RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535599.1

VWCE-204, Transcript of von Willebrand factor C and EGF domains, humanhuman

TSL 2

Gene VWCE, Length 883 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWCE-204ENST00000535599 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.41■■■■■ 4.7
VWCE-204ENST00000535599 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.73■■■■□ 3.95
VWCE-204ENST00000535599 ABCC9O60706 1549 aa39.65■■■■□ 3.94
VWCE-204ENST00000535599 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.77■■■■□ 3.64
VWCE-204ENST00000535599 NACADO15069 1562 aa37.57■■■■□ 3.6
VWCE-204ENST00000535599 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.39■■■■□ 3.58
VWCE-204ENST00000535599 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.14■■■■□ 3.54
VWCE-204ENST00000535599 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.13■■■■□ 3.53
VWCE-204ENST00000535599 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.96■■■■□ 3.51
VWCE-204ENST00000535599 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.85■■■■□ 3.49
VWCE-204ENST00000535599 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.85■■■■□ 3.49
VWCE-204ENST00000535599 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.71■■■■□ 3.47
VWCE-204ENST00000535599 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.7■■■■□ 3.47
VWCE-204ENST00000535599 SCRIBQ14160 1630 aa36.23■■■■□ 3.39
VWCE-204ENST00000535599 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.23■■■■□ 3.39
VWCE-204ENST00000535599 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.8■■■■□ 3.32
VWCE-204ENST00000535599 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.79■■■■□ 3.32
VWCE-204ENST00000535599 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.71■■■■□ 3.31
VWCE-204ENST00000535599 NCAPD3P42695 1498 aa34.72■■■■□ 3.15
VWCE-204ENST00000535599 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.63■■■■□ 3.13
VWCE-204ENST00000535599 SMARCA4P51532 1647 aa34.59■■■■□ 3.13
VWCE-204ENST00000535599 SMARCA2P51531 1590 aa34.5■■■■□ 3.11
VWCE-204ENST00000535599 HMGXB3Q12766 1538 aa34.45■■■■□ 3.1
VWCE-204ENST00000535599 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.1
VWCE-204ENST00000535599 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.28■■■■□ 3.08
VWCE-204ENST00000535599 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
VWCE-204ENST00000535599 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.23■■■■□ 3.07
VWCE-204ENST00000535599 ERCC6Q03468 1493 aa34.2■■■■□ 3.07
VWCE-204ENST00000535599 CUX2O14529 1486 aa34.13■■■■□ 3.05
VWCE-204ENST00000535599 NESP48681 1621 aa34.11■■■■□ 3.05
VWCE-204ENST00000535599 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.97■■■■□ 3.03
VWCE-204ENST00000535599 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.87■■■■□ 3.01
VWCE-204ENST00000535599 WIZO95785 1651 aa33.77■■■■□ 3
VWCE-204ENST00000535599 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.72■■■□□ 2.99
VWCE-204ENST00000535599 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.7■■■□□ 2.98
VWCE-204ENST00000535599 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.67■■■□□ 2.98
VWCE-204ENST00000535599 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.61■■■□□ 2.97
VWCE-204ENST00000535599 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.59■■■□□ 2.97
VWCE-204ENST00000535599 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.39■■■□□ 2.94
VWCE-204ENST00000535599 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.39■■■□□ 2.94
VWCE-204ENST00000535599 CFTRP13569 1480 aa33.31■■■□□ 2.92
VWCE-204ENST00000535599 WDR62O43379 1518 aa33.31■■■□□ 2.92
VWCE-204ENST00000535599 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.28■■■□□ 2.92
VWCE-204ENST00000535599 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.27■■■□□ 2.92
VWCE-204ENST00000535599 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.03■■■□□ 2.88
VWCE-204ENST00000535599 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33■■■□□ 2.87
VWCE-204ENST00000535599 PRDM2Q13029 1718 aa32.85■■■□□ 2.85
