RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534112.1

SSH3-211, Transcript of slingshot protein phosphatase 3, humanhuman

TSL 4

Gene SSH3, Length 544 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3-211ENST00000534112 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.73■■■■■ 6.19
SSH3-211ENST00000534112 ABCC9O60706 1549 aa48.57■■■■■ 5.37
SSH3-211ENST00000534112 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.17■■■■■ 5.3
SSH3-211ENST00000534112 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.05■■■■■ 4.96
SSH3-211ENST00000534112 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.89■■■■■ 4.94
SSH3-211ENST00000534112 NACADO15069 1562 aa45.7■■■■■ 4.91
SSH3-211ENST00000534112 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.59■■■■■ 4.89
SSH3-211ENST00000534112 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.27■■■■■ 4.84
SSH3-211ENST00000534112 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.01■■■■■ 4.8
SSH3-211ENST00000534112 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.87■■■■■ 4.77
SSH3-211ENST00000534112 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.73■■■■■ 4.75
SSH3-211ENST00000534112 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.45■■■■■ 4.71
SSH3-211ENST00000534112 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.34■■■■■ 4.69
SSH3-211ENST00000534112 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.1■■■■■ 4.65
SSH3-211ENST00000534112 SCRIBQ14160 1630 aa43.95■■■■■ 4.63
SSH3-211ENST00000534112 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.8■■■■■ 4.6
SSH3-211ENST00000534112 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.78■■■■■ 4.6
SSH3-211ENST00000534112 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.66■■■■■ 4.58
SSH3-211ENST00000534112 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.31■■■■■ 4.36
SSH3-211ENST00000534112 NCAPD3P42695 1498 aa42.27■■■■■ 4.36
SSH3-211ENST00000534112 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.09■■■■■ 4.33
SSH3-211ENST00000534112 ERCC6Q03468 1493 aa41.95■■■■■ 4.31
SSH3-211ENST00000534112 CUX2O14529 1486 aa41.93■■■■■ 4.3
SSH3-211ENST00000534112 SMARCA2P51531 1590 aa41.9■■■■■ 4.3
SSH3-211ENST00000534112 SMARCA4P51532 1647 aa41.89■■■■■ 4.3
SSH3-211ENST00000534112 HMGXB3Q12766 1538 aa41.84■■■■■ 4.29
SSH3-211ENST00000534112 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.68■■■■■ 4.26
SSH3-211ENST00000534112 NESP48681 1621 aa41.65■■■■■ 4.26
SSH3-211ENST00000534112 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
SSH3-211ENST00000534112 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.5■■■■■ 4.23
SSH3-211ENST00000534112 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.4■■■■■ 4.22
SSH3-211ENST00000534112 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.25■■■■■ 4.19
SSH3-211ENST00000534112 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
SSH3-211ENST00000534112 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.12■■■■■ 4.17
SSH3-211ENST00000534112 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.99■■■■■ 4.15
SSH3-211ENST00000534112 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.97■■■■■ 4.15
SSH3-211ENST00000534112 WIZO95785 1651 aa40.82■■■■■ 4.13
SSH3-211ENST00000534112 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.74■■■■■ 4.11
SSH3-211ENST00000534112 WDR62O43379 1518 aa40.62■■■■■ 4.09
SSH3-211ENST00000534112 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.52■■■■■ 4.08
SSH3-211ENST00000534112 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.5■■■■■ 4.07
SSH3-211ENST00000534112 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.48■■■■■ 4.07
SSH3-211ENST00000534112 CFTRP13569 1480 aa40.44■■■■■ 4.06
SSH3-211ENST00000534112 TRIM41Q8WV44 630 aa40.34■■■■■ 4.05
SSH3-211ENST00000534112 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.04
SSH3-211ENST00000534112 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.15■■■■■ 4.02
SSH3-211ENST00000534112 OSCARQ8IYS5 282 aa40.09■■■■■ 4.01
SSH3-211ENST00000534112 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.93■■■■□ 3.98
