RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534606.1

CRACR2B-214, Transcript of calcium release activated channel regulator 2B, humanhuman

TSL 3

Gene CRACR2B, Length 627 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2B-214ENST00000534606 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.9■■■■■ 6.7
CRACR2B-214ENST00000534606 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.87■■■■■ 5.73
CRACR2B-214ENST00000534606 ABCC9O60706 1549 aa50.35■■■■■ 5.65
CRACR2B-214ENST00000534606 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.17■■■■■ 5.3
CRACR2B-214ENST00000534606 NACADO15069 1562 aa47.95■■■■■ 5.27
CRACR2B-214ENST00000534606 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.77■■■■■ 5.24
CRACR2B-214ENST00000534606 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.47■■■■■ 5.19
CRACR2B-214ENST00000534606 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.27■■■■■ 5.16
CRACR2B-214ENST00000534606 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.08■■■■■ 5.13
CRACR2B-214ENST00000534606 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.05■■■■■ 5.12
CRACR2B-214ENST00000534606 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.94■■■■■ 5.1
CRACR2B-214ENST00000534606 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.78■■■■■ 5.08
CRACR2B-214ENST00000534606 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.75■■■■■ 5.07
CRACR2B-214ENST00000534606 SCRIBQ14160 1630 aa46.36■■■■■ 5.01
CRACR2B-214ENST00000534606 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.18■■■■■ 4.98
CRACR2B-214ENST00000534606 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.56■■■■■ 4.88
CRACR2B-214ENST00000534606 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.52■■■■■ 4.88
CRACR2B-214ENST00000534606 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.3■■■■■ 4.84
CRACR2B-214ENST00000534606 SMARCA4P51532 1647 aa44.29■■■■■ 4.68
CRACR2B-214ENST00000534606 NCAPD3P42695 1498 aa44.26■■■■■ 4.68
CRACR2B-214ENST00000534606 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.19■■■■■ 4.66
CRACR2B-214ENST00000534606 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.14■■■■■ 4.66
CRACR2B-214ENST00000534606 SMARCA2P51531 1590 aa44.1■■■■■ 4.65
CRACR2B-214ENST00000534606 HMGXB3Q12766 1538 aa43.99■■■■■ 4.63
CRACR2B-214ENST00000534606 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.87■■■■■ 4.61
CRACR2B-214ENST00000534606 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.85■■■■■ 4.61
CRACR2B-214ENST00000534606 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.79■■■■■ 4.6
CRACR2B-214ENST00000534606 ERCC6Q03468 1493 aa43.43■■■■■ 4.54
CRACR2B-214ENST00000534606 NESP48681 1621 aa43.4■■■■■ 4.54
CRACR2B-214ENST00000534606 WIZO95785 1651 aa43.36■■■■■ 4.53
CRACR2B-214ENST00000534606 CUX2O14529 1486 aa43.2■■■■■ 4.51
CRACR2B-214ENST00000534606 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.2■■■■■ 4.51
CRACR2B-214ENST00000534606 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.12■■■■■ 4.49
CRACR2B-214ENST00000534606 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.93■■■■■ 4.46
CRACR2B-214ENST00000534606 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.91■■■■■ 4.46
CRACR2B-214ENST00000534606 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.88■■■■■ 4.45
CRACR2B-214ENST00000534606 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.88■■■■■ 4.45
CRACR2B-214ENST00000534606 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.84■■■■■ 4.45
CRACR2B-214ENST00000534606 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.59■■■■■ 4.41
CRACR2B-214ENST00000534606 CFTRP13569 1480 aa42.56■■■■■ 4.4
CRACR2B-214ENST00000534606 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.52■■■■■ 4.4
CRACR2B-214ENST00000534606 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.45■■■■■ 4.39
CRACR2B-214ENST00000534606 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.44■■■■■ 4.38
CRACR2B-214ENST00000534606 WDR62O43379 1518 aa42.41■■■■■ 4.38
CRACR2B-214ENST00000534606 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.35■■■■■ 4.37
CRACR2B-214ENST00000534606 PRDM2Q13029 1718 aa42.19■■■■■ 4.34
CRACR2B-214ENST00000534606 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.07■■■■■ 4.33
