RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534826.5

CNIH2-206, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene CNIH2, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH2-206ENST00000534826 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.54■■■■■ 7.92
CNIH2-206ENST00000534826 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.8■■■■■ 6.84
CNIH2-206ENST00000534826 ABCC9O60706 1549 aa57.32■■■■■ 6.77
CNIH2-206ENST00000534826 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.81■■■■■ 6.37
CNIH2-206ENST00000534826 NACADO15069 1562 aa54.51■■■■■ 6.32
CNIH2-206ENST00000534826 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.32■■■■■ 6.29
CNIH2-206ENST00000534826 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.88■■■■■ 6.22
CNIH2-206ENST00000534826 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.6■■■■■ 6.17
CNIH2-206ENST00000534826 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.54■■■■■ 6.16
CNIH2-206ENST00000534826 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.39■■■■■ 6.14
CNIH2-206ENST00000534826 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.36■■■■■ 6.13
CNIH2-206ENST00000534826 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.24■■■■■ 6.11
CNIH2-206ENST00000534826 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.1■■■■■ 6.09
CNIH2-206ENST00000534826 SCRIBQ14160 1630 aa52.69■■■■■ 6.02
CNIH2-206ENST00000534826 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.53■■■■■ 6
CNIH2-206ENST00000534826 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.82■■■■■ 5.89
CNIH2-206ENST00000534826 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.81■■■■■ 5.88
CNIH2-206ENST00000534826 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.6■■■■■ 5.85
CNIH2-206ENST00000534826 SMARCA4P51532 1647 aa50.29■■■■■ 5.64
CNIH2-206ENST00000534826 NCAPD3P42695 1498 aa50.27■■■■■ 5.64
CNIH2-206ENST00000534826 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.19■■■■■ 5.62
CNIH2-206ENST00000534826 SMARCA2P51531 1590 aa50.14■■■■■ 5.62
CNIH2-206ENST00000534826 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.13■■■■■ 5.61
CNIH2-206ENST00000534826 HMGXB3Q12766 1538 aa50■■■■■ 5.59
CNIH2-206ENST00000534826 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.78■■■■■ 5.56
CNIH2-206ENST00000534826 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.77■■■■■ 5.56
CNIH2-206ENST00000534826 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.72■■■■■ 5.55
CNIH2-206ENST00000534826 ERCC6Q03468 1493 aa49.53■■■■■ 5.52
CNIH2-206ENST00000534826 NESP48681 1621 aa49.34■■■■■ 5.49
CNIH2-206ENST00000534826 CUX2O14529 1486 aa49.25■■■■■ 5.48
CNIH2-206ENST00000534826 WIZO95785 1651 aa49.18■■■■■ 5.46
CNIH2-206ENST00000534826 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.13■■■■■ 5.46
CNIH2-206ENST00000534826 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.84■■■■■ 5.41
CNIH2-206ENST00000534826 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.83■■■■■ 5.41
CNIH2-206ENST00000534826 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.8■■■■■ 5.4
CNIH2-206ENST00000534826 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.78■■■■■ 5.4
CNIH2-206ENST00000534826 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.77■■■■■ 5.4
CNIH2-206ENST00000534826 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.63■■■■■ 5.38
CNIH2-206ENST00000534826 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.62■■■■■ 5.37
CNIH2-206ENST00000534826 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.38■■■■■ 5.34
CNIH2-206ENST00000534826 CFTRP13569 1480 aa48.31■■■■■ 5.32
CNIH2-206ENST00000534826 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.29■■■■■ 5.32
CNIH2-206ENST00000534826 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.25■■■■■ 5.31
CNIH2-206ENST00000534826 WDR62O43379 1518 aa48.23■■■■■ 5.31
CNIH2-206ENST00000534826 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.02■■■■■ 5.28
CNIH2-206ENST00000534826 PRDM2Q13029 1718 aa47.97■■■■■ 5.27
CNIH2-206ENST00000534826 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.8■■■■■ 5.24
CNIH2-206ENST00000534826 TOPBP1Q92547 1522 aa47.38■■■■■ 5.18
