RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533768.5

PDE4DIP-232, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4DIP, Length 635 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIP-232ENST00000533768 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.29■■■□□ 2.28
PDE4DIP-232ENST00000533768 ABCC9O60706 1549 aa27.36■■□□□ 1.97
PDE4DIP-232ENST00000533768 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.68■■□□□ 1.86
PDE4DIP-232ENST00000533768 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.38■■□□□ 1.81
PDE4DIP-232ENST00000533768 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.74■■□□□ 1.71
PDE4DIP-232ENST00000533768 NACADO15069 1562 aa25.38■■□□□ 1.65
PDE4DIP-232ENST00000533768 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.33■■□□□ 1.65
PDE4DIP-232ENST00000533768 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.27■■□□□ 1.64
PDE4DIP-232ENST00000533768 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.04■■□□□ 1.6
PDE4DIP-232ENST00000533768 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25■■□□□ 1.59
PDE4DIP-232ENST00000533768 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.81■■□□□ 1.56
PDE4DIP-232ENST00000533768 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.77■■□□□ 1.56
PDE4DIP-232ENST00000533768 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.74■■□□□ 1.55
PDE4DIP-232ENST00000533768 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.73■■□□□ 1.55
PDE4DIP-232ENST00000533768 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.59■■□□□ 1.53
PDE4DIP-232ENST00000533768 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
PDE4DIP-232ENST00000533768 SCRIBQ14160 1630 aa24.2■■□□□ 1.46
PDE4DIP-232ENST00000533768 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.16■■□□□ 1.46
PDE4DIP-232ENST00000533768 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
PDE4DIP-232ENST00000533768 CUX2O14529 1486 aa23.94■■□□□ 1.42
PDE4DIP-232ENST00000533768 ERCC6Q03468 1493 aa23.67■■□□□ 1.38
PDE4DIP-232ENST00000533768 NCAPD3P42695 1498 aa23.42■■□□□ 1.34
PDE4DIP-232ENST00000533768 TRIM41Q8WV44 630 aa23.35■■□□□ 1.33
PDE4DIP-232ENST00000533768 NESP48681 1621 aa23.3■■□□□ 1.32
PDE4DIP-232ENST00000533768 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
PDE4DIP-232ENST00000533768 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.23■■□□□ 1.31
PDE4DIP-232ENST00000533768 HMGXB3Q12766 1538 aa23.18■■□□□ 1.3
PDE4DIP-232ENST00000533768 SMARCA2P51531 1590 aa23.14■■□□□ 1.29
PDE4DIP-232ENST00000533768 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.05■■□□□ 1.28
PDE4DIP-232ENST00000533768 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.04■■□□□ 1.28
PDE4DIP-232ENST00000533768 SMARCA4P51532 1647 aa23.04■■□□□ 1.28
PDE4DIP-232ENST00000533768 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PDE4DIP-232ENST00000533768 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.9■■□□□ 1.26
PDE4DIP-232ENST00000533768 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.83■■□□□ 1.25
PDE4DIP-232ENST00000533768 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PDE4DIP-232ENST00000533768 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.74■■□□□ 1.23
PDE4DIP-232ENST00000533768 WDR62O43379 1518 aa22.74■■□□□ 1.23
PDE4DIP-232ENST00000533768 OSCARQ8IYS5 282 aa22.69■■□□□ 1.22
PDE4DIP-232ENST00000533768 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.65■■□□□ 1.22
PDE4DIP-232ENST00000533768 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.55■■□□□ 1.2
PDE4DIP-232ENST00000533768 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.53■■□□□ 1.2
PDE4DIP-232ENST00000533768 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.53■■□□□ 1.2
PDE4DIP-232ENST00000533768 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.53■■□□□ 1.2
PDE4DIP-232ENST00000533768 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.49■■□□□ 1.19
PDE4DIP-232ENST00000533768 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.4■■□□□ 1.18
PDE4DIP-232ENST00000533768 ARHGEF11O15085 1522 aa22.34■■□□□ 1.17
PDE4DIP-232ENST00000533768 WIZO95785 1651 aa22.28■■□□□ 1.16
