RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536905.5

VSIG10-203, Transcript of V-set and immunoglobulin domain containing 10, humanhuman

TSL 5

Gene VSIG10, Length 1,024 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10-203ENST00000536905 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.72■■■■■ 7.47
VSIG10-203ENST00000536905 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.03■■■■■ 6.4
VSIG10-203ENST00000536905 ABCC9O60706 1549 aa54.34■■■■■ 6.29
VSIG10-203ENST00000536905 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.03■■■■■ 5.92
VSIG10-203ENST00000536905 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.88■■■■■ 5.9
VSIG10-203ENST00000536905 NACADO15069 1562 aa51.85■■■■■ 5.89
VSIG10-203ENST00000536905 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.33■■■■■ 5.81
VSIG10-203ENST00000536905 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.27■■■■■ 5.8
VSIG10-203ENST00000536905 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.01■■■■■ 5.76
VSIG10-203ENST00000536905 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.97■■■■■ 5.75
VSIG10-203ENST00000536905 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.76■■■■■ 5.72
VSIG10-203ENST00000536905 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.51■■■■■ 5.68
VSIG10-203ENST00000536905 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.37■■■■■ 5.65
VSIG10-203ENST00000536905 SCRIBQ14160 1630 aa50.23■■■■■ 5.63
VSIG10-203ENST00000536905 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.77■■■■■ 5.56
VSIG10-203ENST00000536905 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.19■■■■■ 5.46
VSIG10-203ENST00000536905 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.14■■■■■ 5.46
VSIG10-203ENST00000536905 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.85■■■■■ 5.41
VSIG10-203ENST00000536905 SMARCA4P51532 1647 aa47.99■■■■■ 5.27
VSIG10-203ENST00000536905 NCAPD3P42695 1498 aa47.86■■■■■ 5.25
VSIG10-203ENST00000536905 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.84■■■■■ 5.25
VSIG10-203ENST00000536905 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.83■■■■■ 5.25
VSIG10-203ENST00000536905 SMARCA2P51531 1590 aa47.71■■■■■ 5.23
VSIG10-203ENST00000536905 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.58■■■■■ 5.21
VSIG10-203ENST00000536905 HMGXB3Q12766 1538 aa47.54■■■■■ 5.2
VSIG10-203ENST00000536905 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.49■■■■■ 5.19
VSIG10-203ENST00000536905 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.4■■■■■ 5.18
VSIG10-203ENST00000536905 WIZO95785 1651 aa47.1■■■■■ 5.13
VSIG10-203ENST00000536905 NESP48681 1621 aa46.92■■■■■ 5.1
VSIG10-203ENST00000536905 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.87■■■■■ 5.09
VSIG10-203ENST00000536905 ERCC6Q03468 1493 aa46.82■■■■■ 5.09
VSIG10-203ENST00000536905 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.66■■■■■ 5.06
VSIG10-203ENST00000536905 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.47■■■■■ 5.03
VSIG10-203ENST00000536905 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.46■■■■■ 5.03
VSIG10-203ENST00000536905 CUX2O14529 1486 aa46.45■■■■■ 5.03
VSIG10-203ENST00000536905 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.37■■■■■ 5.01
VSIG10-203ENST00000536905 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.36■■■■■ 5.01
VSIG10-203ENST00000536905 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.24■■■■■ 4.99
VSIG10-203ENST00000536905 CFTRP13569 1480 aa46.07■■■■■ 4.97
VSIG10-203ENST00000536905 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.99■■■■■ 4.95
VSIG10-203ENST00000536905 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.92■■■■■ 4.94
VSIG10-203ENST00000536905 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.9■■■■■ 4.94
VSIG10-203ENST00000536905 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.87■■■■■ 4.93
VSIG10-203ENST00000536905 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.8■■■■■ 4.92
VSIG10-203ENST00000536905 PRDM2Q13029 1718 aa45.77■■■■■ 4.92
VSIG10-203ENST00000536905 WDR62O43379 1518 aa45.77■■■■■ 4.92
VSIG10-203ENST00000536905 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.5■■■■■ 4.87
