RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534155.1

NSD3-211, Transcript of nuclear receptor binding SET domain protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene NSD3, Length 577 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3-211ENST00000534155 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.34■■■■■ 4.69
NSD3-211ENST00000534155 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.73■■■■□ 3.95
NSD3-211ENST00000534155 ABCC9O60706 1549 aa39.3■■■■□ 3.88
NSD3-211ENST00000534155 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.66■■■■□ 3.62
NSD3-211ENST00000534155 NACADO15069 1562 aa37.49■■■■□ 3.59
NSD3-211ENST00000534155 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.21■■■■□ 3.55
NSD3-211ENST00000534155 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.14■■■■□ 3.54
NSD3-211ENST00000534155 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.49
NSD3-211ENST00000534155 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.74■■■■□ 3.47
NSD3-211ENST00000534155 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.71■■■■□ 3.47
NSD3-211ENST00000534155 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.6■■■■□ 3.45
NSD3-211ENST00000534155 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.55■■■■□ 3.44
NSD3-211ENST00000534155 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.47■■■■□ 3.43
NSD3-211ENST00000534155 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.19■■■■□ 3.38
NSD3-211ENST00000534155 SCRIBQ14160 1630 aa36.1■■■■□ 3.37
NSD3-211ENST00000534155 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
NSD3-211ENST00000534155 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.57■■■■□ 3.28
NSD3-211ENST00000534155 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.42■■■■□ 3.26
NSD3-211ENST00000534155 NCAPD3P42695 1498 aa34.59■■■■□ 3.13
NSD3-211ENST00000534155 SMARCA4P51532 1647 aa34.52■■■■□ 3.12
NSD3-211ENST00000534155 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.48■■■■□ 3.11
NSD3-211ENST00000534155 SMARCA2P51531 1590 aa34.46■■■■□ 3.11
NSD3-211ENST00000534155 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.1
NSD3-211ENST00000534155 HMGXB3Q12766 1538 aa34.38■■■■□ 3.09
NSD3-211ENST00000534155 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.25■■■■□ 3.07
NSD3-211ENST00000534155 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
NSD3-211ENST00000534155 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.11■■■■□ 3.05
NSD3-211ENST00000534155 ERCC6Q03468 1493 aa33.98■■■■□ 3.03
NSD3-211ENST00000534155 CUX2O14529 1486 aa33.88■■■■□ 3.01
NSD3-211ENST00000534155 NESP48681 1621 aa33.82■■■■□ 3.01
NSD3-211ENST00000534155 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.77■■■■□ 3
NSD3-211ENST00000534155 WIZO95785 1651 aa33.71■■■□□ 2.99
NSD3-211ENST00000534155 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.57■■■□□ 2.96
NSD3-211ENST00000534155 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.54■■■□□ 2.96
NSD3-211ENST00000534155 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.54■■■□□ 2.96
NSD3-211ENST00000534155 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.49■■■□□ 2.95
NSD3-211ENST00000534155 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.47■■■□□ 2.95
NSD3-211ENST00000534155 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.44■■■□□ 2.94
NSD3-211ENST00000534155 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.38■■■□□ 2.93
NSD3-211ENST00000534155 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.23■■■□□ 2.91
NSD3-211ENST00000534155 CFTRP13569 1480 aa33.22■■■□□ 2.91
NSD3-211ENST00000534155 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.16■■■□□ 2.9
NSD3-211ENST00000534155 WDR62O43379 1518 aa33.15■■■□□ 2.9
NSD3-211ENST00000534155 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.12■■■□□ 2.89
NSD3-211ENST00000534155 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.96■■■□□ 2.87
NSD3-211ENST00000534155 PRDM2Q13029 1718 aa32.92■■■□□ 2.86
NSD3-211ENST00000534155 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.81■■■□□ 2.84
NSD3-211ENST00000534155 ABCC8Q09428 1581 aa32.58■■■□□ 2.81
NSD3-211ENST00000534155 TOPBP1Q92547 1522 aa32.53■■■□□ 2.8
NSD3-211ENST00000534155 IFT140Q96RY7 1462 aa32.51■■■□□ 2.79
NSD3-211ENST00000534155 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.46■■■□□ 2.79
NSD3-211ENST00000534155 OSCARQ8IYS5 282 aa32.35■■■□□ 2.77
NSD3-211ENST00000534155 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.32■■■□□ 2.76
NSD3-211ENST00000534155 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.22■■■□□ 2.75
NSD3-211ENST00000534155 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.21■■■□□ 2.75
NSD3-211ENST00000534155 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.75
NSD3-211ENST00000534155 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.75
NSD3-211ENST00000534155 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.09■■■□□ 2.73
NSD3-211ENST00000534155 SOGA1O94964 1423 aa32.09■■■□□ 2.73
NSD3-211ENST00000534155 CUX1P39880 1505 aa32.05■■■□□ 2.72
NSD3-211ENST00000534155 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.04■■■□□ 2.72
NSD3-211ENST00000534155 WDR97A6NE52 1622 aa32.04■■■□□ 2.72
NSD3-211ENST00000534155 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.03■■■□□ 2.72
NSD3-211ENST00000534155 TRIM41Q8WV44 630 aa32.02■■■□□ 2.72
NSD3-211ENST00000534155 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.93■■■□□ 2.7
NSD3-211ENST00000534155 CHD1O14646 1710 aa31.89■■■□□ 2.7
NSD3-211ENST00000534155 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.84■■■□□ 2.69
NSD3-211ENST00000534155 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.84■■■□□ 2.69
NSD3-211ENST00000534155 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.84■■■□□ 2.69
NSD3-211ENST00000534155 FBLN2P98095 1184 aa31.81■■■□□ 2.68
NSD3-211ENST00000534155 GRIN2BQ13224 1484 aa31.79■■■□□ 2.68
NSD3-211ENST00000534155 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.79■■■□□ 2.68
NSD3-211ENST00000534155 ARHGEF11O15085 1522 aa31.79■■■□□ 2.68
NSD3-211ENST00000534155 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.78■■■□□ 2.68
NSD3-211ENST00000534155 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.75■■■□□ 2.67
NSD3-211ENST00000534155 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.71■■■□□ 2.67
NSD3-211ENST00000534155 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.68■■■□□ 2.66
NSD3-211ENST00000534155 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.68■■■□□ 2.66
NSD3-211ENST00000534155 TOP2BQ02880 1626 aa31.67■■■□□ 2.66
NSD3-211ENST00000534155 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.67■■■□□ 2.66
NSD3-211ENST00000534155 SYNJ2O15056 1496 aa31.66■■■□□ 2.66
NSD3-211ENST00000534155 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.65■■■□□ 2.66
NSD3-211ENST00000534155 PBRM1Q86U86 1689 aa31.65■■■□□ 2.66
NSD3-211ENST00000534155 SYNJ1O43426 1573 aa31.62■■■□□ 2.65
NSD3-211ENST00000534155 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.58■■■□□ 2.65
NSD3-211ENST00000534155 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.5■■■□□ 2.63
NSD3-211ENST00000534155 ARAP1Q96P48 1450 aa31.47■■■□□ 2.63
NSD3-211ENST00000534155 ADAMTS12P58397 1594 aa31.39■■■□□ 2.61
NSD3-211ENST00000534155 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.38■■■□□ 2.61
NSD3-211ENST00000534155 GRIN2AQ12879 1464 aa31.37■■■□□ 2.61
NSD3-211ENST00000534155 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.34■■■□□ 2.61
NSD3-211ENST00000534155 NUP160Q12769 1436 aa31.27■■■□□ 2.6
NSD3-211ENST00000534155 CEP170Q5SW79 1584 aa31.21■■■□□ 2.59
NSD3-211ENST00000534155 SHROOM2Q13796 1616 aa31.1■■■□□ 2.57
NSD3-211ENST00000534155 KIF27Q86VH2 1401 aa31.07■■■□□ 2.57
NSD3-211ENST00000534155 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
NSD3-211ENST00000534155 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.01■■■□□ 2.56
NSD3-211ENST00000534155 IGF1RP08069 1367 aa30.99■■■□□ 2.55
NSD3-211ENST00000534155 CUL7Q14999 1698 aa30.98■■■□□ 2.55
NSD3-211ENST00000534155 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.93■■■□□ 2.54
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