RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534967.1

GOLGA3-204, Transcript of golgin A3, humanhuman

TSL 3

Gene GOLGA3, Length 484 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3-204ENST00000534967 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.73■■■■■ 8.27
GOLGA3-204ENST00000534967 ABCC9O60706 1549 aa60.5■■■■■ 7.28
GOLGA3-204ENST00000534967 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa60.02■■■■■ 7.2
GOLGA3-204ENST00000534967 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa57.35■■■■■ 6.77
GOLGA3-204ENST00000534967 DNAJC5BQ9UF47 199 aa57.12■■■■■ 6.73
GOLGA3-204ENST00000534967 NACADO15069 1562 aa56.84■■■■■ 6.69
GOLGA3-204ENST00000534967 DCAF8L2P0C7V8 631 aa56.57■■■■■ 6.65
GOLGA3-204ENST00000534967 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP56.29■■■■■ 6.6
GOLGA3-204ENST00000534967 UNC13AQ9UPW8 1703 aa56.06■■■■■ 6.56
GOLGA3-204ENST00000534967 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.9■■■■■ 6.54
GOLGA3-204ENST00000534967 BICRAQ9NZM4 1560 aa55.72■■■■■ 6.51
GOLGA3-204ENST00000534967 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.22■■■■■ 6.43
GOLGA3-204ENST00000534967 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.05■■■■■ 6.4
GOLGA3-204ENST00000534967 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.86■■■■■ 6.37
GOLGA3-204ENST00000534967 SCRIBQ14160 1630 aa54.73■■■■■ 6.35
GOLGA3-204ENST00000534967 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa54.59■■■■■ 6.33
GOLGA3-204ENST00000534967 CECR2Q9BXF3 1484 aa54.52■■■■■ 6.32
GOLGA3-204ENST00000534967 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP54.38■■■■■ 6.3
GOLGA3-204ENST00000534967 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa52.7■■■■■ 6.03
GOLGA3-204ENST00000534967 NCAPD3P42695 1498 aa52.5■■■■■ 5.99
GOLGA3-204ENST00000534967 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa52.31■■■■■ 5.96
GOLGA3-204ENST00000534967 CUX2O14529 1486 aa52.24■■■■■ 5.95
GOLGA3-204ENST00000534967 ERCC6Q03468 1493 aa52.24■■■■■ 5.95
GOLGA3-204ENST00000534967 SMARCA4P51532 1647 aa52.15■■■■■ 5.94
GOLGA3-204ENST00000534967 SMARCA2P51531 1590 aa52.11■■■■■ 5.93
GOLGA3-204ENST00000534967 HMGXB3Q12766 1538 aa52.06■■■■■ 5.92
GOLGA3-204ENST00000534967 NESP48681 1621 aa51.86■■■■■ 5.89
GOLGA3-204ENST00000534967 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.81■■■■■ 5.88
GOLGA3-204ENST00000534967 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.78■■■■■ 5.88
GOLGA3-204ENST00000534967 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.61■■■■■ 5.85
GOLGA3-204ENST00000534967 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.45■■■■■ 5.83
GOLGA3-204ENST00000534967 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP51.38■■■■■ 5.82
GOLGA3-204ENST00000534967 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa51.37■■■■■ 5.81
GOLGA3-204ENST00000534967 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa51.14■■■■■ 5.78
GOLGA3-204ENST00000534967 PDS5BQ9NTI5 1447 aa51.1■■■■■ 5.77
GOLGA3-204ENST00000534967 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.9■■■■■ 5.74
GOLGA3-204ENST00000534967 WIZO95785 1651 aa50.8■■■■■ 5.72
GOLGA3-204ENST00000534967 MRC2Q9UBG0 1479 aa50.7■■■■■ 5.71
GOLGA3-204ENST00000534967 WDR62O43379 1518 aa50.57■■■■■ 5.69
GOLGA3-204ENST00000534967 CEP164Q9UPV0 1460 aa50.41■■■■■ 5.66
GOLGA3-204ENST00000534967 FANCD2Q9BXW9 1451 aa50.33■■■■■ 5.65
GOLGA3-204ENST00000534967 TRIM41Q8WV44 630 aa50.28■■■■■ 5.64
GOLGA3-204ENST00000534967 CFTRP13569 1480 aa50.23■■■■■ 5.63
GOLGA3-204ENST00000534967 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.22■■■■■ 5.63
GOLGA3-204ENST00000534967 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP50.11■■■■■ 5.61
GOLGA3-204ENST00000534967 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.96■■■■■ 5.59
GOLGA3-204ENST00000534967 OSCARQ8IYS5 282 aa49.82■■■■■ 5.57
GOLGA3-204ENST00000534967 PRDM2Q13029 1718 aa49.65■■■■■ 5.54
GOLGA3-204ENST00000534967 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.57■■■■■ 5.53