PDE4DIP-232ENST00000533768 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PDE4DIP-232ENST00000533768 CFTRP13569 1480 aa22.24■■□□□ 1.15
PDE4DIP-232ENST00000533768 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PDE4DIP-232ENST00000533768 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.2■■□□□ 1.14
PDE4DIP-232ENST00000533768 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PDE4DIP-232ENST00000533768 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PDE4DIP-232ENST00000533768 PRDM2Q13029 1718 aa22.08■■□□□ 1.12
PDE4DIP-232ENST00000533768 IFT140Q96RY7 1462 aa22.08■■□□□ 1.12
PDE4DIP-232ENST00000533768 ARAP1Q96P48 1450 aa22.06■■□□□ 1.12
PDE4DIP-232ENST00000533768 CHD1O14646 1710 aa22.03■■□□□ 1.12
PDE4DIP-232ENST00000533768 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PDE4DIP-232ENST00000533768 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PDE4DIP-232ENST00000533768 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PDE4DIP-232ENST00000533768 TOPBP1Q92547 1522 aa21.9■■□□□ 1.1
PDE4DIP-232ENST00000533768 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.08
PDE4DIP-232ENST00000533768 ABCC8Q09428 1581 aa21.82■■□□□ 1.08
PDE4DIP-232ENST00000533768 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PDE4DIP-232ENST00000533768 FBLN2P98095 1184 aa21.8■■□□□ 1.08
PDE4DIP-232ENST00000533768 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.76■■□□□ 1.07
PDE4DIP-232ENST00000533768 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.7■■□□□ 1.07
PDE4DIP-232ENST00000533768 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.66■■□□□ 1.06
PDE4DIP-232ENST00000533768 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 SYNJ1O43426 1573 aa21.61■■□□□ 1.05
PDE4DIP-232ENST00000533768 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.56■■□□□ 1.04
PDE4DIP-232ENST00000533768 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.55■■□□□ 1.04
PDE4DIP-232ENST00000533768 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PDE4DIP-232ENST00000533768 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PDE4DIP-232ENST00000533768 WDR97A6NE52 1622 aa21.52■■□□□ 1.04
PDE4DIP-232ENST00000533768 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.51■■□□□ 1.03
PDE4DIP-232ENST00000533768 SOGA1O94964 1423 aa21.49■■□□□ 1.03
PDE4DIP-232ENST00000533768 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PDE4DIP-232ENST00000533768 SYNJ2O15056 1496 aa21.43■■□□□ 1.02
PDE4DIP-232ENST00000533768 GRIN2BQ13224 1484 aa21.4■■□□□ 1.02
PDE4DIP-232ENST00000533768 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.37■■□□□ 1.01
PDE4DIP-232ENST00000533768 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.36■■□□□ 1.01
PDE4DIP-232ENST00000533768 PBRM1Q86U86 1689 aa21.34■■□□□ 1.01
PDE4DIP-232ENST00000533768 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
PDE4DIP-232ENST00000533768 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.3■■□□□ 1
PDE4DIP-232ENST00000533768 CUX1P39880 1505 aa21.23■□□□□ 0.99
PDE4DIP-232ENST00000533768 CEP170Q5SW79 1584 aa21.19■□□□□ 0.98
PDE4DIP-232ENST00000533768 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.15■□□□□ 0.98
PDE4DIP-232ENST00000533768 SHROOM2Q13796 1616 aa21.14■□□□□ 0.97
PDE4DIP-232ENST00000533768 GRIN2AQ12879 1464 aa21.13■□□□□ 0.97
PDE4DIP-232ENST00000533768 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.13■□□□□ 0.97
PDE4DIP-232ENST00000533768 NUP160Q12769 1436 aa21.1■□□□□ 0.97
PDE4DIP-232ENST00000533768 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.09■□□□□ 0.97
PDE4DIP-232ENST00000533768 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.05■□□□□ 0.96
PDE4DIP-232ENST00000533768 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.04■□□□□ 0.96
PDE4DIP-232ENST00000533768 ADAMTS12P58397 1594 aa21.03■□□□□ 0.96
PDE4DIP-232ENST00000533768 KDM6BO15054 1643 aa21.02■□□□□ 0.96
PDE4DIP-232ENST00000533768 DIP2BQ9P265 1576 aa20.99■□□□□ 0.95
PDE4DIP-232ENST00000533768 MAPKBP1O60336 1514 aa20.97■□□□□ 0.95
PDE4DIP-232ENST00000533768 TSPOAP1O95153 1857 aa20.95■□□□□ 0.94
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