RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535423.5

TM7SF3-204, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 4

Gene TM7SF3, Length 537 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-204ENST00000535423 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.31■■■■■ 7.89
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TM7SF3-204ENST00000535423 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.4■■■■■ 6.3
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TM7SF3-204ENST00000535423 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.38■■■■■ 5.82
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TM7SF3-204ENST00000535423 SMARCA2P51531 1590 aa49.85■■■■■ 5.57
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TM7SF3-204ENST00000535423 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.55■■■■■ 5.52
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TM7SF3-204ENST00000535423 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.4■■■■■ 5.34
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TM7SF3-204ENST00000535423 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.93■■■■■ 5.26
TM7SF3-204ENST00000535423 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.91■■■■■ 5.26
TM7SF3-204ENST00000535423 PRDM2Q13029 1718 aa47.87■■■■■ 5.25
TM7SF3-204ENST00000535423 WDR62O43379 1518 aa47.86■■■■■ 5.25
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TM7SF3-204ENST00000535423 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.48■■■■■ 5.19
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TM7SF3-204ENST00000535423 ABCC8Q09428 1581 aa47.07■■■■■ 5.13
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TM7SF3-204ENST00000535423 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.34■■■■■ 4.85
TM7SF3-204ENST00000535423 CEP170Q5SW79 1584 aa45.23■■■■■ 4.83
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TM7SF3-204ENST00000535423 CUL7Q14999 1698 aa44.97■■■■■ 4.79
TM7SF3-204ENST00000535423 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.93■■■■■ 4.78
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TM7SF3-204ENST00000535423 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.69■■■■■ 4.75
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