GOLGA3-204ENST00000534967 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP49.42■■■■■ 5.5
GOLGA3-204ENST00000534967 IFT140Q96RY7 1462 aa49.42■■■■■ 5.5
GOLGA3-204ENST00000534967 TOPBP1Q92547 1522 aa49.34■■■■■ 5.49
GOLGA3-204ENST00000534967 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa49.23■■■■■ 5.47
GOLGA3-204ENST00000534967 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa49.23■■■■■ 5.47
GOLGA3-204ENST00000534967 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa49.23■■■■■ 5.47
GOLGA3-204ENST00000534967 ABCC8Q09428 1581 aa49.15■■■■■ 5.46
GOLGA3-204ENST00000534967 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP49.11■■■■■ 5.45
GOLGA3-204ENST00000534967 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.11■■■■■ 5.45
GOLGA3-204ENST00000534967 ARHGEF11O15085 1522 aa49.03■■■■■ 5.44
GOLGA3-204ENST00000534967 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.93■■■■■ 5.42
GOLGA3-204ENST00000534967 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.92■■■■■ 5.42
GOLGA3-204ENST00000534967 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.81■■■■■ 5.4
GOLGA3-204ENST00000534967 CHD1O14646 1710 aa48.81■■■■■ 5.4
GOLGA3-204ENST00000534967 CYB5RLQ6IPT4 315 aa48.71■■■■■ 5.39
GOLGA3-204ENST00000534967 FBLN2P98095 1184 aa48.7■■■■■ 5.39
GOLGA3-204ENST00000534967 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.67■■■■■ 5.38
GOLGA3-204ENST00000534967 SOGA1O94964 1423 aa48.58■■■■■ 5.37
GOLGA3-204ENST00000534967 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP48.56■■■■■ 5.36
GOLGA3-204ENST00000534967 ARAP1Q96P48 1450 aa48.54■■■■■ 5.36
GOLGA3-204ENST00000534967 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.46■■■■■ 5.35
GOLGA3-204ENST00000534967 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa48.41■■■■■ 5.34
GOLGA3-204ENST00000534967 CUX1P39880 1505 aa48.35■■■■■ 5.33
GOLGA3-204ENST00000534967 WDR97A6NE52 1622 aa48.34■■■■■ 5.33
GOLGA3-204ENST00000534967 TRHP20396 242 aaPredicted RBP48.32■■■■■ 5.33
GOLGA3-204ENST00000534967 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP48.25■■■■■ 5.31
GOLGA3-204ENST00000534967 CLASP1Q7Z460 1538 aa48.24■■■■■ 5.31
GOLGA3-204ENST00000534967 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP48.23■■■■■ 5.31
GOLGA3-204ENST00000534967 GRIN2BQ13224 1484 aa48.19■■■■■ 5.31
GOLGA3-204ENST00000534967 SYNJ1O43426 1573 aa48.17■■■■■ 5.3
GOLGA3-204ENST00000534967 SYNJ2O15056 1496 aa48.08■■■■■ 5.29
GOLGA3-204ENST00000534967 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.98■■■■■ 5.27
GOLGA3-204ENST00000534967 PBRM1Q86U86 1689 aa47.97■■■■■ 5.27
GOLGA3-204ENST00000534967 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.86■■■■■ 5.25
GOLGA3-204ENST00000534967 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.82■■■■■ 5.25
GOLGA3-204ENST00000534967 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.75■■■■■ 5.23
GOLGA3-204ENST00000534967 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.59■■■■■ 5.214e-7■■■□□ 16.7
GOLGA3-204ENST00000534967 GRIN2AQ12879 1464 aa47.58■■■■■ 5.21
GOLGA3-204ENST00000534967 ADAMTS12P58397 1594 aa47.51■■■■■ 5.2
GOLGA3-204ENST00000534967 ERCC6L2Q5T890 1561 aa47.5■■■■■ 5.19
GOLGA3-204ENST00000534967 CEP170Q5SW79 1584 aa47.45■■■■■ 5.19
GOLGA3-204ENST00000534967 TOP2BQ02880 1626 aa47.45■■■■■ 5.19
GOLGA3-204ENST00000534967 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.44■■■■■ 5.18
GOLGA3-204ENST00000534967 NUP160Q12769 1436 aa47.43■■■■■ 5.18
GOLGA3-204ENST00000534967 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.35■■■■■ 5.17
GOLGA3-204ENST00000534967 SHROOM2Q13796 1616 aa47.25■■■■■ 5.15
GOLGA3-204ENST00000534967 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.24■■■■■ 5.15
GOLGA3-204ENST00000534967 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP47.18■■■■■ 5.14
GOLGA3-204ENST00000534967 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP47.03■■■■■ 5.12
GOLGA3-204ENST00000534967 JPH4Q96JJ6 628 aa46.96■■■■■ 5.11
GOLGA3-204ENST00000534967 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.84■■■■■ 5.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms