RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533998.5

FNTA-214, Transcript of farnesyltransferase, CAAX box, alpha, humanhuman

TSL 3

Gene FNTA, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTA-214ENST00000533998 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.18■■■■■ 7.54
FNTA-214ENST00000533998 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.44■■■■■ 6.47
FNTA-214ENST00000533998 ABCC9O60706 1549 aa54.56■■■■■ 6.32
FNTA-214ENST00000533998 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.36■■■■■ 5.97
FNTA-214ENST00000533998 NACADO15069 1562 aa52.21■■■■■ 5.95
FNTA-214ENST00000533998 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.11■■■■■ 5.93
FNTA-214ENST00000533998 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.81■■■■■ 5.88
FNTA-214ENST00000533998 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.7■■■■■ 5.87
FNTA-214ENST00000533998 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.44■■■■■ 5.83
FNTA-214ENST00000533998 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.2■■■■■ 5.79
FNTA-214ENST00000533998 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.95■■■■■ 5.75
FNTA-214ENST00000533998 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.78■■■■■ 5.72
FNTA-214ENST00000533998 SCRIBQ14160 1630 aa50.51■■■■■ 5.68
FNTA-214ENST00000533998 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.46■■■■■ 5.67
FNTA-214ENST00000533998 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.22■■■■■ 5.63
FNTA-214ENST00000533998 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.46■■■■■ 5.51
FNTA-214ENST00000533998 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.37■■■■■ 5.49
FNTA-214ENST00000533998 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.08■■■■■ 5.45
FNTA-214ENST00000533998 SMARCA4P51532 1647 aa48.32■■■■■ 5.33
FNTA-214ENST00000533998 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.22■■■■■ 5.31
FNTA-214ENST00000533998 NCAPD3P42695 1498 aa48.2■■■■■ 5.31
FNTA-214ENST00000533998 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.16■■■■■ 5.3
FNTA-214ENST00000533998 SMARCA2P51531 1590 aa48.08■■■■■ 5.29
FNTA-214ENST00000533998 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.91■■■■■ 5.26
FNTA-214ENST00000533998 HMGXB3Q12766 1538 aa47.91■■■■■ 5.26
FNTA-214ENST00000533998 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.87■■■■■ 5.25
FNTA-214ENST00000533998 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.72■■■■■ 5.23
FNTA-214ENST00000533998 WIZO95785 1651 aa47.38■■■■■ 5.18
FNTA-214ENST00000533998 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.24■■■■■ 5.15
FNTA-214ENST00000533998 NESP48681 1621 aa47.12■■■■■ 5.13
FNTA-214ENST00000533998 ERCC6Q03468 1493 aa47.06■■■■■ 5.12
FNTA-214ENST00000533998 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.98■■■■■ 5.11
FNTA-214ENST00000533998 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.84■■■■■ 5.09
FNTA-214ENST00000533998 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.77■■■■■ 5.08
FNTA-214ENST00000533998 CUX2O14529 1486 aa46.71■■■■■ 5.07
FNTA-214ENST00000533998 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.68■■■■■ 5.06
FNTA-214ENST00000533998 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.56■■■■■ 5.04
FNTA-214ENST00000533998 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.47■■■■■ 5.03
FNTA-214ENST00000533998 CFTRP13569 1480 aa46.41■■■■■ 5.02
FNTA-214ENST00000533998 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.31■■■■■ 5
FNTA-214ENST00000533998 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.21■■■■■ 4.99
FNTA-214ENST00000533998 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.19■■■■■ 4.98
FNTA-214ENST00000533998 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.19■■■■■ 4.98
FNTA-214ENST00000533998 WDR62O43379 1518 aa46.05■■■■■ 4.96
FNTA-214ENST00000533998 PRDM2Q13029 1718 aa46.05■■■■■ 4.96
FNTA-214ENST00000533998 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.77■■■■■ 4.92
FNTA-214ENST00000533998 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.77■■■■■ 4.92
FNTA-214ENST00000533998 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.75■■■■■ 4.91
FNTA-214ENST00000533998 ABCC8Q09428 1581 aa45.45■■■■■ 4.87
FNTA-214ENST00000533998 TOPBP1Q92547 1522 aa45.44■■■■■ 4.86
FNTA-214ENST00000533998 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.35■■■■■ 4.85
FNTA-214ENST00000533998 IFT140Q96RY7 1462 aa45.24■■■■■ 4.83
FNTA-214ENST00000533998 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.06■■■■■ 4.8
FNTA-214ENST00000533998 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.02■■■■■ 4.8
FNTA-214ENST00000533998 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.97■■■■■ 4.79
FNTA-214ENST00000533998 CUX1P39880 1505 aa44.96■■■■■ 4.79
FNTA-214ENST00000533998 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.85■■■■■ 4.77
FNTA-214ENST00000533998 SOGA1O94964 1423 aa44.85■■■■■ 4.77
FNTA-214ENST00000533998 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.85■■■■■ 4.77
FNTA-214ENST00000533998 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.84■■■■■ 4.77
FNTA-214ENST00000533998 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.78■■■■■ 4.769e-7■■■□□ 18.2
FNTA-214ENST00000533998 OSCARQ8IYS5 282 aa44.76■■■■■ 4.76
FNTA-214ENST00000533998 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.64■■■■■ 4.74
FNTA-214ENST00000533998 WDR97A6NE52 1622 aa44.61■■■■■ 4.73
FNTA-214ENST00000533998 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.54■■■■■ 4.72
FNTA-214ENST00000533998 TOP2BQ02880 1626 aa44.49■■■■■ 4.71
FNTA-214ENST00000533998 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.49■■■■■ 4.71
FNTA-214ENST00000533998 SYNJ1O43426 1573 aa44.43■■■■■ 4.7
FNTA-214ENST00000533998 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.43■■■■■ 4.7
FNTA-214ENST00000533998 CHD1O14646 1710 aa44.38■■■■■ 4.7
FNTA-214ENST00000533998 GRIN2BQ13224 1484 aa44.36■■■■■ 4.69
FNTA-214ENST00000533998 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.33■■■■■ 4.69
FNTA-214ENST00000533998 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.33■■■■■ 4.69
FNTA-214ENST00000533998 FBLN2P98095 1184 aa44.32■■■■■ 4.69
FNTA-214ENST00000533998 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.28■■■■■ 4.68
FNTA-214ENST00000533998 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.26■■■■■ 4.68
FNTA-214ENST00000533998 PBRM1Q86U86 1689 aa44.24■■■■■ 4.67
FNTA-214ENST00000533998 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.16■■■■■ 4.66
FNTA-214ENST00000533998 SYNJ2O15056 1496 aa44.11■■■■■ 4.65
FNTA-214ENST00000533998 TRIM41Q8WV44 630 aa44.04■■■■■ 4.64
FNTA-214ENST00000533998 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.03■■■■■ 4.64
FNTA-214ENST00000533998 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.03■■■■■ 4.64
FNTA-214ENST00000533998 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.03■■■■■ 4.64
FNTA-214ENST00000533998 ARHGEF11O15085 1522 aa43.98■■■■■ 4.63
FNTA-214ENST00000533998 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.89■■■■■ 4.62
FNTA-214ENST00000533998 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.89■■■■■ 4.62
FNTA-214ENST00000533998 ADAMTS12P58397 1594 aa43.85■■■■■ 4.61
FNTA-214ENST00000533998 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.8■■■■■ 4.6
FNTA-214ENST00000533998 GRIN2AQ12879 1464 aa43.78■■■■■ 4.6
FNTA-214ENST00000533998 KIF27Q86VH2 1401 aa43.65■■■■■ 4.58
FNTA-214ENST00000533998 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.62■■■■■ 4.57
FNTA-214ENST00000533998 NUP160Q12769 1436 aa43.61■■■■■ 4.57
FNTA-214ENST00000533998 ARAP1Q96P48 1450 aa43.59■■■■■ 4.57
FNTA-214ENST00000533998 CEP170Q5SW79 1584 aa43.57■■■■■ 4.57
FNTA-214ENST00000533998 IGF1RP08069 1367 aa43.54■■■■■ 4.56
FNTA-214ENST00000533998 CUL7Q14999 1698 aa43.41■■■■■ 4.54
FNTA-214ENST00000533998 SHROOM2Q13796 1616 aa43.33■■■■■ 4.53
FNTA-214ENST00000533998 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.27■■■■■ 4.52
FNTA-214ENST00000533998 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.24■■■■■ 4.51
FNTA-214ENST00000533998 JPH4Q96JJ6 628 aa43.21■■■■■ 4.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms