RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536219.5

TMEM5-204, Transcript of UDP-D-xylose:ribitol-5-phosphate beta1,4-xylosyltransferase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM5, Length 864 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM5-204ENST00000536219 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.56■■■■■ 7.29
TMEM5-204ENST00000536219 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.21■■■■■ 6.27
TMEM5-204ENST00000536219 ABCC9O60706 1549 aa53.52■■■■■ 6.16
TMEM5-204ENST00000536219 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.29■■■■■ 5.8
TMEM5-204ENST00000536219 NACADO15069 1562 aa51.09■■■■■ 5.77
TMEM5-204ENST00000536219 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.67■■■■■ 5.7
TMEM5-204ENST00000536219 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.58■■■■■ 5.69
TMEM5-204ENST00000536219 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.34■■■■■ 5.65
TMEM5-204ENST00000536219 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.17■■■■■ 5.62
TMEM5-204ENST00000536219 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.11■■■■■ 5.61
TMEM5-204ENST00000536219 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.82■■■■■ 5.57
TMEM5-204ENST00000536219 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.79■■■■■ 5.56
TMEM5-204ENST00000536219 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.73■■■■■ 5.55
TMEM5-204ENST00000536219 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.31■■■■■ 5.48
TMEM5-204ENST00000536219 SCRIBQ14160 1630 aa49.27■■■■■ 5.48
TMEM5-204ENST00000536219 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.51■■■■■ 5.36
TMEM5-204ENST00000536219 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.44■■■■■ 5.35
TMEM5-204ENST00000536219 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.21■■■■■ 5.31
TMEM5-204ENST00000536219 NCAPD3P42695 1498 aa47.16■■■■■ 5.14
TMEM5-204ENST00000536219 SMARCA4P51532 1647 aa47.13■■■■■ 5.14
TMEM5-204ENST00000536219 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.04■■■■■ 5.12
TMEM5-204ENST00000536219 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.99■■■■■ 5.11
TMEM5-204ENST00000536219 SMARCA2P51531 1590 aa46.98■■■■■ 5.11
TMEM5-204ENST00000536219 HMGXB3Q12766 1538 aa46.89■■■■■ 5.1
TMEM5-204ENST00000536219 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.77■■■■■ 5.08
TMEM5-204ENST00000536219 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.63■■■■■ 5.06
TMEM5-204ENST00000536219 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.59■■■■■ 5.05
TMEM5-204ENST00000536219 ERCC6Q03468 1493 aa46.18■■■■■ 4.98
TMEM5-204ENST00000536219 NESP48681 1621 aa46.14■■■■■ 4.98
TMEM5-204ENST00000536219 WIZO95785 1651 aa46.07■■■■■ 4.97
TMEM5-204ENST00000536219 CUX2O14529 1486 aa46.06■■■■■ 4.96
TMEM5-204ENST00000536219 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.02■■■■■ 4.96
TMEM5-204ENST00000536219 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.86■■■■■ 4.93
TMEM5-204ENST00000536219 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.69■■■■■ 4.9
TMEM5-204ENST00000536219 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.68■■■■■ 4.9
TMEM5-204ENST00000536219 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.68■■■■■ 4.9
TMEM5-204ENST00000536219 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.6■■■■■ 4.89
TMEM5-204ENST00000536219 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.6■■■■■ 4.89
TMEM5-204ENST00000536219 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.36■■■■■ 4.85
TMEM5-204ENST00000536219 CFTRP13569 1480 aa45.32■■■■■ 4.85
TMEM5-204ENST00000536219 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.26■■■■■ 4.84
TMEM5-204ENST00000536219 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.17■■■■■ 4.82
TMEM5-204ENST00000536219 WDR62O43379 1518 aa45.17■■■■■ 4.82
TMEM5-204ENST00000536219 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.16■■■■■ 4.82
TMEM5-204ENST00000536219 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.01■■■■■ 4.8
TMEM5-204ENST00000536219 PRDM2Q13029 1718 aa44.94■■■■■ 4.78
TMEM5-204ENST00000536219 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.77■■■■■ 4.76