CNIH2-206ENST00000534826 ABCC8Q09428 1581 aa47.35■■■■■ 5.17
CNIH2-206ENST00000534826 IFT140Q96RY7 1462 aa47.3■■■■■ 5.16
CNIH2-206ENST00000534826 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.28■■■■■ 5.16
CNIH2-206ENST00000534826 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.12■■■■■ 5.13
CNIH2-206ENST00000534826 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.06■■■■■ 5.12
CNIH2-206ENST00000534826 OSCARQ8IYS5 282 aa47.04■■■■■ 5.12
CNIH2-206ENST00000534826 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.95■■■■■ 5.11
CNIH2-206ENST00000534826 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.92■■■■■ 5.1
CNIH2-206ENST00000534826 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.91■■■■■ 5.1
CNIH2-206ENST00000534826 TRIM41Q8WV44 630 aa46.76■■■■■ 5.08
CNIH2-206ENST00000534826 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.76■■■■■ 5.08
CNIH2-206ENST00000534826 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.72■■■■■ 5.07
CNIH2-206ENST00000534826 SOGA1O94964 1423 aa46.71■■■■■ 5.07
CNIH2-206ENST00000534826 CUX1P39880 1505 aa46.71■■■■■ 5.07
CNIH2-206ENST00000534826 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.7■■■■■ 5.07
CNIH2-206ENST00000534826 WDR97A6NE52 1622 aa46.54■■■■■ 5.04
CNIH2-206ENST00000534826 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.54■■■■■ 5.04
CNIH2-206ENST00000534826 CHD1O14646 1710 aa46.53■■■■■ 5.04
CNIH2-206ENST00000534826 FBLN2P98095 1184 aa46.42■■■■■ 5.02
CNIH2-206ENST00000534826 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.42■■■■■ 5.02
CNIH2-206ENST00000534826 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.42■■■■■ 5.02
CNIH2-206ENST00000534826 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.42■■■■■ 5.02
CNIH2-206ENST00000534826 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.34■■■■■ 5.01
CNIH2-206ENST00000534826 ARHGEF11O15085 1522 aa46.3■■■■■ 5
CNIH2-206ENST00000534826 GRIN2BQ13224 1484 aa46.29■■■■■ 5
CNIH2-206ENST00000534826 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.25■■■■■ 4.99
CNIH2-206ENST00000534826 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.19■■■■■ 4.99
CNIH2-206ENST00000534826 PBRM1Q86U86 1689 aa46.18■■■■■ 4.98
CNIH2-206ENST00000534826 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.18■■■■■ 4.98
CNIH2-206ENST00000534826 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.14■■■■■ 4.98
CNIH2-206ENST00000534826 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.13■■■■■ 4.97
CNIH2-206ENST00000534826 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.12■■■■■ 4.97
CNIH2-206ENST00000534826 TOP2BQ02880 1626 aa46.11■■■■■ 4.97
CNIH2-206ENST00000534826 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.1■■■■■ 4.97
CNIH2-206ENST00000534826 SYNJ2O15056 1496 aa46.08■■■■■ 4.97
CNIH2-206ENST00000534826 SYNJ1O43426 1573 aa46.05■■■■■ 4.96
CNIH2-206ENST00000534826 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.97■■■■■ 4.95
CNIH2-206ENST00000534826 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.91■■■■■ 4.94
CNIH2-206ENST00000534826 ARAP1Q96P48 1450 aa45.86■■■■■ 4.93
CNIH2-206ENST00000534826 ADAMTS12P58397 1594 aa45.74■■■■■ 4.91
CNIH2-206ENST00000534826 GRIN2AQ12879 1464 aa45.68■■■■■ 4.9
CNIH2-206ENST00000534826 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.65■■■■■ 4.9
CNIH2-206ENST00000534826 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.6■■■■■ 4.89
CNIH2-206ENST00000534826 CEP170Q5SW79 1584 aa45.49■■■■■ 4.87
CNIH2-206ENST00000534826 NUP160Q12769 1436 aa45.48■■■■■ 4.87
CNIH2-206ENST00000534826 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.31■■■■■ 4.84
CNIH2-206ENST00000534826 SHROOM2Q13796 1616 aa45.26■■■■■ 4.84
CNIH2-206ENST00000534826 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.24■■■■■ 4.83
CNIH2-206ENST00000534826 KIF27Q86VH2 1401 aa45.24■■■■■ 4.83
CNIH2-206ENST00000534826 CUL7Q14999 1698 aa45.11■■■■■ 4.81
CNIH2-206ENST00000534826 IGF1RP08069 1367 aa45.08■■■■■ 4.81
CNIH2-206ENST00000534826 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.08■■■■■ 4.81
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