CRACR2B-214ENST00000534606 TOPBP1Q92547 1522 aa41.7■■■■■ 4.27
CRACR2B-214ENST00000534606 ABCC8Q09428 1581 aa41.65■■■■■ 4.26
CRACR2B-214ENST00000534606 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.6■■■■■ 4.25
CRACR2B-214ENST00000534606 IFT140Q96RY7 1462 aa41.58■■■■■ 4.25
CRACR2B-214ENST00000534606 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
CRACR2B-214ENST00000534606 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.47■■■■■ 4.23
CRACR2B-214ENST00000534606 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.32■■■■■ 4.2
CRACR2B-214ENST00000534606 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.31■■■■■ 4.2
CRACR2B-214ENST00000534606 OSCARQ8IYS5 282 aa41.29■■■■■ 4.2
CRACR2B-214ENST00000534606 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.29■■■■■ 4.2
CRACR2B-214ENST00000534606 CUX1P39880 1505 aa41.17■■■■■ 4.18
CRACR2B-214ENST00000534606 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.15■■■■■ 4.18
CRACR2B-214ENST00000534606 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.14■■■■■ 4.18
CRACR2B-214ENST00000534606 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.13■■■■■ 4.17
CRACR2B-214ENST00000534606 SOGA1O94964 1423 aa41.12■■■■■ 4.17
CRACR2B-214ENST00000534606 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
CRACR2B-214ENST00000534606 WDR97A6NE52 1622 aa40.93■■■■■ 4.14
CRACR2B-214ENST00000534606 TRIM41Q8WV44 630 aa40.92■■■■■ 4.14
CRACR2B-214ENST00000534606 CHD1O14646 1710 aa40.87■■■■■ 4.13
CRACR2B-214ENST00000534606 FBLN2P98095 1184 aa40.76■■■■■ 4.12
CRACR2B-214ENST00000534606 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.75■■■■■ 4.11
CRACR2B-214ENST00000534606 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.73■■■■■ 4.11
CRACR2B-214ENST00000534606 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.73■■■■■ 4.11
CRACR2B-214ENST00000534606 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.73■■■■■ 4.11
CRACR2B-214ENST00000534606 GRIN2BQ13224 1484 aa40.71■■■■■ 4.11
CRACR2B-214ENST00000534606 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.68■■■■■ 4.1
CRACR2B-214ENST00000534606 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
CRACR2B-214ENST00000534606 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.67■■■■■ 4.1
CRACR2B-214ENST00000534606 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.67■■■■■ 4.1
CRACR2B-214ENST00000534606 TOP2BQ02880 1626 aa40.66■■■■■ 4.1
CRACR2B-214ENST00000534606 ARHGEF11O15085 1522 aa40.65■■■■■ 4.1
CRACR2B-214ENST00000534606 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.64■■■■■ 4.1
CRACR2B-214ENST00000534606 SYNJ1O43426 1573 aa40.62■■■■■ 4.09
CRACR2B-214ENST00000534606 PBRM1Q86U86 1689 aa40.61■■■■■ 4.09
CRACR2B-214ENST00000534606 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.6■■■■■ 4.09
CRACR2B-214ENST00000534606 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.55■■■■■ 4.08
CRACR2B-214ENST00000534606 SYNJ2O15056 1496 aa40.53■■■■■ 4.08
CRACR2B-214ENST00000534606 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.42■■■■■ 4.06
CRACR2B-214ENST00000534606 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.29■■■■■ 4.04
CRACR2B-214ENST00000534606 ARAP1Q96P48 1450 aa40.27■■■■■ 4.04
CRACR2B-214ENST00000534606 ADAMTS12P58397 1594 aa40.25■■■■■ 4.03
CRACR2B-214ENST00000534606 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.2■■■■■ 4.03
CRACR2B-214ENST00000534606 GRIN2AQ12879 1464 aa40.19■■■■■ 4.03
CRACR2B-214ENST00000534606 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.14■■■■■ 4.02
CRACR2B-214ENST00000534606 NUP160Q12769 1436 aa40.04■■■■■ 4
CRACR2B-214ENST00000534606 CEP170Q5SW79 1584 aa40.04■■■■■ 4
CRACR2B-214ENST00000534606 KIF27Q86VH2 1401 aa39.85■■■■□ 3.97
CRACR2B-214ENST00000534606 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.83■■■■□ 3.97
CRACR2B-214ENST00000534606 SHROOM2Q13796 1616 aa39.83■■■■□ 3.97
CRACR2B-214ENST00000534606 IGF1RP08069 1367 aa39.78■■■■□ 3.96
CRACR2B-214ENST00000534606 CUL7Q14999 1698 aa39.72■■■■□ 3.95
CRACR2B-214ENST00000534606 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.68■■■■□ 3.94
CRACR2B-214ENST00000534606 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.67■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms