ 4.18
MSLNL-202ENST00000537221 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.13■■■■■ 4.17
MSLNL-202ENST00000537221 TRIM41Q8WV44 630 aa41.13■■■■■ 4.17
MSLNL-202ENST00000537221 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.12■■■■■ 4.17
MSLNL-202ENST00000537221 FBLN2P98095 1184 aa41.08■■■■■ 4.17
MSLNL-202ENST00000537221 SYNJ1O43426 1573 aa41.08■■■■■ 4.17
MSLNL-202ENST00000537221 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.07■■■■■ 4.17
MSLNL-202ENST00000537221 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.07■■■■■ 4.17
MSLNL-202ENST00000537221 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.07■■■■■ 4.17
MSLNL-202ENST00000537221 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.06■■■■■ 4.16
MSLNL-202ENST00000537221 PBRM1Q86U86 1689 aa41.06■■■■■ 4.16
MSLNL-202ENST00000537221 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.05■■■■■ 4.16
MSLNL-202ENST00000537221 ARHGEF11O15085 1522 aa41.01■■■■■ 4.16
MSLNL-202ENST00000537221 SYNJ2O15056 1496 aa40.96■■■■■ 4.15
MSLNL-202ENST00000537221 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.9■■■■■ 4.14
MSLNL-202ENST00000537221 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.83■■■■■ 4.13
MSLNL-202ENST00000537221 ADAMTS12P58397 1594 aa40.71■■■■■ 4.11
MSLNL-202ENST00000537221 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.66■■■■■ 4.1
MSLNL-202ENST00000537221 ARAP1Q96P48 1450 aa40.64■■■■■ 4.1
MSLNL-202ENST00000537221 GRIN2AQ12879 1464 aa40.62■■■■■ 4.09
MSLNL-202ENST00000537221 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.58■■■■■ 4.09
MSLNL-202ENST00000537221 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.55■■■■■ 4.08
MSLNL-202ENST00000537221 NUP160Q12769 1436 aa40.46■■■■■ 4.07
MSLNL-202ENST00000537221 CEP170Q5SW79 1584 aa40.44■■■■■ 4.06
MSLNL-202ENST00000537221 KIF27Q86VH2 1401 aa40.32■■■■■ 4.04
MSLNL-202ENST00000537221 SHROOM2Q13796 1616 aa40.25■■■■■ 4.03
MSLNL-202ENST00000537221 CUL7Q14999 1698 aa40.21■■■■■ 4.03
MSLNL-202ENST00000537221 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.17■■■■■ 4.02
MSLNL-202ENST00000537221 IGF1RP08069 1367 aa40.16■■■■■ 4.02
MSLNL-202ENST00000537221 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.13■■■■■ 4.01
MSLNL-202ENST00000537221 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.98■■■■□ 3.99
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