TMEM5-204ENST00000536219 TOPBP1Q92547 1522 aa44.38■■■■■ 4.69
TMEM5-204ENST00000536219 ABCC8Q09428 1581 aa44.36■■■■■ 4.69
TMEM5-204ENST00000536219 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.29■■■■■ 4.68
TMEM5-204ENST00000536219 IFT140Q96RY7 1462 aa44.27■■■■■ 4.68
TMEM5-204ENST00000536219 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.09■■■■■ 4.65
TMEM5-204ENST00000536219 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.99■■■■■ 4.63
TMEM5-204ENST00000536219 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.98■■■■■ 4.63
TMEM5-204ENST00000536219 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.96■■■■■ 4.63
TMEM5-204ENST00000536219 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.93■■■■■ 4.62
TMEM5-204ENST00000536219 OSCARQ8IYS5 282 aa43.9■■■■■ 4.62
TMEM5-204ENST00000536219 CUX1P39880 1505 aa43.79■■■■■ 4.6
TMEM5-204ENST00000536219 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.73■■■■■ 4.59
TMEM5-204ENST00000536219 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.72■■■■■ 4.59
TMEM5-204ENST00000536219 SOGA1O94964 1423 aa43.71■■■■■ 4.59
TMEM5-204ENST00000536219 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.7■■■■■ 4.59
TMEM5-204ENST00000536219 WDR97A6NE52 1622 aa43.66■■■■■ 4.58
TMEM5-204ENST00000536219 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.53■■■■■ 4.56
TMEM5-204ENST00000536219 CHD1O14646 1710 aa43.48■■■■■ 4.55
TMEM5-204ENST00000536219 TRIM41Q8WV44 630 aa43.41■■■■■ 4.54
TMEM5-204ENST00000536219 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.34■■■■■ 4.53
TMEM5-204ENST00000536219 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.34■■■■■ 4.53
TMEM5-204ENST00000536219 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.34■■■■■ 4.53
TMEM5-204ENST00000536219 GRIN2BQ13224 1484 aa43.33■■■■■ 4.53
TMEM5-204ENST00000536219 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.33■■■■■ 4.53
TMEM5-204ENST00000536219 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.32■■■■■ 4.53
TMEM5-204ENST00000536219 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.32■■■■■ 4.52
TMEM5-204ENST00000536219 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.28■■■■■ 4.52
TMEM5-204ENST00000536219 ARHGEF11O15085 1522 aa43.27■■■■■ 4.52
TMEM5-204ENST00000536219 TOP2BQ02880 1626 aa43.26■■■■■ 4.52
TMEM5-204ENST00000536219 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.23■■■■■ 4.51
TMEM5-204ENST00000536219 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.22■■■■■ 4.51
TMEM5-204ENST00000536219 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.22■■■■■ 4.51
TMEM5-204ENST00000536219 FBLN2P98095 1184 aa43.21■■■■■ 4.51
TMEM5-204ENST00000536219 PBRM1Q86U86 1689 aa43.2■■■■■ 4.51
TMEM5-204ENST00000536219 SYNJ1O43426 1573 aa43.18■■■■■ 4.5
TMEM5-204ENST00000536219 SYNJ2O15056 1496 aa43.14■■■■■ 4.5
TMEM5-204ENST00000536219 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.07■■■■■ 4.48
TMEM5-204ENST00000536219 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.06■■■■■ 4.48
TMEM5-204ENST00000536219 ARAP1Q96P48 1450 aa42.88■■■■■ 4.46
TMEM5-204ENST00000536219 ADAMTS12P58397 1594 aa42.85■■■■■ 4.45
TMEM5-204ENST00000536219 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.81■■■■■ 4.44
TMEM5-204ENST00000536219 GRIN2AQ12879 1464 aa42.78■■■■■ 4.44
TMEM5-204ENST00000536219 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.77■■■■■ 4.44
TMEM5-204ENST00000536219 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.72■■■■■ 4.43
TMEM5-204ENST00000536219 NUP160Q12769 1436 aa42.65■■■■■ 4.42
TMEM5-204ENST00000536219 CEP170Q5SW79 1584 aa42.6■■■■■ 4.41
TMEM5-204ENST00000536219 SHROOM2Q13796 1616 aa42.44■■■■■ 4.38
TMEM5-204ENST00000536219 KIF27Q86VH2 1401 aa42.37■■■■■ 4.37
TMEM5-204ENST00000536219 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.34■■■■■ 4.37
TMEM5-204ENST00000536219 IGF1RP08069 1367 aa42.29■■■■■ 4.36
TMEM5-204ENST00000536219 CUL7Q14999 1698 aa42.28■■■■■ 4.36
TMEM5-204ENST00000536219 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.25■■■■■ 4.35
TMEM5-204ENST00000536219 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.11■■■■■ 4.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms