RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533851.5

SAAL1-214, Transcript of serum amyloid A like 1, humanhuman

TSL 2

Gene SAAL1, Length 804 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAAL1-214ENST00000533851 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.62■■■■■ 4.41
SAAL1-214ENST00000533851 ABCC9O60706 1549 aa38.14■■■■□ 3.7
SAAL1-214ENST00000533851 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.12■■■■□ 3.69
SAAL1-214ENST00000533851 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.27■■■■□ 3.4
SAAL1-214ENST00000533851 NACADO15069 1562 aa36.08■■■■□ 3.37
SAAL1-214ENST00000533851 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.94■■■■□ 3.34
SAAL1-214ENST00000533851 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.92■■■■□ 3.34
SAAL1-214ENST00000533851 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.65■■■■□ 3.3
SAAL1-214ENST00000533851 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.59■■■■□ 3.29
SAAL1-214ENST00000533851 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.49■■■■□ 3.27
SAAL1-214ENST00000533851 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.32■■■■□ 3.24
SAAL1-214ENST00000533851 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
SAAL1-214ENST00000533851 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.2■■■■□ 3.23
SAAL1-214ENST00000533851 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.75■■■■□ 3.15
SAAL1-214ENST00000533851 SCRIBQ14160 1630 aa34.74■■■■□ 3.15
SAAL1-214ENST00000533851 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.46■■■■□ 3.11
SAAL1-214ENST00000533851 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.4■■■■□ 3.1
SAAL1-214ENST00000533851 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.35■■■■□ 3.09
SAAL1-214ENST00000533851 NCAPD3P42695 1498 aa33.38■■■□□ 2.93
SAAL1-214ENST00000533851 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.27■■■□□ 2.92
SAAL1-214ENST00000533851 SMARCA4P51532 1647 aa33.18■■■□□ 2.9
SAAL1-214ENST00000533851 SMARCA2P51531 1590 aa33.09■■■□□ 2.89
SAAL1-214ENST00000533851 HMGXB3Q12766 1538 aa33.04■■■□□ 2.88
SAAL1-214ENST00000533851 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.01■■■□□ 2.88
SAAL1-214ENST00000533851 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.9■■■□□ 2.86
SAAL1-214ENST00000533851 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.89■■■□□ 2.86
SAAL1-214ENST00000533851 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.86■■■□□ 2.85
SAAL1-214ENST00000533851 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.85■■■□□ 2.85
SAAL1-214ENST00000533851 ERCC6Q03468 1493 aa32.85■■■□□ 2.85
SAAL1-214ENST00000533851 CUX2O14529 1486 aa32.83■■■□□ 2.85
SAAL1-214ENST00000533851 NESP48681 1621 aa32.81■■■□□ 2.84
SAAL1-214ENST00000533851 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.53■■■□□ 2.8
SAAL1-214ENST00000533851 WIZO95785 1651 aa32.43■■■□□ 2.78
SAAL1-214ENST00000533851 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.41■■■□□ 2.78
SAAL1-214ENST00000533851 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.36■■■□□ 2.77
SAAL1-214ENST00000533851 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.36■■■□□ 2.77
SAAL1-214ENST00000533851 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.31■■■□□ 2.76
SAAL1-214ENST00000533851 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.21■■■□□ 2.75
SAAL1-214ENST00000533851 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.06■■■□□ 2.72
SAAL1-214ENST00000533851 WDR62O43379 1518 aa32■■■□□ 2.71
SAAL1-214ENST00000533851 CFTRP13569 1480 aa31.99■■■□□ 2.71
SAAL1-214ENST00000533851 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.98■■■□□ 2.71
SAAL1-214ENST00000533851 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.93■■■□□ 2.7
SAAL1-214ENST00000533851 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.92■■■□□ 2.7
SAAL1-214ENST00000533851 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.71■■■□□ 2.67
SAAL1-214ENST00000533851 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.7■■■□□ 2.66
SAAL1-214ENST00000533851 PRDM2Q13029 1718 aa31.55■■■□□ 2.64
SAAL1-214ENST00000533851 OSCARQ8IYS5 282 aa31.42■■■□□ 2.62
SAAL1-214ENST00000533851 TOPBP1Q92547 1522 aa31.35■■■□□ 2.61
SAAL1-214ENST00000533851 TRIM41Q8WV44 630 aa31.35■■■□□ 2.61
SAAL1-214ENST00000533851 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.32■■■□□ 2.6
SAAL1-214ENST00000533851 IFT140Q96RY7 1462 aa31.32■■■□□ 2.6
SAAL1-214ENST00000533851 ABCC8Q09428 1581 aa31.26■■■□□ 2.6
SAAL1-214ENST00000533851 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.2■■■□□ 2.58
SAAL1-214ENST00000533851 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
SAAL1-214ENST00000533851 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.05■■■□□ 2.564e-8■■□□□ 13.7
SAAL1-214ENST00000533851 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
SAAL1-214ENST00000533851 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.03■■■□□ 2.56
SAAL1-214ENST00000533851 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.95■■■□□ 2.55
SAAL1-214ENST00000533851 SOGA1O94964 1423 aa30.92■■■□□ 2.54
SAAL1-214ENST00000533851 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.92■■■□□ 2.54
SAAL1-214ENST00000533851 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.92■■■□□ 2.54
SAAL1-214ENST00000533851 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.92■■■□□ 2.54
SAAL1-214ENST00000533851 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
SAAL1-214ENST00000533851 ARHGEF11O15085 1522 aa30.84■■■□□ 2.53
SAAL1-214ENST00000533851 CUX1P39880 1505 aa30.84■■■□□ 2.53
SAAL1-214ENST00000533851 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.83■■■□□ 2.53
SAAL1-214ENST00000533851 CHD1O14646 1710 aa30.81■■■□□ 2.52
SAAL1-214ENST00000533851 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
SAAL1-214ENST00000533851 FBLN2P98095 1184 aa30.78■■■□□ 2.52
SAAL1-214ENST00000533851 WDR97A6NE52 1622 aa30.69■■■□□ 2.5
SAAL1-214ENST00000533851 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.68■■■□□ 2.5
SAAL1-214ENST00000533851 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.66■■■□□ 2.5
SAAL1-214ENST00000533851 GRIN2BQ13224 1484 aa30.6■■■□□ 2.49
SAAL1-214ENST00000533851 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
SAAL1-214ENST00000533851 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
SAAL1-214ENST00000533851 ARAP1Q96P48 1450 aa30.57■■■□□ 2.48
SAAL1-214ENST00000533851 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.52■■■□□ 2.48
SAAL1-214ENST00000533851 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.51■■■□□ 2.48
SAAL1-214ENST00000533851 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.51■■■□□ 2.47
SAAL1-214ENST00000533851 SYNJ2O15056 1496 aa30.5■■■□□ 2.47
SAAL1-214ENST00000533851 SYNJ1O43426 1573 aa30.43■■■□□ 2.46
SAAL1-214ENST00000533851 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.42■■■□□ 2.46
SAAL1-214ENST00000533851 PBRM1Q86U86 1689 aa30.42■■■□□ 2.46
SAAL1-214ENST00000533851 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.37■■■□□ 2.45
SAAL1-214ENST00000533851 TOP2BQ02880 1626 aa30.33■■■□□ 2.45
SAAL1-214ENST00000533851 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.32■■■□□ 2.44
SAAL1-214ENST00000533851 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
SAAL1-214ENST00000533851 GRIN2AQ12879 1464 aa30.2■■■□□ 2.43
SAAL1-214ENST00000533851 ADAMTS12P58397 1594 aa30.15■■■□□ 2.42
SAAL1-214ENST00000533851 NUP160Q12769 1436 aa30.14■■■□□ 2.42
SAAL1-214ENST00000533851 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.13■■■□□ 2.41
SAAL1-214ENST00000533851 CEP170Q5SW79 1584 aa30.11■■■□□ 2.41
SAAL1-214ENST00000533851 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.09■■■□□ 2.41
SAAL1-214ENST00000533851 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.08■■■□□ 2.41
SAAL1-214ENST00000533851 SHROOM2Q13796 1616 aa29.97■■■□□ 2.39
SAAL1-214ENST00000533851 JPH4Q96JJ6 628 aa29.89■■■□□ 2.38
SAAL1-214ENST00000533851 IGF1RP08069 1367 aa29.84■■■□□ 2.37
SAAL1-214ENST00000533851 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
SAAL1-214ENST00000533851 KIF27Q86VH2 1401 aa29.73■■■□□ 2.35
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