VWCE-204ENST00000535599 TOPBP1Q92547 1522 aa32.66■■■□□ 2.82
VWCE-204ENST00000535599 IFT140Q96RY7 1462 aa32.62■■■□□ 2.81
VWCE-204ENST00000535599 OSCARQ8IYS5 282 aa32.58■■■□□ 2.81
VWCE-204ENST00000535599 ABCC8Q09428 1581 aa32.58■■■□□ 2.81
VWCE-204ENST00000535599 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.57■■■□□ 2.8
VWCE-204ENST00000535599 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.53■■■□□ 2.8
VWCE-204ENST00000535599 TRIM41Q8WV44 630 aa32.5■■■□□ 2.79
VWCE-204ENST00000535599 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
VWCE-204ENST00000535599 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
VWCE-204ENST00000535599 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.34■■■□□ 2.77
VWCE-204ENST00000535599 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.29■■■□□ 2.765e-7■■■■■ 38.3
VWCE-204ENST00000535599 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.22■■■□□ 2.75
VWCE-204ENST00000535599 SOGA1O94964 1423 aa32.18■■■□□ 2.74
VWCE-204ENST00000535599 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
VWCE-204ENST00000535599 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.15■■■□□ 2.74
VWCE-204ENST00000535599 CUX1P39880 1505 aa32.15■■■□□ 2.74
VWCE-204ENST00000535599 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.12■■■□□ 2.73
VWCE-204ENST00000535599 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.12■■■□□ 2.73
VWCE-204ENST00000535599 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.12■■■□□ 2.73
VWCE-204ENST00000535599 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.11■■■□□ 2.73
VWCE-204ENST00000535599 ARHGEF11O15085 1522 aa32.06■■■□□ 2.72
VWCE-204ENST00000535599 CHD1O14646 1710 aa32.04■■■□□ 2.72
VWCE-204ENST00000535599 WDR97A6NE52 1622 aa32.01■■■□□ 2.72
VWCE-204ENST00000535599 FBLN2P98095 1184 aa32.01■■■□□ 2.71
VWCE-204ENST00000535599 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.96■■■□□ 2.71
VWCE-204ENST00000535599 GRIN2BQ13224 1484 aa31.89■■■□□ 2.7
VWCE-204ENST00000535599 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.88■■■□□ 2.69
VWCE-204ENST00000535599 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.82■■■□□ 2.68
VWCE-204ENST00000535599 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.81■■■□□ 2.68
VWCE-204ENST00000535599 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.8■■■□□ 2.68
VWCE-204ENST00000535599 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.79■■■□□ 2.68
VWCE-204ENST00000535599 ARAP1Q96P48 1450 aa31.78■■■□□ 2.68
VWCE-204ENST00000535599 SYNJ2O15056 1496 aa31.77■■■□□ 2.68
VWCE-204ENST00000535599 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.76■■■□□ 2.68
VWCE-204ENST00000535599 SYNJ1O43426 1573 aa31.72■■■□□ 2.67
VWCE-204ENST00000535599 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.71■■■□□ 2.67
VWCE-204ENST00000535599 PBRM1Q86U86 1689 aa31.7■■■□□ 2.66
VWCE-204ENST00000535599 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.69■■■□□ 2.66
VWCE-204ENST00000535599 TOP2BQ02880 1626 aa31.64■■■□□ 2.66
VWCE-204ENST00000535599 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.63■■■□□ 2.65
VWCE-204ENST00000535599 GRIN2AQ12879 1464 aa31.49■■■□□ 2.63
VWCE-204ENST00000535599 ADAMTS12P58397 1594 aa31.47■■■□□ 2.63
VWCE-204ENST00000535599 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.41■■■□□ 2.62
VWCE-204ENST00000535599 NUP160Q12769 1436 aa31.4■■■□□ 2.62
VWCE-204ENST00000535599 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.39■■■□□ 2.62
VWCE-204ENST00000535599 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.39■■■□□ 2.61
VWCE-204ENST00000535599 CEP170Q5SW79 1584 aa31.36■■■□□ 2.61
VWCE-204ENST00000535599 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.28■■■□□ 2.6
VWCE-204ENST00000535599 SHROOM2Q13796 1616 aa31.2■■■□□ 2.58
VWCE-204ENST00000535599 JPH4Q96JJ6 628 aa31.06■■■□□ 2.56
VWCE-204ENST00000535599 KIF27Q86VH2 1401 aa31.06■■■□□ 2.56
VWCE-204ENST00000535599 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
VWCE-204ENST00000535599 IGF1RP08069 1367 aa31.05■■■□□ 2.56
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