VSIG10-203ENST00000536905 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.44■■■■■ 4.86
VSIG10-203ENST00000536905 TOPBP1Q92547 1522 aa45.15■■■■■ 4.82
VSIG10-203ENST00000536905 ABCC8Q09428 1581 aa45.07■■■■■ 4.81
VSIG10-203ENST00000536905 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.03■■■■■ 4.8
VSIG10-203ENST00000536905 IFT140Q96RY7 1462 aa44.93■■■■■ 4.78
VSIG10-203ENST00000536905 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.83■■■■■ 4.77
VSIG10-203ENST00000536905 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.72■■■■■ 4.75
VSIG10-203ENST00000536905 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.71■■■■■ 4.75
VSIG10-203ENST00000536905 CUX1P39880 1505 aa44.65■■■■■ 4.74
VSIG10-203ENST00000536905 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.6■■■■■ 4.73
VSIG10-203ENST00000536905 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.59■■■■■ 4.73
VSIG10-203ENST00000536905 SOGA1O94964 1423 aa44.57■■■■■ 4.72
VSIG10-203ENST00000536905 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.56■■■■■ 4.72
VSIG10-203ENST00000536905 OSCARQ8IYS5 282 aa44.55■■■■■ 4.72
VSIG10-203ENST00000536905 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.54■■■■■ 4.72
VSIG10-203ENST00000536905 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.39■■■■■ 4.7
VSIG10-203ENST00000536905 WDR97A6NE52 1622 aa44.23■■■■■ 4.67
VSIG10-203ENST00000536905 CHD1O14646 1710 aa44.21■■■■■ 4.67
VSIG10-203ENST00000536905 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.17■■■■■ 4.66
VSIG10-203ENST00000536905 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.15■■■■■ 4.66
VSIG10-203ENST00000536905 TOP2BQ02880 1626 aa44.14■■■■■ 4.66
VSIG10-203ENST00000536905 SYNJ1O43426 1573 aa44.13■■■■■ 4.65
VSIG10-203ENST00000536905 FBLN2P98095 1184 aa44.12■■■■■ 4.65
VSIG10-203ENST00000536905 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.09■■■■■ 4.65
VSIG10-203ENST00000536905 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.06■■■■■ 4.64
VSIG10-203ENST00000536905 GRIN2BQ13224 1484 aa44.05■■■■■ 4.64
VSIG10-203ENST00000536905 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.02■■■■■ 4.64
VSIG10-203ENST00000536905 PBRM1Q86U86 1689 aa44■■■■■ 4.63
VSIG10-203ENST00000536905 TRIM41Q8WV44 630 aa43.99■■■■■ 4.63
VSIG10-203ENST00000536905 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.96■■■■■ 4.63
VSIG10-203ENST00000536905 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.95■■■■■ 4.63
VSIG10-203ENST00000536905 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.9■■■■■ 4.62
VSIG10-203ENST00000536905 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.88■■■■■ 4.61
VSIG10-203ENST00000536905 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.88■■■■■ 4.61
VSIG10-203ENST00000536905 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.88■■■■■ 4.61
VSIG10-203ENST00000536905 SYNJ2O15056 1496 aa43.81■■■■■ 4.6
VSIG10-203ENST00000536905 ARHGEF11O15085 1522 aa43.78■■■■■ 4.6
VSIG10-203ENST00000536905 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.63■■■■■ 4.57
VSIG10-203ENST00000536905 ADAMTS12P58397 1594 aa43.55■■■■■ 4.56
VSIG10-203ENST00000536905 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.54■■■■■ 4.56
VSIG10-203ENST00000536905 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.49■■■■■ 4.55
VSIG10-203ENST00000536905 GRIN2AQ12879 1464 aa43.49■■■■■ 4.55
VSIG10-203ENST00000536905 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.47■■■■■ 4.55
VSIG10-203ENST00000536905 ARAP1Q96P48 1450 aa43.4■■■■■ 4.54
VSIG10-203ENST00000536905 CEP170Q5SW79 1584 aa43.33■■■■■ 4.53
VSIG10-203ENST00000536905 NUP160Q12769 1436 aa43.3■■■■■ 4.52
VSIG10-203ENST00000536905 KIF27Q86VH2 1401 aa43.29■■■■■ 4.52
VSIG10-203ENST00000536905 IGF1RP08069 1367 aa43.22■■■■■ 4.51
VSIG10-203ENST00000536905 CUL7Q14999 1698 aa43.07■■■■■ 4.49
VSIG10-203ENST00000536905 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.07■■■■■ 4.48
VSIG10-203ENST00000536905 SHROOM2Q13796 1616 aa43.05■■■■■ 4.48
VSIG10-203ENST00000536905 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.94■■■■■ 4.46
VSIG10-203ENST00000536905 JPH4Q96JJ6 628 aa42.94■■■■■ 4.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.9 ms