SSH3-211ENST00000534112 PRDM2Q13029 1718 aa39.77■■■■□ 3.96
SSH3-211ENST00000534112 IFT140Q96RY7 1462 aa39.75■■■■□ 3.95
SSH3-211ENST00000534112 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.72■■■■□ 3.95
SSH3-211ENST00000534112 TOPBP1Q92547 1522 aa39.67■■■■□ 3.94
SSH3-211ENST00000534112 ABCC8Q09428 1581 aa39.58■■■■□ 3.93
SSH3-211ENST00000534112 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.46■■■■□ 3.91
SSH3-211ENST00000534112 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.43■■■■□ 3.9
SSH3-211ENST00000534112 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.43■■■■□ 3.9
SSH3-211ENST00000534112 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.43■■■■□ 3.9
SSH3-211ENST00000534112 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.38■■■■□ 3.9
SSH3-211ENST00000534112 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.36■■■■□ 3.89
SSH3-211ENST00000534112 ARHGEF11O15085 1522 aa39.34■■■■□ 3.89
SSH3-211ENST00000534112 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.29■■■■□ 3.88
SSH3-211ENST00000534112 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.26■■■■□ 3.88
SSH3-211ENST00000534112 FBLN2P98095 1184 aa39.19■■■■□ 3.86
SSH3-211ENST00000534112 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.19■■■■□ 3.86
SSH3-211ENST00000534112 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.15■■■■□ 3.86
SSH3-211ENST00000534112 SOGA1O94964 1423 aa39.13■■■■□ 3.85
SSH3-211ENST00000534112 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.1■■■■□ 3.85
SSH3-211ENST00000534112 CHD1O14646 1710 aa39.09■■■■□ 3.85
SSH3-211ENST00000534112 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.97■■■■□ 3.83
SSH3-211ENST00000534112 ARAP1Q96P48 1450 aa38.95■■■■□ 3.83
SSH3-211ENST00000534112 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.9■■■■□ 3.82
SSH3-211ENST00000534112 CUX1P39880 1505 aa38.89■■■■□ 3.82
SSH3-211ENST00000534112 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.87■■■■□ 3.81
SSH3-211ENST00000534112 WDR97A6NE52 1622 aa38.84■■■■□ 3.81
SSH3-211ENST00000534112 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.81■■■■□ 3.8
SSH3-211ENST00000534112 GRIN2BQ13224 1484 aa38.78■■■■□ 3.8
SSH3-211ENST00000534112 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.78■■■■□ 3.8
SSH3-211ENST00000534112 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.72■■■■□ 3.79
SSH3-211ENST00000534112 SYNJ2O15056 1496 aa38.67■■■■□ 3.78
SSH3-211ENST00000534112 SYNJ1O43426 1573 aa38.67■■■■□ 3.78
SSH3-211ENST00000534112 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.61■■■■□ 3.77
SSH3-211ENST00000534112 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.59■■■■□ 3.77
SSH3-211ENST00000534112 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.53■■■■□ 3.76
SSH3-211ENST00000534112 PBRM1Q86U86 1689 aa38.44■■■■□ 3.74
SSH3-211ENST00000534112 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.41■■■■□ 3.74
SSH3-211ENST00000534112 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.37■■■■□ 3.73
SSH3-211ENST00000534112 GRIN2AQ12879 1464 aa38.26■■■■□ 3.72
SSH3-211ENST00000534112 NUP160Q12769 1436 aa38.17■■■■□ 3.7
SSH3-211ENST00000534112 TOP2BQ02880 1626 aa38.16■■■■□ 3.7
SSH3-211ENST00000534112 ADAMTS12P58397 1594 aa38.14■■■■□ 3.7
SSH3-211ENST00000534112 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.12■■■■□ 3.69
SSH3-211ENST00000534112 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.12■■■■□ 3.69
SSH3-211ENST00000534112 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.12■■■■□ 3.69
SSH3-211ENST00000534112 CEP170Q5SW79 1584 aa38.1■■■■□ 3.69
SSH3-211ENST00000534112 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.01■■■■□ 3.67
SSH3-211ENST00000534112 SHROOM2Q13796 1616 aa37.93■■■■□ 3.66
SSH3-211ENST00000534112 JPH4Q96JJ6 628 aa37.86■■■■□ 3.65
SSH3-211ENST00000534112 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP37.84■■■■□ 3.65
SSH3-211ENST00000534112 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.84■■■■□ 3.65
SSH3-211ENST00000534112 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.6■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms